MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 plasmid 4

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014301	GT	3	6	629	634	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014301	GC	3	6	1295	1300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_014301	TC	3	6	1741	1746	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014301	TA	3	6	1767	1772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014301	AC	3	6	2177	2182	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_014301	CA	3	6	2230	2235	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_014301	CT	3	6	2431	2436	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_014301	GC	3	6	2791	2796	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_014301	CA	3	6	3922	3927	50 %	0 %	0 %	50 %	299883434
10	NC_014301	CA	3	6	3993	3998	50 %	0 %	0 %	50 %	299883434
11	NC_014301	TC	3	6	5203	5208	0 %	50 %	0 %	50 %	299883434
12	NC_014301	GA	3	6	5859	5864	50 %	0 %	50 %	0 %	299883434
13	NC_014301	AG	3	6	6385	6390	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014301	GC	3	6	7607	7612	0 %	0 %	50 %	50 %	299883436
15	NC_014301	TG	3	6	7762	7767	0 %	50 %	50 %	0 %	299883436
16	NC_014301	GA	3	6	8787	8792	50 %	0 %	50 %	0 %	299883438
17	NC_014301	GA	3	6	8894	8899	50 %	0 %	50 %	0 %	299883438
18	NC_014301	GA	3	6	9056	9061	50 %	0 %	50 %	0 %	299883438
19	NC_014301	AC	3	6	9736	9741	50 %	0 %	0 %	50 %	299883440
20	NC_014301	GA	3	6	10992	10997	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014301	CG	3	6	11455	11460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_014301	GC	3	6	11688	11693	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_014301	CG	3	6	13865	13870	0 %	0 %	50 %	50 %	299883445
24	NC_014301	GT	3	6	14134	14139	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014301	TC	3	6	15855	15860	0 %	50 %	0 %	50 %	299883447
26	NC_014301	CG	3	6	15929	15934	0 %	0 %	50 %	50 %	299883447
27	NC_014301	GA	3	6	16291	16296	50 %	0 %	50 %	0 %	299883448
28	NC_014301	GA	3	6	16960	16965	50 %	0 %	50 %	0 %	299883448
29	NC_014301	GT	3	6	17132	17137	0 %	50 %	50 %	0 %	299883448
30	NC_014301	GT	3	6	17245	17250	0 %	50 %	50 %	0 %	299883448
31	NC_014301	TC	4	8	17345	17352	0 %	50 %	0 %	50 %	299883448
32	NC_014301	AG	3	6	17783	17788	50 %	0 %	50 %	0 %	299883448
33	NC_014301	GC	3	6	17830	17835	0 %	0 %	50 %	50 %	299883448
34	NC_014301	CA	3	6	18332	18337	50 %	0 %	0 %	50 %	299883448
35	NC_014301	GC	3	6	19396	19401	0 %	0 %	50 %	50 %	299883448
36	NC_014301	CA	3	6	19537	19542	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_014301	GC	3	6	19689	19694	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_014301	CT	3	6	19751	19756	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014301	CT	3	6	20252	20257	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_014301	GT	3	6	20511	20516	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014301	AC	3	6	20886	20891	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_014301	AT	3	6	21127	21132	50 %	50 %	0 %	0 %	299883449
43	NC_014301	TC	3	6	21246	21251	0 %	50 %	0 %	50 %	299883449
44	NC_014301	TC	3	6	21887	21892	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_014301	CG	3	6	23443	23448	0 %	0 %	50 %	50 %	299883452
46	NC_014301	GA	3	6	23614	23619	50 %	0 %	50 %	0 %	299883452
47	NC_014301	GT	4	8	25203	25210	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014301	TG	3	6	25498	25503	0 %	50 %	50 %	0 %	299883454
49	NC_014301	CT	3	6	25775	25780	0 %	50 %	0 %	50 %	299883454
50	NC_014301	CT	3	6	25813	25818	0 %	50 %	0 %	50 %	299883454
51	NC_014301	GA	4	8	26645	26652	50 %	0 %	50 %	0 %	299883455
52	NC_014301	GT	3	6	29840	29845	0 %	50 %	50 %	0 %	299883457
53	NC_014301	GC	4	8	30824	30831	0 %	0 %	50 %	50 %	299883458
54	NC_014301	GA	3	6	30913	30918	50 %	0 %	50 %	0 %	299883458
55	NC_014301	GT	3	6	30926	30931	0 %	50 %	50 %	0 %	299883458
56	NC_014301	TC	3	6	30960	30965	0 %	50 %	0 %	50 %	299883458
57	NC_014301	TC	4	8	34605	34612	0 %	50 %	0 %	50 %	299883461
58	NC_014301	TC	3	6	35648	35653	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_014301	AG	3	6	35707	35712	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014301	AT	3	6	35714	35719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014301	TC	3	6	36027	36032	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_014301	TG	3	6	36209	36214	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014301	TG	3	6	36235	36240	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014301	CT	3	6	38436	38441	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_014301	TA	3	6	38481	38486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014301	AG	3	6	38599	38604	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014301	AT	3	6	38787	38792	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014301	AC	3	6	39177	39182	50 %	0 %	0 %	50 %	299883466
69	NC_014301	GA	3	6	39235	39240	50 %	0 %	50 %	0 %	299883466
70	NC_014301	CA	3	6	39593	39598	50 %	0 %	0 %	50 %	299883467
71	NC_014301	GC	3	6	40287	40292	0 %	0 %	50 %	50 %	299883467
72	NC_014301	CT	3	6	40568	40573	0 %	50 %	0 %	50 %	299883468
73	NC_014301	AG	3	6	40839	40844	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014301	GA	3	6	40852	40857	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014301	CT	3	6	41659	41664	0 %	50 %	0 %	50 %	299883471
76	NC_014301	AT	4	8	41823	41830	50 %	50 %	0 %	0 %	299883471
77	NC_014301	GA	3	6	42421	42426	50 %	0 %	50 %	0 %	299883472
78	NC_014301	GC	4	8	42660	42667	0 %	0 %	50 %	50 %	299883472
79	NC_014301	CA	3	6	42776	42781	50 %	0 %	0 %	50 %	299883472
80	NC_014301	GA	3	6	42940	42945	50 %	0 %	50 %	0 %	299883472
81	NC_014301	AG	3	6	44366	44371	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.