MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 plasmid 5

Total Repeats: 144

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014302	CAG	2	6	190	195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014302	TAG	2	6	360	365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014302	AAC	2	6	397	402	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014302	GTT	2	6	487	492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014302	ACG	2	6	525	530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014302	GAG	2	6	555	560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014302	CAT	2	6	620	625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014302	CAG	2	6	662	667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014302	GCT	2	6	672	677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014302	TGT	2	6	768	773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014302	TCA	2	6	788	793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014302	CCA	2	6	845	850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_014302	ATC	2	6	907	912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014302	CCA	2	6	983	988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_014302	GTC	2	6	1044	1049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014302	ACC	2	6	1757	1762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_014302	AGA	2	6	2129	2134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014302	AGA	2	6	2232	2237	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014302	CCA	2	6	2240	2245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_014302	AAT	2	6	2278	2283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014302	ACC	2	6	2884	2889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_014302	GTT	2	6	2890	2895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014302	GAG	2	6	2967	2972	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014302	GAA	2	6	2988	2993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014302	AGG	2	6	3022	3027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014302	CGA	2	6	3359	3364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014302	ATA	2	6	3466	3471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014302	GAA	2	6	3501	3506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014302	GTT	2	6	3509	3514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014302	ATT	2	6	3537	3542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014302	AGA	2	6	3558	3563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014302	CTC	2	6	3657	3662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_014302	CTT	3	9	3665	3673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014302	TAC	2	6	3733	3738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014302	ACC	2	6	3742	3747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_014302	TTC	2	6	3762	3767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014302	GAA	2	6	3825	3830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014302	CAC	2	6	3860	3865	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_014302	GTA	2	6	5150	5155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014302	AAC	2	6	5368	5373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014302	AAT	2	6	5427	5432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014302	CTT	2	6	5508	5513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014302	GCA	2	6	5635	5640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014302	GTC	2	6	5707	5712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014302	CGG	2	6	6586	6591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014302	GTC	2	6	6594	6599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014302	TGA	2	6	6640	6645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014302	CAT	2	6	6670	6675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014302	TTC	2	6	6951	6956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014302	CTC	2	6	7068	7073	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_014302	TTA	2	6	7096	7101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014302	TCA	2	6	7165	7170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014302	GCT	2	6	9079	9084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014302	CGG	2	6	12219	12224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014302	ACC	2	6	12235	12240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_014302	GCA	2	6	12339	12344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014302	CTG	2	6	12440	12445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014302	ATC	2	6	12721	12726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014302	ACT	2	6	12735	12740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014302	GGA	2	6	12795	12800	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014302	TCT	2	6	12886	12891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014302	ATA	2	6	12901	12906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014302	GAA	2	6	13035	13040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014302	GTG	2	6	13069	13074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014302	TCT	2	6	13146	13151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014302	ATT	2	6	13168	13173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014302	CTT	2	6	13317	13322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014302	TTG	2	6	13428	13433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014302	AGA	2	6	13447	13452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014302	AGT	2	6	13505	13510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014302	ATT	2	6	13516	13521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014302	CTA	2	6	13769	13774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_014302	GAG	2	6	13866	13871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014302	ATC	2	6	13882	13887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_014302	TGT	2	6	13920	13925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014302	TAG	2	6	13937	13942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014302	AAG	2	6	14152	14157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014302	ATG	2	6	14268	14273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014302	CCT	2	6	14296	14301	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_014302	TGC	2	6	14410	14415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_014302	GCA	2	6	14696	14701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014302	CTG	2	6	14771	14776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014302	CTT	2	6	14811	14816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_014302	ACA	2	6	14848	14853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014302	GAA	2	6	16495	16500	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014302	CTA	2	6	16515	16520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_014302	CCT	2	6	16521	16526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_014302	GGT	2	6	16532	16537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014302	AAT	2	6	16538	16543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014302	AGG	2	6	16598	16603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014302	CAA	2	6	16893	16898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014302	GCA	2	6	16947	16952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014302	AGC	2	6	17023	17028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014302	CGT	2	6	17083	17088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014302	AAG	2	6	17089	17094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014302	AGT	2	6	17171	17176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014302	AAG	2	6	18469	18474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014302	CTA	2	6	18631	18636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_014302	TTA	2	6	19092	19097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014302	GCG	2	6	19314	19319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_014302	AAC	2	6	19331	19336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014302	GTA	2	6	19469	19474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014302	CGC	2	6	19536	19541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_014302	GGT	2	6	19562	19567	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014302	AGG	2	6	19585	19590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014302	ATA	2	6	20379	20384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014302	CCA	2	6	20461	20466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_014302	TAC	2	6	20518	20523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014302	AGT	2	6	20527	20532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014302	CTC	2	6	20613	20618	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_014302	CAA	2	6	21033	21038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_014302	TCG	2	6	21084	21089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_014302	TGA	2	6	21096	21101	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014302	TGC	2	6	21130	21135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_014302	TGA	2	6	21196	21201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014302	GCC	2	6	21208	21213	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_014302	CGC	2	6	21253	21258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_014302	TCG	2	6	21361	21366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_014302	CTT	2	6	21399	21404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014302	TCA	2	6	21419	21424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_014302	GCC	2	6	21438	21443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_014302	GAA	3	9	22002	22010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014302	GCT	2	6	22208	22213	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_014302	TGC	2	6	22239	22244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_014302	CGA	2	6	22260	22265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_014302	AGC	2	6	22303	22308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_014302	CTT	2	6	22315	22320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_014302	CAA	2	6	22388	22393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_014302	CTG	2	6	22405	22410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_014302	TCT	2	6	22472	22477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_014302	TAG	2	6	22545	22550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014302	GAC	2	6	22795	22800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_014302	CCA	2	6	22987	22992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_014302	CTT	2	6	23006	23011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_014302	AGA	2	6	23275	23280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014302	CGC	3	9	23322	23330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_014302	ATC	2	6	23338	23343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_014302	TTC	2	6	23365	23370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_014302	TTC	2	6	23401	23406	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_014302	AGT	2	6	23419	23424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014302	TCA	2	6	23435	23440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_014302	GGT	2	6	23472	23477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014302	TCC	2	6	23519	23524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_014302	ATA	2	6	23577	23582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.