MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 plasmid 3

Total Repeats: 623

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014300	GTA	2	6	211	216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883391
2	NC_014300	CAG	2	6	298	303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883391
3	NC_014300	GAA	2	6	352	357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883391
4	NC_014300	GGT	2	6	379	384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883391
5	NC_014300	CTT	2	6	406	411	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883391
6	NC_014300	CGG	2	6	434	439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883391
7	NC_014300	ACC	2	6	444	449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	299883391
8	NC_014300	GAC	2	6	544	549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883391
9	NC_014300	CGG	2	6	555	560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883391
10	NC_014300	AGC	2	6	629	634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883391
11	NC_014300	CGC	2	6	690	695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883391
12	NC_014300	GTC	2	6	724	729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883391
13	NC_014300	TCA	2	6	860	865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883391
14	NC_014300	CTC	2	6	910	915	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883391
15	NC_014300	CAT	2	6	955	960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883391
16	NC_014300	CCA	2	6	975	980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	299883391
17	NC_014300	CGA	2	6	1008	1013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883391
18	NC_014300	CGA	2	6	1077	1082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883391
19	NC_014300	GTA	2	6	1102	1107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883391
20	NC_014300	TCC	2	6	1148	1153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883391
21	NC_014300	CGT	2	6	1252	1257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883391
22	NC_014300	ACG	2	6	1359	1364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883391
23	NC_014300	CTG	2	6	1495	1500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883391
24	NC_014300	TCG	2	6	1508	1513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883391
25	NC_014300	GCG	2	6	1520	1525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883391
26	NC_014300	GTC	2	6	1546	1551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883391
27	NC_014300	TCG	2	6	1571	1576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883391
28	NC_014300	GGT	2	6	1761	1766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883391
29	NC_014300	GAG	2	6	1804	1809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883391
30	NC_014300	GCG	2	6	1871	1876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883391
31	NC_014300	GAT	2	6	1884	1889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883391
32	NC_014300	GTC	2	6	2014	2019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883391
33	NC_014300	CGA	2	6	2061	2066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883391
34	NC_014300	CCA	2	6	2076	2081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	299883391
35	NC_014300	GCG	2	6	2441	2446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883392
36	NC_014300	GCC	2	6	2486	2491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883392
37	NC_014300	CGT	2	6	2513	2518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883392
38	NC_014300	CGG	2	6	2645	2650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883392
39	NC_014300	CTG	2	6	2655	2660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883392
40	NC_014300	CGG	2	6	2691	2696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883392
41	NC_014300	GGC	2	6	2724	2729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883392
42	NC_014300	CCT	2	6	2738	2743	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883392
43	NC_014300	ATC	2	6	2758	2763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883392
44	NC_014300	CAT	3	9	2787	2795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883392
45	NC_014300	CAT	2	6	2802	2807	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883392
46	NC_014300	CGA	2	6	2891	2896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883392
47	NC_014300	ACC	2	6	2947	2952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	299883392
48	NC_014300	CGT	2	6	2954	2959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883392
49	NC_014300	CCG	2	6	2994	2999	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883392
50	NC_014300	GTC	2	6	3111	3116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883392
51	NC_014300	GGC	2	6	3135	3140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883392
52	NC_014300	TGG	2	6	3149	3154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883392
53	NC_014300	CTT	2	6	3345	3350	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883393
54	NC_014300	ACG	2	6	3387	3392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883393
55	NC_014300	CAG	2	6	3395	3400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883393
56	NC_014300	TCA	2	6	3440	3445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883393
57	NC_014300	ATA	2	6	3612	3617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	299883393
58	NC_014300	AAT	2	6	3637	3642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	299883393
59	NC_014300	TCA	2	6	3686	3691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883393
60	NC_014300	CGA	2	6	3714	3719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883393
61	NC_014300	CAG	2	6	3880	3885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883393
62	NC_014300	GAT	2	6	3889	3894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883393
63	NC_014300	CGT	2	6	3906	3911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883393
64	NC_014300	CTG	2	6	4007	4012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883393
65	NC_014300	GCC	2	6	4243	4248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883394
66	NC_014300	GTG	2	6	4260	4265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883394
67	NC_014300	CGA	2	6	4269	4274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883394
68	NC_014300	GAG	2	6	4429	4434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883394
69	NC_014300	TTC	2	6	5003	5008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883395
70	NC_014300	TCG	2	6	5227	5232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883395
71	NC_014300	GAC	2	6	5337	5342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883396
72	NC_014300	GAT	2	6	5418	5423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883396
73	NC_014300	GAT	2	6	5538	5543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883397
74	NC_014300	GTC	2	6	5569	5574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883397
75	NC_014300	CAG	2	6	5659	5664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883397
76	NC_014300	GCG	2	6	5700	5705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883397
77	NC_014300	GTG	2	6	5812	5817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883397
78	NC_014300	CGG	2	6	5856	5861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883397
79	NC_014300	GGC	2	6	5905	5910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883397
80	NC_014300	TGG	2	6	5948	5953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883397
81	NC_014300	CGT	2	6	5982	5987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883397
82	NC_014300	ACG	2	6	5995	6000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883397
83	NC_014300	GGA	2	6	6976	6981	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883398
84	NC_014300	GCG	2	6	7024	7029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883398
85	NC_014300	GAC	2	6	7088	7093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883398
86	NC_014300	GAC	2	6	7238	7243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883398
87	NC_014300	TCG	2	6	7536	7541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883399
88	NC_014300	CGT	2	6	7601	7606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883399
89	NC_014300	TCG	2	6	7660	7665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883399
90	NC_014300	GAC	2	6	7739	7744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883399
91	NC_014300	CCG	2	6	7752	7757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883399
92	NC_014300	CTG	2	6	7792	7797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883399
93	NC_014300	GCA	2	6	7824	7829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883399
94	NC_014300	TCC	2	6	7897	7902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883399
