MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 plasmid 4

Total Repeats: 704

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014301	CCA	2	6	106	111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_014301	CGG	2	6	138	143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014301	CTC	2	6	241	246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_014301	ACT	2	6	290	295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014301	CGA	2	6	363	368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014301	GGT	2	6	412	417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014301	TCG	2	6	422	427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014301	CTA	2	6	486	491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014301	GAC	2	6	547	552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014301	GGT	2	6	598	603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014301	CGA	2	6	762	767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014301	ACG	2	6	977	982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014301	CAG	2	6	1033	1038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014301	AAG	2	6	1108	1113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014301	ACG	2	6	1127	1132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014301	GAT	2	6	1141	1146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014301	ACA	2	6	1265	1270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014301	GGC	2	6	1308	1313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014301	TTC	2	6	1324	1329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014301	TCC	2	6	1416	1421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_014301	TGA	2	6	1437	1442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014301	CAT	2	6	1563	1568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014301	TGA	2	6	1674	1679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014301	GAC	2	6	1863	1868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014301	TCA	2	6	1976	1981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014301	GGT	2	6	2029	2034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014301	TGA	2	6	2145	2150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014301	TTG	2	6	2183	2188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014301	AGT	2	6	2290	2295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014301	TAC	2	6	2516	2521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014301	CTT	2	6	2526	2531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014301	TCT	2	6	2535	2540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014301	CGA	2	6	2721	2726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014301	AGG	2	6	2894	2899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014301	CGA	2	6	2934	2939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014301	CGA	2	6	2966	2971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014301	GAT	2	6	3003	3008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014301	GAC	2	6	3034	3039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014301	CGA	2	6	3072	3077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014301	CGA	2	6	3114	3119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014301	CGA	2	6	3147	3152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014301	TGA	2	6	3183	3188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883434
43	NC_014301	CGG	2	6	3223	3228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883434
44	NC_014301	CTC	2	6	3275	3280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883434
45	NC_014301	GAC	2	6	3383	3388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883434
46	NC_014301	CCA	2	6	3394	3399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	299883434
47	NC_014301	GCC	2	6	3503	3508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883434
48	NC_014301	ACC	2	6	3531	3536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	299883434
49	NC_014301	TCG	2	6	3543	3548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883434
50	NC_014301	CGA	2	6	3550	3555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883434
51	NC_014301	GAG	2	6	3596	3601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883434
52	NC_014301	ATC	2	6	3782	3787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883434
53	NC_014301	GAC	2	6	3812	3817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883434
54	NC_014301	CGA	2	6	3904	3909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883434
55	NC_014301	CCT	2	6	4033	4038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883434
56	NC_014301	GGA	2	6	4087	4092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883434
57	NC_014301	TGA	2	6	4095	4100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883434
58	NC_014301	GAA	2	6	4156	4161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883434
59	NC_014301	GAG	2	6	4193	4198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883434
60	NC_014301	ACA	2	6	4209	4214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	299883434
61	NC_014301	TAC	2	6	4238	4243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883434
62	NC_014301	GAG	2	6	4259	4264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883434
63	NC_014301	GCC	2	6	4271	4276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883434
64	NC_014301	ACG	2	6	4368	4373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883434
65	NC_014301	GAC	2	6	4394	4399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883434
66	NC_014301	GAG	2	6	4469	4474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883434
67	NC_014301	AGC	2	6	4539	4544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883434
68	NC_014301	GGC	2	6	4548	4553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883434
69	NC_014301	CGA	2	6	4630	4635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883434
70	NC_014301	CGC	2	6	4801	4806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883434
71	NC_014301	AGG	2	6	4809	4814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883434
72	NC_014301	CAT	2	6	4837	4842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883434
73	NC_014301	CTT	2	6	4942	4947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883434
74	NC_014301	CTC	3	9	4979	4987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883434
75	NC_014301	CGA	2	6	5065	5070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883434
76	NC_014301	TGA	2	6	5209	5214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883434
77	NC_014301	ATC	2	6	5234	5239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883434
78	NC_014301	TTC	2	6	5297	5302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883434
79	NC_014301	GTG	2	6	5355	5360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883434
80	NC_014301	GAA	2	6	5453	5458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883434
81	NC_014301	ATC	2	6	5484	5489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883434
82	NC_014301	ACT	2	6	5511	5516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883434
83	NC_014301	CAG	2	6	5685	5690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883434
84	NC_014301	CGT	2	6	5731	5736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883434
85	NC_014301	GAG	2	6	5912	5917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883434
86	NC_014301	CAG	2	6	5942	5947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883434
87	NC_014301	CGA	2	6	6014	6019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883434
88	NC_014301	AGC	2	6	6054	6059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883434
89	NC_014301	AGA	2	6	6070	6075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883434
90	NC_014301	AGG	2	6	6127	6132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883434
91	NC_014301	GAC	2	6	6134	6139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014301	AAG	2	6	6178	6183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014301	GTT	2	6	6213	6218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014301	CGA	2	6	6356	6361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014301	ACA	2	6	6422	6427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014301	GAA	3	9	6460	6468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014301	TAC	2	6	6495	6500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014301	CGA	2	6	6510	6515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_014301	CTG	2	6	6539	6544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014301	GAC	2	6	6556	6561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_014301	GAA	2	6	6607	6612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014301	AGG	2	6	6630	6635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014301	TCG	2	6	6839	6844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014301	CTC	2	6	6930	6935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_014301	TCG	2	6	7095	7100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883435
106	NC_014301	GTT	2	6	7273	7278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	299883435
107	NC_014301	GCT	2	6	7454	7459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014301	TGG	2	6	7473	7478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014301	ATA	2	6	7482	7487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014301	TGC	2	6	7550	7555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014301	GAT	2	6	7591	7596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014301	CGG	2	6	7651	7656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883436
