MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 plasmid 3

Total Repeats: 734

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014300	GTA	2	6	211	216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883391
2	NC_014300	CAG	2	6	298	303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883391
3	NC_014300	GAA	2	6	352	357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883391
4	NC_014300	GGT	2	6	379	384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883391
5	NC_014300	CTT	2	6	406	411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883391
6	NC_014300	CGG	2	6	434	439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883391
7	NC_014300	ACC	2	6	444	449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	299883391
8	NC_014300	GAC	2	6	544	549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883391
9	NC_014300	CGG	2	6	555	560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883391
10	NC_014300	AGC	2	6	629	634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883391
11	NC_014300	CGC	2	6	690	695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883391
12	NC_014300	GTC	2	6	724	729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883391
13	NC_014300	TCA	2	6	860	865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883391
14	NC_014300	CTC	2	6	910	915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883391
15	NC_014300	CAT	2	6	955	960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883391
16	NC_014300	CCA	2	6	975	980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	299883391
17	NC_014300	CGA	2	6	1008	1013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883391
18	NC_014300	CGA	2	6	1077	1082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883391
19	NC_014300	GTA	2	6	1102	1107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883391
20	NC_014300	TCC	2	6	1148	1153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883391
21	NC_014300	CGT	2	6	1252	1257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883391
22	NC_014300	ACG	2	6	1359	1364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883391
23	NC_014300	CTG	2	6	1495	1500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883391
24	NC_014300	TCG	2	6	1508	1513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883391
25	NC_014300	GCG	2	6	1520	1525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883391
26	NC_014300	GTC	2	6	1546	1551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883391
27	NC_014300	TCG	2	6	1571	1576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883391
28	NC_014300	GGT	2	6	1761	1766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883391
29	NC_014300	GAG	2	6	1804	1809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883391
30	NC_014300	GCG	2	6	1871	1876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883391
31	NC_014300	GAT	2	6	1884	1889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883391
32	NC_014300	GTC	2	6	2014	2019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883391
33	NC_014300	CGA	2	6	2061	2066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883391
34	NC_014300	CCA	2	6	2076	2081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	299883391
35	NC_014300	GTC	2	6	2092	2097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_014300	TGG	2	6	2109	2114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014300	GTC	2	6	2207	2212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014300	ACG	2	6	2300	2305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014300	GCG	2	6	2441	2446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883392
40	NC_014300	GCC	2	6	2486	2491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883392
41	NC_014300	CGT	2	6	2513	2518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883392
42	NC_014300	CGG	2	6	2645	2650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883392
43	NC_014300	CTG	2	6	2655	2660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883392
44	NC_014300	CGG	2	6	2691	2696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883392
45	NC_014300	GGC	2	6	2724	2729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883392
46	NC_014300	CCT	2	6	2738	2743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883392
47	NC_014300	ATC	2	6	2758	2763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883392
48	NC_014300	CAT	3	9	2787	2795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883392
49	NC_014300	CAT	2	6	2802	2807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883392
50	NC_014300	CGA	2	6	2891	2896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883392
51	NC_014300	ACC	2	6	2947	2952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	299883392
52	NC_014300	CGT	2	6	2954	2959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883392
53	NC_014300	CCG	2	6	2994	2999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883392
54	NC_014300	GTC	2	6	3111	3116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883392
55	NC_014300	GGC	2	6	3135	3140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883392
56	NC_014300	TGG	2	6	3149	3154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883392
57	NC_014300	GTC	2	6	3273	3278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014300	AAC	2	6	3279	3284	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014300	CTT	2	6	3345	3350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883393
60	NC_014300	ACG	2	6	3387	3392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883393
61	NC_014300	CAG	2	6	3395	3400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883393
62	NC_014300	TCA	2	6	3440	3445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883393
63	NC_014300	ATA	2	6	3612	3617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	299883393
64	NC_014300	AAT	2	6	3637	3642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	299883393
65	NC_014300	TCA	2	6	3686	3691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883393
66	NC_014300	CGA	2	6	3714	3719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883393
67	NC_014300	CAG	2	6	3880	3885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883393
68	NC_014300	GAT	2	6	3889	3894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883393
69	NC_014300	CGT	2	6	3906	3911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883393
70	NC_014300	CTG	2	6	4007	4012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883393
71	NC_014300	AGA	2	6	4033	4038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014300	GTG	2	6	4055	4060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014300	GCC	2	6	4243	4248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883394
74	NC_014300	GTG	2	6	4260	4265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883394
75	NC_014300	CGA	2	6	4269	4274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883394
76	NC_014300	GAG	2	6	4429	4434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883394
77	NC_014300	CTC	2	6	4544	4549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_014300	GAC	2	6	4675	4680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014300	ATG	2	6	4764	4769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014300	CTT	2	6	4771	4776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_014300	GGC	2	6	4864	4869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014300	CGC	2	6	4937	4942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_014300	TTC	2	6	5003	5008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883395
84	NC_014300	TCG	2	6	5227	5232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883395
85	NC_014300	GAC	2	6	5337	5342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883396
86	NC_014300	GAT	2	6	5418	5423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883396
87	NC_014300	GAT	2	6	5538	5543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883397
88	NC_014300	GTC	2	6	5569	5574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883397
89	NC_014300	CAG	2	6	5659	5664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883397
90	NC_014300	GCG	2	6	5700	5705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883397
91	NC_014300	GTG	2	6	5812	5817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883397
92	NC_014300	CGG	2	6	5856	5861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883397
93	NC_014300	GGC	2	6	5905	5910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883397
94	NC_014300	TGG	2	6	5948	5953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883397
95	NC_014300	CGT	2	6	5982	5987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883397
96	NC_014300	ACG	2	6	5995	6000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883397
