MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 plasmid 4

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014301	AAGT	2	8	87	94	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014301	CTCG	2	8	223	230	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_014301	AAGG	2	8	589	596	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014301	AGCG	2	8	1486	1493	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014301	ACCA	2	8	1775	1782	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_014301	GATA	2	8	1827	1834	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014301	AGTG	2	8	1923	1930	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014301	ACTC	2	8	2157	2164	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_014301	ATCA	2	8	2503	2510	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014301	AGAC	2	8	2849	2856	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_014301	CGTT	2	8	2915	2922	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014301	AGTC	2	8	6190	6197	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014301	AGTT	2	8	6236	6243	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014301	GAAT	2	8	6482	6489	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014301	TCTA	2	8	8235	8242	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014301	TACT	2	8	8243	8250	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014301	TGTA	2	8	8292	8299	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014301	TCCA	2	8	8520	8527	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_014301	GCAC	2	8	9563	9570	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_014301	TTGA	2	8	10975	10982	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014301	GGGT	2	8	11387	11394	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014301	GTTT	2	8	11403	11410	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014301	TTTG	2	8	14163	14170	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014301	TCGG	2	8	14401	14408	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_014301	AAAT	2	8	20090	20097	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014301	GCGA	2	8	20667	20674	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_014301	CGAG	3	12	20728	20739	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
28	NC_014301	GTGA	2	8	20795	20802	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014301	TTCA	2	8	21604	21611	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_014301	AGTC	2	8	28023	28030	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014301	GTTG	2	8	28037	28044	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014301	TGAA	2	8	28762	28769	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014301	TGCC	2	8	28793	28800	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_014301	ATTC	2	8	28819	28826	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_014301	CGAT	2	8	34736	34743	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014301	ACCC	2	8	35655	35662	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
37	NC_014301	AAGT	2	8	35766	35773	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014301	TGTT	2	8	35911	35918	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014301	TTTC	2	8	36128	36135	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014301	ATCT	2	8	37380	37387	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_014301	ATCC	2	8	38299	38306	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_014301	ATAG	2	8	38505	38512	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014301	CATA	2	8	38513	38520	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_014301	CGCC	2	8	41972	41979	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
45	NC_014301	AGAC	2	8	43125	43132	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_014301	CGAA	2	8	43521	43528	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_014301	ATCT	2	8	44331	44338	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_014301	ACTC	2	8	44431	44438	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.