113	NC_014301	GTA	2	6	7686	7691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883436
114	NC_014301	CGG	2	6	7710	7715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883436
115	NC_014301	CCT	2	6	7742	7747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883436
116	NC_014301	CGT	2	6	7754	7759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883436
117	NC_014301	CCG	2	6	7786	7791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883436
118	NC_014301	TCG	2	6	7810	7815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883436
119	NC_014301	GCG	2	6	7867	7872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883436
120	NC_014301	ATC	2	6	7873	7878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883436
121	NC_014301	TCG	2	6	7897	7902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883436
122	NC_014301	GGC	2	6	8097	8102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883436
123	NC_014301	CTT	2	6	8126	8131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883436
124	NC_014301	CGT	2	6	8139	8144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883436
125	NC_014301	TGA	2	6	8192	8197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014301	CGA	2	6	8400	8405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883437
127	NC_014301	AAG	2	6	8419	8424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883437
128	NC_014301	GAG	2	6	8464	8469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883437
129	NC_014301	GAA	2	6	8473	8478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883437
130	NC_014301	TGT	2	6	8531	8536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014301	CGA	2	6	8558	8563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_014301	TGG	2	6	8667	8672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014301	GCC	2	6	8674	8679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_014301	TAC	2	6	8686	8691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_014301	TTC	2	6	8779	8784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883438
136	NC_014301	CCG	2	6	8799	8804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883438
137	NC_014301	CTC	2	6	8860	8865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883438
138	NC_014301	CGT	2	6	8966	8971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883438
139	NC_014301	GGC	2	6	8976	8981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883438
140	NC_014301	CTC	2	6	9139	9144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883438
141	NC_014301	CTC	2	6	9229	9234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883438
142	NC_014301	TGG	3	9	9354	9362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014301	TAC	2	6	9393	9398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883439
144	NC_014301	CGA	2	6	9444	9449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883439
145	NC_014301	CGC	2	6	9471	9476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883439
146	NC_014301	GCT	2	6	9486	9491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883439
147	NC_014301	TGA	2	6	9667	9672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014301	GTC	2	6	9706	9711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_014301	CAA	2	6	9752	9757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	299883440
150	NC_014301	GCC	2	6	9805	9810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883440
151	NC_014301	AGC	2	6	9851	9856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883440
152	NC_014301	CGG	2	6	9859	9864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883440
153	NC_014301	AAG	2	6	9931	9936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883440
154	NC_014301	ACG	2	6	10049	10054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883440
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159	NC_014301	GAA	2	6	10493	10498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883442
160	NC_014301	GAC	2	6	10586	10591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883442
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162	NC_014301	GGA	2	6	10659	10664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883442
163	NC_014301	GCA	2	6	10700	10705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883442
164	NC_014301	TTA	2	6	10731	10736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	299883442
165	NC_014301	CGA	2	6	10768	10773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883442
166	NC_014301	GAG	2	6	10895	10900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883442
167	NC_014301	CTT	2	6	11009	11014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
168	NC_014301	CTA	8	24	11057	11080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
169	NC_014301	ACA	5	15	11085	11099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
170	NC_014301	GTT	2	6	11124	11129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
171	NC_014301	GGT	2	6	11171	11176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
172	NC_014301	AGT	2	6	11330	11335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
173	NC_014301	ATG	2	6	11436	11441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
174	NC_014301	GTC	2	6	11529	11534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_014301	TGG	2	6	11569	11574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
176	NC_014301	CCG	2	6	11625	11630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
177	NC_014301	GGA	2	6	11635	11640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
178	NC_014301	GCC	2	6	11649	11654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
179	NC_014301	AGG	2	6	11670	11675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
180	NC_014301	CGG	2	6	11727	11732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_014301	GGT	2	6	11743	11748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
182	NC_014301	CAC	2	6	11751	11756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
183	NC_014301	CGA	2	6	11866	11871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_014301	CAA	2	6	11927	11932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	299883443
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195	NC_014301	TGG	2	6	12296	12301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883443
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198	NC_014301	GAG	2	6	12506	12511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883444
199	NC_014301	CCG	2	6	12588	12593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883444
200	NC_014301	GTC	2	6	12746	12751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883444
201	NC_014301	CCG	2	6	12765	12770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883444
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211	NC_014301	AGT	2	6	13603	13608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883444
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220	NC_014301	CTT	2	6	13967	13972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
221	NC_014301	ATA	2	6	14003	14008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
222	NC_014301	CTT	2	6	14021	14026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
223	NC_014301	CCT	2	6	14092	14097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
224	NC_014301	TTC	2	6	14192	14197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
225	NC_014301	AGT	2	6	14281	14286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
226	NC_014301	GAG	2	6	14414	14419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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229	NC_014301	TGA	2	6	14451	14456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883446
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238	NC_014301	ATA	2	6	14915	14920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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249	NC_014301	GTG	2	6	15523	15528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883447
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259	NC_014301	GCC	2	6	16067	16072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883447
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263	NC_014301	CTC	2	6	16164	16169	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883447
264	NC_014301	ACG	3	9	16221	16229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883447
265	NC_014301	TGA	2	6	16242	16247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883447
266	NC_014301	CGA	2	6	16364	16369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883448
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269	NC_014301	CGA	2	6	16456	16461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883448
270	NC_014301	TAT	2	6	16463	16468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	299883448
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273	NC_014301	GCC	2	6	16573	16578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883448
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293	NC_014301	CGA	2	6	17300	17305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883448
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380	NC_014301	CGC	2	6	23056	23061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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