97	NC_014300	TCG	3	9	6231	6239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014300	CAC	2	6	6454	6459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_014300	TCG	2	6	6592	6597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014300	GTG	2	6	6608	6613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014300	TCG	2	6	6620	6625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014300	CCT	2	6	6629	6634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_014300	TGG	2	6	6715	6720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014300	GTC	2	6	6908	6913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_014300	GAT	2	6	6926	6931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014300	GGA	2	6	6976	6981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883398
107	NC_014300	GCG	2	6	7024	7029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883398
108	NC_014300	GAC	2	6	7088	7093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883398
109	NC_014300	GAC	2	6	7238	7243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883398
110	NC_014300	TCC	2	6	7406	7411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_014300	TCG	2	6	7536	7541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883399
112	NC_014300	CGT	2	6	7601	7606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883399
113	NC_014300	TCG	2	6	7660	7665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883399
114	NC_014300	GAC	2	6	7739	7744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883399
115	NC_014300	CCG	2	6	7752	7757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883399
116	NC_014300	CTG	2	6	7792	7797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883399
117	NC_014300	GCA	2	6	7824	7829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883399
118	NC_014300	TCC	2	6	7897	7902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883399
119	NC_014300	CGG	2	6	7924	7929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883399
120	NC_014300	CCA	2	6	7936	7941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	299883399
121	NC_014300	GAC	2	6	8146	8151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883399
122	NC_014300	CCA	2	6	8153	8158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	299883399
123	NC_014300	CGG	2	6	8210	8215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883400
124	NC_014300	CGA	2	6	8226	8231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883400
125	NC_014300	TCG	2	6	8235	8240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883400
126	NC_014300	GTT	2	6	8416	8421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	299883400
127	NC_014300	CGA	2	6	8424	8429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883400
128	NC_014300	GAT	2	6	8431	8436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883400
129	NC_014300	CTC	2	6	8551	8556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883400
130	NC_014300	ATC	2	6	8669	8674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883400
131	NC_014300	TGG	2	6	8714	8719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883400
132	NC_014300	CTC	2	6	8722	8727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883400
133	NC_014300	CTT	2	6	8814	8819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883400
134	NC_014300	ACG	2	6	8826	8831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883400
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137	NC_014300	GTC	2	6	8894	8899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883400
138	NC_014300	TCG	2	6	8975	8980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883400
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143	NC_014300	CTG	2	6	9418	9423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883400
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162	NC_014300	GGT	2	6	10207	10212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883400
163	NC_014300	TAG	2	6	10263	10268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883400
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256	NC_014300	GCC	2	6	16003	16008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883406
257	NC_014300	CGA	2	6	16026	16031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883406
258	NC_014300	GTG	2	6	16042	16047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883406
259	NC_014300	AGA	2	6	16079	16084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883406
260	NC_014300	ACA	2	6	16115	16120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	299883406
261	NC_014300	GAT	2	6	16125	16130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883406
262	NC_014300	CTG	2	6	16216	16221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883406
263	NC_014300	CGG	2	6	16225	16230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883406
264	NC_014300	GCT	2	6	16254	16259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883406
265	NC_014300	TCC	2	6	16265	16270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883406
266	NC_014300	GAC	2	6	16424	16429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
267	NC_014300	CGT	2	6	16544	16549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
268	NC_014300	CAT	2	6	16676	16681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883407
269	NC_014300	TCG	2	6	16694	16699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
270	NC_014300	AAC	2	6	16944	16949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	299883408
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272	NC_014300	CGA	2	6	16975	16980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883408
273	NC_014300	CAG	2	6	17009	17014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883408
274	NC_014300	ACC	2	6	17015	17020	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	299883408
275	NC_014300	GCC	2	6	17031	17036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883408
276	NC_014300	CAT	2	6	17048	17053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883408
277	NC_014300	GTT	2	6	17234	17239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	299883408
278	NC_014300	ATC	3	9	17246	17254	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883408
279	NC_014300	TGA	2	6	17263	17268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883408
280	NC_014300	AAC	2	6	17322	17327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	299883408
281	NC_014300	TCG	3	9	17398	17406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883408
282	NC_014300	ATT	2	6	17573	17578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_014300	GTT	2	6	17603	17608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
284	NC_014300	ACG	2	6	17623	17628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
285	NC_014300	AAT	2	6	17690	17695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_014300	TCT	2	6	17698	17703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
287	NC_014300	TTC	2	6	17762	17767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_014300	CAA	2	6	17778	17783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_014300	ATG	2	6	17793	17798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
290	NC_014300	ACA	2	6	17822	17827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	299883409
291	NC_014300	TCG	2	6	17829	17834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883409
292	NC_014300	ATC	2	6	17894	17899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883409
293	NC_014300	TCA	2	6	17910	17915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883409
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321	NC_014300	CCT	2	6	19302	19307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883410
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330	NC_014300	GGT	2	6	19922	19927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883411
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337	NC_014300	CTT	2	6	20796	20801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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340	NC_014300	CTC	2	6	20905	20910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883412
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343	NC_014300	AGC	2	6	20945	20950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883412
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380	NC_014300	CGG	2	6	22754	22759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883412
381	NC_014300	CAT	2	6	22879	22884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883412
382	NC_014300	GGC	2	6	22899	22904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883412
383	NC_014300	TCG	2	6	22910	22915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883412
384	NC_014300	AGC	2	6	22916	22921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883412
385	NC_014300	GTA	2	6	22924	22929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883412
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