MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 plasmid 4

Total Repeats: 63

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014301	CGAA	2	8	3337	3344	50 %	0 %	25 %	25 %	299883434
2	NC_014301	ACAA	2	8	3464	3471	75 %	0 %	0 %	25 %	299883434
3	NC_014301	GTCA	2	8	3738	3745	25 %	25 %	25 %	25 %	299883434
4	NC_014301	TCGA	2	8	3791	3798	25 %	25 %	25 %	25 %	299883434
5	NC_014301	TGCG	2	8	4353	4360	0 %	25 %	50 %	25 %	299883434
6	NC_014301	AGAT	2	8	4512	4519	50 %	25 %	25 %	0 %	299883434
7	NC_014301	GATC	2	8	4876	4883	25 %	25 %	25 %	25 %	299883434
8	NC_014301	CCGA	2	8	5098	5105	25 %	0 %	25 %	50 %	299883434
9	NC_014301	AGGT	2	8	5259	5266	25 %	25 %	50 %	0 %	299883434
10	NC_014301	TCGA	2	8	5347	5354	25 %	25 %	25 %	25 %	299883434
11	NC_014301	CGGT	2	8	7818	7825	0 %	25 %	50 %	25 %	299883436
12	NC_014301	CGTC	2	8	7886	7893	0 %	25 %	25 %	50 %	299883436
13	NC_014301	GTGC	2	8	10217	10224	0 %	25 %	50 %	25 %	299883441
14	NC_014301	AACG	2	8	12182	12189	50 %	0 %	25 %	25 %	299883443
15	NC_014301	TCCC	2	8	12631	12638	0 %	25 %	0 %	75 %	299883444
16	NC_014301	GTGG	2	8	13454	13461	0 %	25 %	75 %	0 %	299883444
17	NC_014301	TCGA	2	8	14618	14625	25 %	25 %	25 %	25 %	299883446
18	NC_014301	GCTC	2	8	15849	15856	0 %	25 %	25 %	50 %	299883447
19	NC_014301	ACGA	2	8	16263	16270	50 %	0 %	25 %	25 %	299883448
20	NC_014301	CGAA	2	8	18168	18175	50 %	0 %	25 %	25 %	299883448
21	NC_014301	AGCG	2	8	18257	18264	25 %	0 %	50 %	25 %	299883448
22	NC_014301	CTTG	2	8	18755	18762	0 %	50 %	25 %	25 %	299883448
23	NC_014301	TTGA	2	8	18780	18787	25 %	50 %	25 %	0 %	299883448
24	NC_014301	CGGA	2	8	18900	18907	25 %	0 %	50 %	25 %	299883448
25	NC_014301	TCGC	2	8	18997	19004	0 %	25 %	25 %	50 %	299883448
26	NC_014301	CGAG	2	8	21254	21261	25 %	0 %	50 %	25 %	299883449
27	NC_014301	CGGA	2	8	21972	21979	25 %	0 %	50 %	25 %	299883450
28	NC_014301	TGAC	2	8	22385	22392	25 %	25 %	25 %	25 %	299883450
29	NC_014301	GCCG	2	8	22635	22642	0 %	0 %	50 %	50 %	299883451
30	NC_014301	AAGC	2	8	22875	22882	50 %	0 %	25 %	25 %	299883451
31	NC_014301	GTCG	2	8	23969	23976	0 %	25 %	50 %	25 %	299883452
32	NC_014301	CGTT	2	8	25588	25595	0 %	50 %	25 %	25 %	299883454
33	NC_014301	GTCG	2	8	25715	25722	0 %	25 %	50 %	25 %	299883454
34	NC_014301	TTGA	2	8	26368	26375	25 %	50 %	25 %	0 %	299883455
35	NC_014301	AGCC	2	8	27253	27260	25 %	0 %	25 %	50 %	299883455
36	NC_014301	GCGA	2	8	27387	27394	25 %	0 %	50 %	25 %	299883455
37	NC_014301	CTCG	2	8	27429	27436	0 %	25 %	25 %	50 %	299883455
38	NC_014301	GACG	2	8	27471	27478	25 %	0 %	50 %	25 %	299883455
39	NC_014301	TGCG	2	8	27576	27583	0 %	25 %	50 %	25 %	299883455
40	NC_014301	CCGA	2	8	27663	27670	25 %	0 %	25 %	50 %	299883455
41	NC_014301	ATTC	2	8	27683	27690	25 %	50 %	0 %	25 %	299883455
42	NC_014301	TTGG	2	8	28155	28162	0 %	50 %	50 %	0 %	299883456
43	NC_014301	CGCT	2	8	29408	29415	0 %	25 %	25 %	50 %	299883457
44	NC_014301	GCCG	2	8	29481	29488	0 %	0 %	50 %	50 %	299883457
45	NC_014301	CGAT	2	8	30612	30619	25 %	25 %	25 %	25 %	299883458
46	NC_014301	TCTG	3	12	31598	31609	0 %	50 %	25 %	25 %	299883459
47	NC_014301	GACC	2	8	33001	33008	25 %	0 %	25 %	50 %	299883460
48	NC_014301	GGTC	2	8	34477	34484	0 %	25 %	50 %	25 %	299883461
49	NC_014301	TTTG	2	8	34597	34604	0 %	75 %	25 %	0 %	299883461
50	NC_014301	GTTC	2	8	34761	34768	0 %	50 %	25 %	25 %	299883462
51	NC_014301	GTCC	2	8	35098	35105	0 %	25 %	25 %	50 %	299883462
52	NC_014301	TGGA	2	8	35540	35547	25 %	25 %	50 %	0 %	299883463
53	NC_014301	CATT	2	8	36586	36593	25 %	50 %	0 %	25 %	299883464
54	NC_014301	GGAG	2	8	36949	36956	25 %	0 %	75 %	0 %	299883464
55	NC_014301	AGCA	2	8	36981	36988	50 %	0 %	25 %	25 %	299883464
56	NC_014301	TAAT	2	8	38976	38983	50 %	50 %	0 %	0 %	299883466
57	NC_014301	GAGT	2	8	41265	41272	25 %	25 %	50 %	0 %	299883470
58	NC_014301	CAAA	2	8	41358	41365	75 %	0 %	0 %	25 %	299883470
59	NC_014301	TCGG	2	8	41598	41605	0 %	25 %	50 %	25 %	299883471
60	NC_014301	GAAC	2	8	42378	42385	50 %	0 %	25 %	25 %	299883472
61	NC_014301	GGTG	2	8	42463	42470	0 %	25 %	75 %	0 %	299883472
62	NC_014301	GCAA	2	8	43310	43317	50 %	0 %	25 %	25 %	299883473
63	NC_014301	CGGA	2	8	43320	43327	25 %	0 %	50 %	25 %	299883473

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.