MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 plasmid 5

Total Repeats: 35

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014302	AGCA	2	8	1375	1382	50 %	0 %	25 %	25 %	299883475
2	NC_014302	TCGG	2	8	1935	1942	0 %	25 %	50 %	25 %	299883476
3	NC_014302	GTCG	2	8	2382	2389	0 %	25 %	50 %	25 %	299883477
4	NC_014302	AAAG	2	8	2801	2808	75 %	0 %	25 %	0 %	299883477
5	NC_014302	ATTA	2	8	2839	2846	50 %	50 %	0 %	0 %	299883477
6	NC_014302	AGTA	2	8	3347	3354	50 %	25 %	25 %	0 %	299883478
7	NC_014302	GAAG	2	8	4351	4358	50 %	0 %	50 %	0 %	299883479
8	NC_014302	GACG	2	8	4384	4391	25 %	0 %	50 %	25 %	299883479
9	NC_014302	GTCG	2	8	6123	6130	0 %	25 %	50 %	25 %	299883480
10	NC_014302	AATC	2	8	7331	7338	50 %	25 %	0 %	25 %	299883481
11	NC_014302	TCTT	2	8	7513	7520	0 %	75 %	0 %	25 %	299883481
12	NC_014302	TGGT	2	8	7840	7847	0 %	50 %	50 %	0 %	299883481
13	NC_014302	GTTG	2	8	8149	8156	0 %	50 %	50 %	0 %	299883481
14	NC_014302	GTTT	2	8	8726	8733	0 %	75 %	25 %	0 %	299883481
15	NC_014302	TCAT	2	8	9615	9622	25 %	50 %	0 %	25 %	299883484
16	NC_014302	GTGA	2	8	9675	9682	25 %	25 %	50 %	0 %	299883484
17	NC_014302	CTGT	2	8	10228	10235	0 %	50 %	25 %	25 %	299883484
18	NC_014302	CGGA	2	8	10796	10803	25 %	0 %	50 %	25 %	299883484
19	NC_014302	TGAT	3	12	11030	11041	25 %	50 %	25 %	0 %	299883484
20	NC_014302	ATGC	2	8	11245	11252	25 %	25 %	25 %	25 %	299883484
21	NC_014302	GCCA	2	8	15282	15289	25 %	0 %	25 %	50 %	299883487
22	NC_014302	CTGT	2	8	16104	16111	0 %	50 %	25 %	25 %	299883488
23	NC_014302	ATTG	2	8	16680	16687	25 %	50 %	25 %	0 %	299883489
24	NC_014302	GGTC	2	8	17363	17370	0 %	25 %	50 %	25 %	299883490
25	NC_014302	TTTC	2	8	17545	17552	0 %	75 %	0 %	25 %	299883490
26	NC_014302	CGAC	2	8	17568	17575	25 %	0 %	25 %	50 %	299883490
27	NC_014302	GAGG	2	8	18727	18734	25 %	0 %	75 %	0 %	299883492
28	NC_014302	ATCA	2	8	18780	18787	50 %	25 %	0 %	25 %	299883492
29	NC_014302	TCCA	2	8	18953	18960	25 %	25 %	0 %	50 %	299883492
30	NC_014302	CGAA	2	8	18979	18986	50 %	0 %	25 %	25 %	299883492
31	NC_014302	ACTA	2	8	19951	19958	50 %	25 %	0 %	25 %	299883493
32	NC_014302	AATC	2	8	22582	22589	50 %	25 %	0 %	25 %	299883497
33	NC_014302	GATT	2	8	22641	22648	25 %	50 %	25 %	0 %	299883497
34	NC_014302	GCCT	2	8	22698	22705	0 %	25 %	25 %	50 %	299883497
35	NC_014302	GATG	2	8	22754	22761	25 %	25 %	50 %	0 %	299883497

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.