MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 plasmid 3

Total Repeats: 30

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014300	GAGAG	2	10	3569	3578	40 %	0 %	60 %	0 %	299883393
2	NC_014300	CGTCG	2	10	3619	3628	0 %	20 %	40 %	40 %	299883393
3	NC_014300	ACAGT	2	10	4635	4644	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_014300	AGTGC	2	10	5827	5836	20 %	20 %	40 %	20 %	299883397
5	NC_014300	CATCG	2	10	6075	6084	20 %	20 %	20 %	40 %	299883397
6	NC_014300	CAGAC	2	10	7056	7065	40 %	0 %	20 %	40 %	299883398
7	NC_014300	GCCGG	2	10	10180	10189	0 %	0 %	60 %	40 %	299883400
8	NC_014300	GTCCG	2	10	10621	10630	0 %	20 %	40 %	40 %	299883401
9	NC_014300	TCCGG	2	10	11488	11497	0 %	20 %	40 %	40 %	299883401
10	NC_014300	GCTCG	2	10	14364	14373	0 %	20 %	40 %	40 %	299883406
11	NC_014300	AGAGG	2	10	15349	15358	40 %	0 %	60 %	0 %	299883406
12	NC_014300	CTCGC	2	10	16135	16144	0 %	20 %	20 %	60 %	299883406
13	NC_014300	GTCCA	2	10	16634	16643	20 %	20 %	20 %	40 %	299883407
14	NC_014300	GGATT	2	10	16863	16872	20 %	40 %	40 %	0 %	299883408
15	NC_014300	CCATC	2	10	17297	17306	20 %	20 %	0 %	60 %	299883408
16	NC_014300	GGCGA	2	10	20002	20011	20 %	0 %	60 %	20 %	299883411
17	NC_014300	GTCGG	2	10	21379	21388	0 %	20 %	60 %	20 %	299883412
18	NC_014300	CGATC	2	10	21927	21936	20 %	20 %	20 %	40 %	299883412
19	NC_014300	TGGTG	2	10	24908	24917	0 %	40 %	60 %	0 %	299883413
20	NC_014300	CCGTT	2	10	32402	32411	0 %	40 %	20 %	40 %	299883420
21	NC_014300	TCCAA	2	10	34089	34098	40 %	20 %	0 %	40 %	299883422
22	NC_014300	GTAGC	2	10	35451	35460	20 %	20 %	40 %	20 %	299883423
23	NC_014300	GTTGT	2	10	35530	35539	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014300	CCGCC	2	10	37175	37184	0 %	0 %	20 %	80 %	299883425
25	NC_014300	CGGTC	2	10	39390	39399	0 %	20 %	40 %	40 %	299883426
26	NC_014300	GTCTT	2	10	40120	40129	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_014300	TTAGA	2	10	40960	40969	40 %	40 %	20 %	0 %	299883428
28	NC_014300	CGGTG	2	10	42267	42276	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
29	NC_014300	CGTCG	2	10	43396	43405	0 %	20 %	40 %	40 %	299883430
30	NC_014300	TGAGG	2	10	43885	43894	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.