MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 plasmid 4

Total Repeats: 22

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014301	CAATCT	2	12	2583	2594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014301	ATCGAG	2	12	3476	3487	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	299883434
3	NC_014301	GCGTCG	2	12	4741	4752	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	299883434
4	NC_014301	GTTACT	2	12	7347	7358	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	299883435
5	NC_014301	ATGCTC	2	12	8080	8091	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	299883436
6	NC_014301	GACGGG	2	12	10251	10262	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	299883441
7	NC_014301	CGGTGG	2	12	10795	10806	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	299883442
8	NC_014301	TCTAGA	2	12	11020	11031	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014301	GATCTA	3	18	11037	11054	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014301	TCATAT	2	12	11249	11260	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_014301	CCGTAG	2	12	12942	12953	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	299883444
12	NC_014301	CGGCGA	2	12	13627	13638	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	299883444
13	NC_014301	TCGCGT	2	12	15788	15799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883447
14	NC_014301	CGAGGA	2	12	19454	19465	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	299883448
15	NC_014301	ACGCCA	2	12	22086	22097	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	299883450
16	NC_014301	CTACGC	2	12	22760	22771	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	299883451
17	NC_014301	CAGGAA	2	12	22938	22949	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	299883451
18	NC_014301	TTAACG	2	12	24669	24680	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_014301	ACGCCG	2	12	29899	29910	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	299883457
20	NC_014301	CTTCAC	2	12	30738	30749	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	299883458
21	NC_014301	ACAGTG	2	12	32572	32583	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	299883460
22	NC_014301	CCAGAA	2	12	34068	34079	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	299883461

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.