MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 plasmid 5

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014302	TGAT	2	8	169	176	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014302	ATTA	2	8	378	385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014302	TCTA	2	8	389	396	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_014302	CTGA	2	8	415	422	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014302	GTCT	2	8	754	761	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014302	GTAT	2	8	832	839	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014302	AGCA	2	8	1375	1382	50 %	0 %	25 %	25 %	299883475
8	NC_014302	TCGG	2	8	1935	1942	0 %	25 %	50 %	25 %	299883476
9	NC_014302	CATC	2	8	2004	2011	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_014302	GAAC	2	8	2056	2063	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_014302	AAGA	2	8	2075	2082	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014302	GTCG	2	8	2382	2389	0 %	25 %	50 %	25 %	299883477
13	NC_014302	AAAG	2	8	2801	2808	75 %	0 %	25 %	0 %	299883477
14	NC_014302	ATTA	2	8	2839	2846	50 %	50 %	0 %	0 %	299883477
15	NC_014302	AAGA	2	8	2973	2980	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014302	AGTA	2	8	3347	3354	50 %	25 %	25 %	0 %	299883478
17	NC_014302	ATTG	2	8	3952	3959	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014302	GAAG	2	8	4351	4358	50 %	0 %	50 %	0 %	299883479
19	NC_014302	GACG	2	8	4384	4391	25 %	0 %	50 %	25 %	299883479
20	NC_014302	TACC	2	8	5551	5558	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_014302	ACGA	2	8	5652	5659	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014302	GTCG	2	8	6123	6130	0 %	25 %	50 %	25 %	299883480
23	NC_014302	CCAG	2	8	6809	6816	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
24	NC_014302	AATC	2	8	7331	7338	50 %	25 %	0 %	25 %	299883481
25	NC_014302	TCTT	2	8	7513	7520	0 %	75 %	0 %	25 %	299883481
26	NC_014302	TGGT	2	8	7840	7847	0 %	50 %	50 %	0 %	299883481
27	NC_014302	GTTG	2	8	8149	8156	0 %	50 %	50 %	0 %	299883481
28	NC_014302	GTTT	2	8	8726	8733	0 %	75 %	25 %	0 %	299883481
29	NC_014302	TCAT	2	8	9615	9622	25 %	50 %	0 %	25 %	299883484
30	NC_014302	GTGA	2	8	9675	9682	25 %	25 %	50 %	0 %	299883484
31	NC_014302	CTGT	2	8	10228	10235	0 %	50 %	25 %	25 %	299883484
32	NC_014302	CGGA	2	8	10796	10803	25 %	0 %	50 %	25 %	299883484
33	NC_014302	TGAT	3	12	11030	11041	25 %	50 %	25 %	0 %	299883484
34	NC_014302	ATGC	2	8	11245	11252	25 %	25 %	25 %	25 %	299883484
35	NC_014302	TCGT	2	8	12192	12199	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014302	CCCG	2	8	12845	12852	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
37	NC_014302	GTTT	2	8	12872	12879	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014302	TCTA	2	8	12893	12900	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_014302	TAGT	2	8	13202	13209	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014302	GAGT	2	8	13265	13272	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014302	TTTC	2	8	13328	13335	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_014302	GCTA	2	8	13481	13488	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014302	AAGA	2	8	13558	13565	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014302	TCAT	2	8	14383	14390	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_014302	TCAG	2	8	14467	14474	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_014302	GCCA	2	8	15282	15289	25 %	0 %	25 %	50 %	299883487
47	NC_014302	CTAC	2	8	15982	15989	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_014302	CTGT	2	8	16104	16111	0 %	50 %	25 %	25 %	299883488
49	NC_014302	ATTG	2	8	16680	16687	25 %	50 %	25 %	0 %	299883489
50	NC_014302	ACCA	2	8	16908	16915	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_014302	GGAC	2	8	17040	17047	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014302	GGTC	2	8	17363	17370	0 %	25 %	50 %	25 %	299883490
53	NC_014302	TTTC	2	8	17545	17552	0 %	75 %	0 %	25 %	299883490
54	NC_014302	CGAC	2	8	17568	17575	25 %	0 %	25 %	50 %	299883490
55	NC_014302	GAGG	2	8	18727	18734	25 %	0 %	75 %	0 %	299883492
56	NC_014302	ATCA	2	8	18780	18787	50 %	25 %	0 %	25 %	299883492
57	NC_014302	TCCA	2	8	18953	18960	25 %	25 %	0 %	50 %	299883492
58	NC_014302	CGAA	2	8	18979	18986	50 %	0 %	25 %	25 %	299883492
59	NC_014302	ACTA	2	8	19951	19958	50 %	25 %	0 %	25 %	299883493
60	NC_014302	TGAT	2	8	20720	20727	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014302	TCAT	2	8	20731	20738	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_014302	TGCT	2	8	21374	21381	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_014302	TTGT	2	8	22292	22299	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014302	AATC	2	8	22582	22589	50 %	25 %	0 %	25 %	299883497
65	NC_014302	GATT	2	8	22641	22648	25 %	50 %	25 %	0 %	299883497
66	NC_014302	GCCT	2	8	22698	22705	0 %	25 %	25 %	50 %	299883497
67	NC_014302	GATG	2	8	22754	22761	25 %	25 %	50 %	0 %	299883497
68	NC_014302	GTAA	2	8	23700	23707	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.