MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 plasmid 3

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014300	CGTT	2	8	41	48	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014300	AAAC	2	8	127	134	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014300	ATCG	2	8	4568	4575	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_014300	GAGC	2	8	4908	4915	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014300	ATCG	2	8	6226	6233	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014300	TGAT	2	8	6691	6698	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014300	GCGT	2	8	6807	6814	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014300	CCAG	2	8	7256	7263	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_014300	TTGA	2	8	7512	7519	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014300	TGAC	2	8	16505	16512	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_014300	TCCG	2	8	17674	17681	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_014300	CGAA	2	8	20761	20768	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014300	TTCT	2	8	32583	32590	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_014300	GGCT	2	8	32689	32696	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_014300	CATG	2	8	32713	32720	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014300	TCAC	2	8	33285	33292	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014300	CCTA	2	8	33383	33390	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014300	TTGT	2	8	34732	34739	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014300	CGTC	2	8	34802	34809	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_014300	TCGG	2	8	34915	34922	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_014300	ACCC	2	8	35556	35563	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
22	NC_014300	GCGA	2	8	36281	36288	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014300	ATCA	2	8	36456	36463	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014300	TGAC	2	8	41240	41247	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_014300	TCTA	2	8	41397	41404	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_014300	GACC	2	8	41451	41458	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_014300	AAAT	2	8	42483	42490	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014300	TGGT	2	8	42691	42698	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014300	TCCT	2	8	42808	42815	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_014300	CGTT	2	8	42929	42936	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014300	AGAC	2	8	43187	43194	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_014300	CAAG	2	8	43200	43207	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_014300	TGCT	2	8	44427	44434	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.