MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 plasmid 5

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014302	TGAT	2	8	169	176	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014302	ATTA	2	8	378	385	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014302	TCTA	2	8	389	396	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_014302	CTGA	2	8	415	422	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014302	GTCT	2	8	754	761	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014302	GTAT	2	8	832	839	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014302	CATC	2	8	2004	2011	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_014302	GAAC	2	8	2056	2063	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_014302	AAGA	2	8	2075	2082	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014302	AAGA	2	8	2973	2980	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014302	ATTG	2	8	3952	3959	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014302	TACC	2	8	5551	5558	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_014302	ACGA	2	8	5652	5659	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_014302	CCAG	2	8	6809	6816	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15	NC_014302	TCGT	2	8	12192	12199	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014302	CCCG	2	8	12845	12852	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
17	NC_014302	GTTT	2	8	12872	12879	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014302	TCTA	2	8	12893	12900	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014302	TAGT	2	8	13202	13209	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014302	GAGT	2	8	13265	13272	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014302	TTTC	2	8	13328	13335	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014302	GCTA	2	8	13481	13488	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014302	AAGA	2	8	13558	13565	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014302	TCAT	2	8	14383	14390	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_014302	TCAG	2	8	14467	14474	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
26	NC_014302	CTAC	2	8	15982	15989	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_014302	ACCA	2	8	16908	16915	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_014302	GGAC	2	8	17040	17047	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_014302	TGAT	2	8	20720	20727	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014302	TCAT	2	8	20731	20738	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014302	TGCT	2	8	21374	21381	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_014302	TTGT	2	8	22292	22299	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014302	GTAA	2	8	23700	23707	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.