MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 plasmid 4

Total Repeats: 499

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014301	TGA	2	6	3183	3188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883434
2	NC_014301	CGG	2	6	3223	3228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883434
3	NC_014301	CTC	2	6	3275	3280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883434
4	NC_014301	GAC	2	6	3383	3388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883434
5	NC_014301	CCA	2	6	3394	3399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	299883434
6	NC_014301	GCC	2	6	3503	3508	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883434
7	NC_014301	ACC	2	6	3531	3536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	299883434
8	NC_014301	TCG	2	6	3543	3548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883434
9	NC_014301	CGA	2	6	3550	3555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883434
10	NC_014301	GAG	2	6	3596	3601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883434
11	NC_014301	ATC	2	6	3782	3787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883434
12	NC_014301	GAC	2	6	3812	3817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883434
13	NC_014301	CGA	2	6	3904	3909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883434
14	NC_014301	CCT	2	6	4033	4038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883434
15	NC_014301	GGA	2	6	4087	4092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883434
16	NC_014301	TGA	2	6	4095	4100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883434
17	NC_014301	GAA	2	6	4156	4161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883434
18	NC_014301	GAG	2	6	4193	4198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883434
19	NC_014301	ACA	2	6	4209	4214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	299883434
20	NC_014301	TAC	2	6	4238	4243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883434
21	NC_014301	GAG	2	6	4259	4264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883434
22	NC_014301	GCC	2	6	4271	4276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883434
23	NC_014301	ACG	2	6	4368	4373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883434
24	NC_014301	GAC	2	6	4394	4399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883434
25	NC_014301	GAG	2	6	4469	4474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883434
26	NC_014301	AGC	2	6	4539	4544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883434
27	NC_014301	GGC	2	6	4548	4553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883434
28	NC_014301	CGA	2	6	4630	4635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883434
29	NC_014301	CGC	2	6	4801	4806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883434
30	NC_014301	AGG	2	6	4809	4814	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883434
31	NC_014301	CAT	2	6	4837	4842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883434
32	NC_014301	CTT	2	6	4942	4947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883434
33	NC_014301	CTC	3	9	4979	4987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883434
34	NC_014301	CGA	2	6	5065	5070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883434
35	NC_014301	TGA	2	6	5209	5214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883434
36	NC_014301	ATC	2	6	5234	5239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883434
37	NC_014301	TTC	2	6	5297	5302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883434
38	NC_014301	GTG	2	6	5355	5360	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883434
39	NC_014301	GAA	2	6	5453	5458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883434
40	NC_014301	ATC	2	6	5484	5489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883434
41	NC_014301	ACT	2	6	5511	5516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883434
42	NC_014301	CAG	2	6	5685	5690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883434
43	NC_014301	CGT	2	6	5731	5736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883434
44	NC_014301	GAG	2	6	5912	5917	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883434
45	NC_014301	CAG	2	6	5942	5947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883434
46	NC_014301	CGA	2	6	6014	6019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883434
47	NC_014301	AGC	2	6	6054	6059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883434
48	NC_014301	AGA	2	6	6070	6075	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883434
49	NC_014301	AGG	2	6	6127	6132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883434
50	NC_014301	TCG	2	6	7095	7100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883435
51	NC_014301	GTT	2	6	7273	7278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	299883435
52	NC_014301	CGG	2	6	7651	7656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883436
53	NC_014301	GTA	2	6	7686	7691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883436
54	NC_014301	CGG	2	6	7710	7715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883436
55	NC_014301	CCT	2	6	7742	7747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883436
56	NC_014301	CGT	2	6	7754	7759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883436
57	NC_014301	CCG	2	6	7786	7791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883436
58	NC_014301	TCG	2	6	7810	7815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883436
59	NC_014301	GCG	2	6	7867	7872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883436
60	NC_014301	ATC	2	6	7873	7878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883436
61	NC_014301	TCG	2	6	7897	7902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883436
62	NC_014301	GGC	2	6	8097	8102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883436
63	NC_014301	CTT	2	6	8126	8131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883436
64	NC_014301	CGT	2	6	8139	8144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883436
65	NC_014301	CGA	2	6	8400	8405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883437
66	NC_014301	AAG	2	6	8419	8424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883437
67	NC_014301	GAG	2	6	8464	8469	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883437
68	NC_014301	GAA	2	6	8473	8478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883437
69	NC_014301	TTC	2	6	8779	8784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883438
