MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 plasmid 4

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014301	TCAAC	2	10	348	357	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
2	NC_014301	TTACT	2	10	5893	5902	20 %	60 %	0 %	20 %	299883434
3	NC_014301	CTGGT	2	10	6856	6865	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_014301	CGCGT	2	10	6891	6900	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5	NC_014301	GGCGT	2	10	12494	12503	0 %	20 %	60 %	20 %	299883444
6	NC_014301	CCCGA	2	10	13551	13560	20 %	0 %	20 %	60 %	299883444
7	NC_014301	GGCGA	2	10	17601	17610	20 %	0 %	60 %	20 %	299883448
8	NC_014301	GCGGT	2	10	19714	19723	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
9	NC_014301	TGGGA	2	10	21189	21198	20 %	20 %	60 %	0 %	299883449
10	NC_014301	CCGCC	2	10	21918	21927	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
11	NC_014301	GGACG	2	10	22582	22591	20 %	0 %	60 %	20 %	299883451
12	NC_014301	CGACA	2	10	23811	23820	40 %	0 %	20 %	40 %	299883452
13	NC_014301	CGGGA	2	10	28262	28271	20 %	0 %	60 %	20 %	299883456
14	NC_014301	TCGCG	2	10	30179	30188	0 %	20 %	40 %	40 %	299883457
15	NC_014301	GTGTC	2	10	30358	30367	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_014301	CTGGC	2	10	34300	34309	0 %	20 %	40 %	40 %	299883461
17	NC_014301	TATTC	2	10	34708	34717	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014301	GTCAC	2	10	34826	34835	20 %	20 %	20 %	40 %	299883462
19	NC_014301	CTCGC	2	10	41159	41168	0 %	20 %	20 %	60 %	299883470
20	NC_014301	GATTC	2	10	41397	41406	20 %	40 %	20 %	20 %	299883470
21	NC_014301	AGCCG	2	10	41707	41716	20 %	0 %	40 %	40 %	299883471

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.