MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 plasmid 4

Total Repeats: 205

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014301	CCA	2	6	106	111	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_014301	CGG	2	6	138	143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014301	CTC	2	6	241	246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_014301	ACT	2	6	290	295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014301	CGA	2	6	363	368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014301	GGT	2	6	412	417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014301	TCG	2	6	422	427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014301	CTA	2	6	486	491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014301	GAC	2	6	547	552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014301	GGT	2	6	598	603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014301	CGA	2	6	762	767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014301	ACG	2	6	977	982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014301	CAG	2	6	1033	1038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014301	AAG	2	6	1108	1113	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014301	ACG	2	6	1127	1132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014301	GAT	2	6	1141	1146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014301	ACA	2	6	1265	1270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014301	GGC	2	6	1308	1313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014301	TTC	2	6	1324	1329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014301	TCC	2	6	1416	1421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_014301	TGA	2	6	1437	1442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014301	CAT	2	6	1563	1568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014301	TGA	2	6	1674	1679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014301	GAC	2	6	1863	1868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014301	TCA	2	6	1976	1981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_014301	GGT	2	6	2029	2034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014301	TGA	2	6	2145	2150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014301	TTG	2	6	2183	2188	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014301	AGT	2	6	2290	2295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014301	TAC	2	6	2516	2521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014301	CTT	2	6	2526	2531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014301	TCT	2	6	2535	2540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014301	CGA	2	6	2721	2726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014301	AGG	2	6	2894	2899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014301	CGA	2	6	2934	2939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014301	CGA	2	6	2966	2971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014301	GAT	2	6	3003	3008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014301	GAC	2	6	3034	3039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014301	CGA	2	6	3072	3077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014301	CGA	2	6	3114	3119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_014301	CGA	2	6	3147	3152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014301	GAC	2	6	6134	6139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014301	AAG	2	6	6178	6183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014301	GTT	2	6	6213	6218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014301	CGA	2	6	6356	6361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014301	ACA	2	6	6422	6427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014301	GAA	3	9	6460	6468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014301	TAC	2	6	6495	6500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014301	CGA	2	6	6510	6515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014301	CTG	2	6	6539	6544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014301	GAC	2	6	6556	6561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014301	GAA	2	6	6607	6612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014301	AGG	2	6	6630	6635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014301	TCG	2	6	6839	6844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014301	CTC	2	6	6930	6935	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_014301	GCT	2	6	7454	7459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014301	TGG	2	6	7473	7478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014301	ATA	2	6	7482	7487	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014301	TGC	2	6	7550	7555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014301	GAT	2	6	7591	7596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014301	TGA	2	6	8192	8197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014301	TGT	2	6	8531	8536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014301	CGA	2	6	8558	8563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014301	TGG	2	6	8667	8672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014301	GCC	2	6	8674	8679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_014301	TAC	2	6	8686	8691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014301	TGG	3	9	9354	9362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014301	TGA	2	6	9667	9672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014301	GTC	2	6	9706	9711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_014301	CTT	2	6	11009	11014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014301	CTA	8	24	11057	11080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014301	ACA	5	15	11085	11099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_014301	GTT	2	6	11124	11129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014301	GGT	2	6	11171	11176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014301	AGT	2	6	11330	11335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014301	ATG	2	6	11436	11441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014301	GTC	2	6	11529	11534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014301	TGG	2	6	11569	11574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014301	CCG	2	6	11625	11630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_014301	GGA	2	6	11635	11640	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014301	GCC	2	6	11649	11654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
82	NC_014301	AGG	2	6	11670	11675	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014301	CGG	2	6	11727	11732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_014301	GGT	2	6	11743	11748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014301	CAC	2	6	11751	11756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_014301	CGA	2	6	11866	11871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_014301	CTC	2	6	13922	13927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_014301	CTT	2	6	13967	13972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014301	ATA	2	6	14003	14008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014301	CTT	2	6	14021	14026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_014301	CCT	2	6	14092	14097	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_014301	TTC	2	6	14192	14197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014301	AGT	2	6	14281	14286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014301	GAG	2	6	14414	14419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014301	CGA	2	6	14436	14441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014301	CCG	2	6	14442	14447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_014301	ATC	2	6	14896	14901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014301	ATA	2	6	14915	14920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014301	ACC	2	6	14974	14979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_014301	GGC	2	6	15013	15018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_014301	GGT	2	6	15025	15030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014301	TGG	2	6	19653	19658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014301	AAC	2	6	19815	19820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014301	GCA	2	6	19851	19856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014301	TCC	2	6	19888	19893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_014301	CTG	2	6	19897	19902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_014301	AGC	2	6	19938	19943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014301	GCT	2	6	20148	20153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014301	CGT	2	6	20330	20335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_014301	CAA	2	6	20356	20361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014301	GCG	2	6	20451	20456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_014301	TAC	2	6	20465	20470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_014301	CGG	2	6	20552	20557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_014301	CGA	2	6	20653	20658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_014301	GAC	2	6	20717	20722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_014301	GGA	2	6	20968	20973	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014301	CAG	2	6	21547	21552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014301	CAA	2	6	21639	21644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_014301	AGG	2	6	21659	21664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014301	CCA	2	6	21900	21905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_014301	TGG	2	6	22998	23003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014301	CTT	2	6	23012	23017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_014301	CGC	2	6	23056	23061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_014301	AAG	2	6	24777	24782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014301	GCA	2	6	24824	24829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_014301	GAG	2	6	24975	24980	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014301	GAA	2	6	25032	25037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014301	CAA	2	6	25061	25066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_014301	CTT	2	6	25089	25094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_014301	GAT	2	6	25131	25136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014301	TCG	2	6	25229	25234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_014301	CCG	2	6	25237	25242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_014301	CGC	2	6	25247	25252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_014301	ACC	2	6	25846	25851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_014301	GTG	2	6	25941	25946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014301	TTC	2	6	25972	25977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_014301	ACT	2	6	26084	26089	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_014301	AGC	2	6	26124	26129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_014301	TGG	2	6	27929	27934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014301	AAT	2	6	28779	28784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014301	ATT	2	6	28807	28812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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193	NC_014301	ATG	2	6	43225	43230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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205	NC_014301	GAT	2	6	44298	44303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.