95	NC_014300	CGG	2	6	7924	7929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883399
96	NC_014300	CCA	2	6	7936	7941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	299883399
97	NC_014300	GAC	2	6	8146	8151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883399
98	NC_014300	CCA	2	6	8153	8158	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	299883399
99	NC_014300	CGG	2	6	8210	8215	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883400
100	NC_014300	CGA	2	6	8226	8231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883400
101	NC_014300	TCG	2	6	8235	8240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883400
102	NC_014300	GTT	2	6	8416	8421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	299883400
103	NC_014300	CGA	2	6	8424	8429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883400
104	NC_014300	GAT	2	6	8431	8436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883400
105	NC_014300	CTC	2	6	8551	8556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883400
106	NC_014300	ATC	2	6	8669	8674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883400
107	NC_014300	TGG	2	6	8714	8719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883400
108	NC_014300	CTC	2	6	8722	8727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883400
109	NC_014300	CTT	2	6	8814	8819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883400
110	NC_014300	ACG	2	6	8826	8831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883400
111	NC_014300	GAG	2	6	8866	8871	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883400
112	NC_014300	CCG	2	6	8879	8884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883400
113	NC_014300	GTC	2	6	8894	8899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883400
114	NC_014300	TCG	2	6	8975	8980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883400
115	NC_014300	CGA	2	6	9087	9092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883400
116	NC_014300	GAC	2	6	9280	9285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883400
117	NC_014300	ATG	2	6	9299	9304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883400
118	NC_014300	CCG	2	6	9378	9383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883400
119	NC_014300	CTG	2	6	9418	9423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883400
120	NC_014300	CGA	2	6	9432	9437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883400
121	NC_014300	CGT	2	6	9457	9462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883400
122	NC_014300	CTC	2	6	9463	9468	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883400
123	NC_014300	CGT	2	6	9472	9477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883400
124	NC_014300	CGA	2	6	9522	9527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883400
125	NC_014300	ATC	2	6	9572	9577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883400
126	NC_014300	TCG	2	6	9581	9586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883400
127	NC_014300	ACG	2	6	9650	9655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883400
128	NC_014300	TCA	2	6	9671	9676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883400
129	NC_014300	CGC	2	6	9696	9701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	299883400
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252	NC_014300	TGA	2	6	18138	18143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883409
253	NC_014300	TCG	2	6	18171	18176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883409
254	NC_014300	CTC	2	6	18182	18187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883409
255	NC_014300	ATC	2	6	18194	18199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883409
256	NC_014300	GCT	2	6	18217	18222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883409
257	NC_014300	CAG	2	6	18421	18426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883409
258	NC_014300	CGA	2	6	18439	18444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883409
259	NC_014300	GGC	2	6	18458	18463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883409
260	NC_014300	GAT	2	6	18502	18507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883409
261	NC_014300	GCT	2	6	18604	18609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883409
262	NC_014300	TCA	2	6	18651	18656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883409
263	NC_014300	TCG	2	6	18660	18665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883409
264	NC_014300	GCA	2	6	18666	18671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883409
265	NC_014300	GCG	3	9	18705	18713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883409
266	NC_014300	TCA	2	6	18753	18758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883409
267	NC_014300	TAC	2	6	18788	18793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883409
268	NC_014300	TGA	2	6	18804	18809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883409
269	NC_014300	TTC	2	6	18827	18832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883409
270	NC_014300	CGG	2	6	18904	18909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883409
271	NC_014300	TCT	2	6	18993	18998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883409
272	NC_014300	CGG	2	6	19007	19012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883409
273	NC_014300	CGA	2	6	19063	19068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883409
274	NC_014300	GAT	2	6	19091	19096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883409
275	NC_014300	CCT	2	6	19302	19307	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883410
276	NC_014300	TTC	2	6	19342	19347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	299883410
277	NC_014300	CGT	2	6	19368	19373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883410
278	NC_014300	CGA	2	6	19533	19538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883410
279	NC_014300	AGC	2	6	19601	19606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883410
280	NC_014300	TGA	2	6	19678	19683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	299883410
281	NC_014300	TGC	2	6	19729	19734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883411
282	NC_014300	TCG	2	6	19815	19820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883411
283	NC_014300	GCT	2	6	19865	19870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883411
284	NC_014300	GGT	2	6	19922	19927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	299883411
285	NC_014300	CGG	2	6	20016	20021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	299883411
286	NC_014300	AGG	2	6	20220	20225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	299883411
287	NC_014300	CTG	2	6	20411	20416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883411
288	NC_014300	CTA	2	6	20481	20486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883411
289	NC_014300	TCA	2	6	20517	20522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883411
290	NC_014300	CTC	2	6	20905	20910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	299883412
291	NC_014300	TCG	2	6	20915	20920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883412
292	NC_014300	GTC	3	9	20929	20937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883412
293	NC_014300	AGC	2	6	20945	20950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883412
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326	NC_014300	CGA	2	6	22669	22674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883412
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374	NC_014300	ATT	2	6	24936	24941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	299883413
375	NC_014300	CGT	2	6	24986	24991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883413
376	NC_014300	ACA	2	6	25109	25114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	299883413
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378	NC_014300	TGC	2	6	25165	25170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883413
379	NC_014300	CAT	3	9	25191	25199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	299883413
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496	NC_014300	CGT	2	6	32505	32510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	299883420
497	NC_014300	GAA	2	6	32892	32897	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	299883421
498	NC_014300	CCA	2	6	32898	32903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	299883421
499	NC_014300	AGC	2	6	33017	33022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883421
500	NC_014300	CGA	2	6	33048	33053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	299883421

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