70	NC_014301	CCG	2	6	8799	8804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883438
71	NC_014301	CTC	2	6	8860	8865	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883438
72	NC_014301	CGT	2	6	8966	8971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883438
73	NC_014301	GGC	2	6	8976	8981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883438
74	NC_014301	CTC	2	6	9139	9144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883438
75	NC_014301	CTC	2	6	9229	9234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883438
76	NC_014301	TAC	2	6	9393	9398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883439
77	NC_014301	CGA	2	6	9444	9449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883439
78	NC_014301	CGC	2	6	9471	9476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883439
79	NC_014301	GCT	2	6	9486	9491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883439
80	NC_014301	CAA	2	6	9752	9757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	299883440
81	NC_014301	GCC	2	6	9805	9810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883440
82	NC_014301	AGC	2	6	9851	9856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883440
83	NC_014301	CGG	2	6	9859	9864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883440
84	NC_014301	AAG	2	6	9931	9936	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883440
85	NC_014301	ACG	2	6	10049	10054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883440
86	NC_014301	CGA	2	6	10059	10064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883440
87	NC_014301	CGA	3	9	10137	10145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883440
88	NC_014301	CGA	2	6	10288	10293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883442
89	NC_014301	GAA	2	6	10442	10447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883442
90	NC_014301	GAA	2	6	10493	10498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883442
91	NC_014301	GAC	2	6	10586	10591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883442
92	NC_014301	ACA	2	6	10641	10646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	299883442
93	NC_014301	GGA	2	6	10659	10664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883442
94	NC_014301	GCA	2	6	10700	10705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883442
95	NC_014301	TTA	2	6	10731	10736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	299883442
96	NC_014301	CGA	2	6	10768	10773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883442
97	NC_014301	GAG	2	6	10895	10900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883442
98	NC_014301	CAA	2	6	11927	11932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	299883443
99	NC_014301	ACG	2	6	11973	11978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883443
100	NC_014301	CGA	2	6	11990	11995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883443
101	NC_014301	AGG	2	6	12022	12027	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883443
102	NC_014301	GCG	2	6	12120	12125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883443
103	NC_014301	GAA	2	6	12129	12134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883443
104	NC_014301	CGA	2	6	12143	12148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883443
105	NC_014301	CGA	2	6	12211	12216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883443
106	NC_014301	CGA	2	6	12224	12229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883443
107	NC_014301	TCC	2	6	12259	12264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883443
108	NC_014301	AGG	2	6	12265	12270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883443
109	NC_014301	TGG	2	6	12296	12301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883443
110	NC_014301	GAC	2	6	12302	12307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883443
111	NC_014301	CGA	2	6	12323	12328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883443
112	NC_014301	GAG	2	6	12506	12511	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883444
113	NC_014301	CCG	2	6	12588	12593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883444
114	NC_014301	GTC	2	6	12746	12751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883444
115	NC_014301	CCG	2	6	12765	12770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883444
116	NC_014301	AGC	2	6	12829	12834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883444
117	NC_014301	CTC	2	6	13142	13147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883444
118	NC_014301	GCC	2	6	13337	13342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883444
119	NC_014301	GAC	2	6	13385	13390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883444
120	NC_014301	AGT	2	6	13405	13410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883444
121	NC_014301	AGC	2	6	13415	13420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883444
122	NC_014301	TCG	2	6	13464	13469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883444
123	NC_014301	AGC	2	6	13472	13477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883444
124	NC_014301	TCG	2	6	13597	13602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883444
125	NC_014301	AGT	2	6	13603	13608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883444
126	NC_014301	CGG	2	6	13642	13647	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883444
127	NC_014301	GAA	2	6	13654	13659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883444
128	NC_014301	GAT	2	6	13723	13728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883445
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252	NC_014301	GAC	2	6	22456	22461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883450
253	NC_014301	CAT	3	9	22655	22663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883451
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255	NC_014301	ACG	2	6	22777	22782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883451
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374	NC_014301	GTC	2	6	31558	31563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883458
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497	NC_014301	GAA	2	6	42858	42863	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883472
498	NC_014301	GTC	2	6	42871	42876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883472
499	NC_014301	ACC	2	6	43494	43499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	299883473