MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 plasmid 4

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014301	CA	3	6	3922	3927	50 %	0 %	0 %	50 %	299883434
2	NC_014301	CA	3	6	3993	3998	50 %	0 %	0 %	50 %	299883434
3	NC_014301	TC	3	6	5203	5208	0 %	50 %	0 %	50 %	299883434
4	NC_014301	GA	3	6	5859	5864	50 %	0 %	50 %	0 %	299883434
5	NC_014301	GC	3	6	7607	7612	0 %	0 %	50 %	50 %	299883436
6	NC_014301	TG	3	6	7762	7767	0 %	50 %	50 %	0 %	299883436
7	NC_014301	GA	3	6	8787	8792	50 %	0 %	50 %	0 %	299883438
8	NC_014301	GA	3	6	8894	8899	50 %	0 %	50 %	0 %	299883438
9	NC_014301	GA	3	6	9056	9061	50 %	0 %	50 %	0 %	299883438
10	NC_014301	AC	3	6	9736	9741	50 %	0 %	0 %	50 %	299883440
11	NC_014301	CG	3	6	13865	13870	0 %	0 %	50 %	50 %	299883445
12	NC_014301	TC	3	6	15855	15860	0 %	50 %	0 %	50 %	299883447
13	NC_014301	CG	3	6	15929	15934	0 %	0 %	50 %	50 %	299883447
14	NC_014301	GA	3	6	16291	16296	50 %	0 %	50 %	0 %	299883448
15	NC_014301	GA	3	6	16960	16965	50 %	0 %	50 %	0 %	299883448
16	NC_014301	GT	3	6	17132	17137	0 %	50 %	50 %	0 %	299883448
17	NC_014301	GT	3	6	17245	17250	0 %	50 %	50 %	0 %	299883448
18	NC_014301	TC	4	8	17345	17352	0 %	50 %	0 %	50 %	299883448
19	NC_014301	AG	3	6	17783	17788	50 %	0 %	50 %	0 %	299883448
20	NC_014301	GC	3	6	17830	17835	0 %	0 %	50 %	50 %	299883448
21	NC_014301	CA	3	6	18332	18337	50 %	0 %	0 %	50 %	299883448
22	NC_014301	GC	3	6	19396	19401	0 %	0 %	50 %	50 %	299883448
23	NC_014301	AT	3	6	21127	21132	50 %	50 %	0 %	0 %	299883449
24	NC_014301	TC	3	6	21246	21251	0 %	50 %	0 %	50 %	299883449
25	NC_014301	CG	3	6	23443	23448	0 %	0 %	50 %	50 %	299883452
26	NC_014301	GA	3	6	23614	23619	50 %	0 %	50 %	0 %	299883452
27	NC_014301	TG	3	6	25498	25503	0 %	50 %	50 %	0 %	299883454
28	NC_014301	CT	3	6	25775	25780	0 %	50 %	0 %	50 %	299883454
29	NC_014301	CT	3	6	25813	25818	0 %	50 %	0 %	50 %	299883454
30	NC_014301	GA	4	8	26645	26652	50 %	0 %	50 %	0 %	299883455
31	NC_014301	GT	3	6	29840	29845	0 %	50 %	50 %	0 %	299883457
32	NC_014301	GC	4	8	30824	30831	0 %	0 %	50 %	50 %	299883458
33	NC_014301	GA	3	6	30913	30918	50 %	0 %	50 %	0 %	299883458
34	NC_014301	GT	3	6	30926	30931	0 %	50 %	50 %	0 %	299883458
35	NC_014301	TC	3	6	30960	30965	0 %	50 %	0 %	50 %	299883458
36	NC_014301	TC	4	8	34605	34612	0 %	50 %	0 %	50 %	299883461
37	NC_014301	AC	3	6	39177	39182	50 %	0 %	0 %	50 %	299883466
38	NC_014301	GA	3	6	39235	39240	50 %	0 %	50 %	0 %	299883466
39	NC_014301	CA	3	6	39593	39598	50 %	0 %	0 %	50 %	299883467
40	NC_014301	GC	3	6	40287	40292	0 %	0 %	50 %	50 %	299883467
41	NC_014301	CT	3	6	40568	40573	0 %	50 %	0 %	50 %	299883468
42	NC_014301	CT	3	6	41659	41664	0 %	50 %	0 %	50 %	299883471
43	NC_014301	AT	4	8	41823	41830	50 %	50 %	0 %	0 %	299883471
44	NC_014301	GA	3	6	42421	42426	50 %	0 %	50 %	0 %	299883472
45	NC_014301	GC	4	8	42660	42667	0 %	0 %	50 %	50 %	299883472
46	NC_014301	CA	3	6	42776	42781	50 %	0 %	0 %	50 %	299883472
47	NC_014301	GA	3	6	42940	42945	50 %	0 %	50 %	0 %	299883472

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.