MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 plasmid 5

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014302	GA	3	6	425	430	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014302	TC	3	6	502	507	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_014302	TG	3	6	515	520	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014302	CT	3	6	707	712	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014302	CA	3	6	1553	1558	50 %	0 %	0 %	50 %	299883475
6	NC_014302	TC	3	6	1796	1801	0 %	50 %	0 %	50 %	299883476
7	NC_014302	CA	3	6	3121	3126	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_014302	AC	3	6	3200	3205	50 %	0 %	0 %	50 %	299883478
9	NC_014302	CG	3	6	4408	4413	0 %	0 %	50 %	50 %	299883479
10	NC_014302	CT	3	6	4455	4460	0 %	50 %	0 %	50 %	299883479
11	NC_014302	AC	3	6	5809	5814	50 %	0 %	0 %	50 %	299883480
12	NC_014302	AG	3	6	7151	7156	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014302	CT	4	8	7234	7241	0 %	50 %	0 %	50 %	299883481
14	NC_014302	AG	3	6	8008	8013	50 %	0 %	50 %	0 %	299883481
15	NC_014302	CA	3	6	8462	8467	50 %	0 %	0 %	50 %	299883481
16	NC_014302	CT	3	6	8767	8772	0 %	50 %	0 %	50 %	299883481
17	NC_014302	TC	3	6	8775	8780	0 %	50 %	0 %	50 %	299883481
18	NC_014302	TC	3	6	9091	9096	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_014302	TG	3	6	9512	9517	0 %	50 %	50 %	0 %	299883484
20	NC_014302	TC	4	8	10806	10813	0 %	50 %	0 %	50 %	299883484
21	NC_014302	CT	3	6	11580	11585	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_014302	AG	3	6	13870	13875	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014302	AT	3	6	14022	14027	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014302	GT	3	6	14733	14738	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014302	GA	3	6	15436	15441	50 %	0 %	50 %	0 %	299883487
26	NC_014302	GC	3	6	16373	16378	0 %	0 %	50 %	50 %	299883488
27	NC_014302	CG	3	6	17860	17865	0 %	0 %	50 %	50 %	299883490
28	NC_014302	TC	4	8	18095	18102	0 %	50 %	0 %	50 %	299883490
29	NC_014302	TC	3	6	18272	18277	0 %	50 %	0 %	50 %	299883491
30	NC_014302	TG	3	6	18398	18403	0 %	50 %	50 %	0 %	299883491
31	NC_014302	AC	3	6	18934	18939	50 %	0 %	0 %	50 %	299883492
32	NC_014302	CT	3	6	19403	19408	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_014302	TC	3	6	19625	19630	0 %	50 %	0 %	50 %	299883493
34	NC_014302	CT	3	6	19765	19770	0 %	50 %	0 %	50 %	299883493
35	NC_014302	TC	3	6	19875	19880	0 %	50 %	0 %	50 %	299883493
36	NC_014302	TC	4	8	20234	20241	0 %	50 %	0 %	50 %	299883494
37	NC_014302	GC	3	6	20577	20582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_014302	CT	3	6	20700	20705	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014302	CT	3	6	20777	20782	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_014302	GT	4	8	20806	20813	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014302	CG	3	6	20835	20840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_014302	AG	3	6	21748	21753	50 %	0 %	50 %	0 %	299883495
43	NC_014302	AG	3	6	21827	21832	50 %	0 %	50 %	0 %	299883495
44	NC_014302	CT	3	6	22893	22898	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_014302	TC	3	6	23445	23450	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
46	NC_014302	CT	3	6	23496	23501	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.