MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 plasmid 3

Total Repeats: 77

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014300	AG	3	6	144	149	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014300	GA	3	6	716	721	50 %	0 %	50 %	0 %	299883391
3	NC_014300	CG	3	6	1038	1043	0 %	0 %	50 %	50 %	299883391
4	NC_014300	GA	3	6	1458	1463	50 %	0 %	50 %	0 %	299883391
5	NC_014300	CG	3	6	1613	1618	0 %	0 %	50 %	50 %	299883391
6	NC_014300	CG	3	6	1687	1692	0 %	0 %	50 %	50 %	299883391
7	NC_014300	CG	3	6	2747	2752	0 %	0 %	50 %	50 %	299883392
8	NC_014300	CG	3	6	3084	3089	0 %	0 %	50 %	50 %	299883392
9	NC_014300	TC	3	6	3849	3854	0 %	50 %	0 %	50 %	299883393
10	NC_014300	TG	3	6	4346	4351	0 %	50 %	50 %	0 %	299883394
11	NC_014300	TG	3	6	4358	4363	0 %	50 %	50 %	0 %	299883394
12	NC_014300	GT	3	6	4615	4620	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014300	TC	3	6	5090	5095	0 %	50 %	0 %	50 %	299883395
14	NC_014300	TC	3	6	5180	5185	0 %	50 %	0 %	50 %	299883395
15	NC_014300	TC	3	6	5240	5245	0 %	50 %	0 %	50 %	299883395
16	NC_014300	TC	3	6	5270	5275	0 %	50 %	0 %	50 %	299883395
17	NC_014300	GC	3	6	5319	5324	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014300	GA	3	6	5642	5647	50 %	0 %	50 %	0 %	299883397
19	NC_014300	CG	3	6	6102	6107	0 %	0 %	50 %	50 %	299883397
20	NC_014300	AG	3	6	6773	6778	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014300	AT	4	8	6821	6828	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014300	AC	3	6	7246	7251	50 %	0 %	0 %	50 %	299883398
23	NC_014300	AG	3	6	7415	7420	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014300	GA	3	6	7674	7679	50 %	0 %	50 %	0 %	299883399
25	NC_014300	GA	3	6	9998	10003	50 %	0 %	50 %	0 %	299883400
26	NC_014300	GA	3	6	10094	10099	50 %	0 %	50 %	0 %	299883400
27	NC_014300	TG	3	6	12539	12544	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014300	AG	3	6	15714	15719	50 %	0 %	50 %	0 %	299883406
29	NC_014300	CG	3	6	15841	15846	0 %	0 %	50 %	50 %	299883406
30	NC_014300	TC	3	6	16290	16295	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014300	CA	3	6	16308	16313	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_014300	CG	3	6	16534	16539	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_014300	AG	3	6	17645	17650	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014300	CT	3	6	17756	17761	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014300	TC	3	6	19893	19898	0 %	50 %	0 %	50 %	299883411
36	NC_014300	CG	3	6	20226	20231	0 %	0 %	50 %	50 %	299883411
37	NC_014300	AG	3	6	20295	20300	50 %	0 %	50 %	0 %	299883411
38	NC_014300	CA	3	6	20737	20742	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014300	AT	3	6	21090	21095	50 %	50 %	0 %	0 %	299883412
40	NC_014300	GA	3	6	21300	21305	50 %	0 %	50 %	0 %	299883412
41	NC_014300	CT	3	6	21611	21616	0 %	50 %	0 %	50 %	299883412
42	NC_014300	CG	3	6	22486	22491	0 %	0 %	50 %	50 %	299883412
43	NC_014300	GT	3	6	25144	25149	0 %	50 %	50 %	0 %	299883413
44	NC_014300	CA	3	6	25748	25753	50 %	0 %	0 %	50 %	299883413
45	NC_014300	AG	3	6	28639	28644	50 %	0 %	50 %	0 %	299883415
46	NC_014300	CG	3	6	29079	29084	0 %	0 %	50 %	50 %	299883415
47	NC_014300	GT	3	6	29255	29260	0 %	50 %	50 %	0 %	299883415
48	NC_014300	GC	3	6	29959	29964	0 %	0 %	50 %	50 %	299883416
49	NC_014300	GC	3	6	30834	30839	0 %	0 %	50 %	50 %	299883419
50	NC_014300	TC	3	6	31724	31729	0 %	50 %	0 %	50 %	299883419
51	NC_014300	GC	3	6	33352	33357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_014300	CG	3	6	35277	35282	0 %	0 %	50 %	50 %	299883423
53	NC_014300	CT	3	6	35542	35547	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_014300	TA	3	6	35548	35553	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014300	AG	3	6	35756	35761	50 %	0 %	50 %	0 %	299883424
56	NC_014300	AG	3	6	37232	37237	50 %	0 %	50 %	0 %	299883425
57	NC_014300	GT	3	6	37781	37786	0 %	50 %	50 %	0 %	299883425
58	NC_014300	CG	3	6	39048	39053	0 %	0 %	50 %	50 %	299883426
59	NC_014300	AG	3	6	40090	40095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014300	TA	3	6	40208	40213	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014300	CG	3	6	40315	40320	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_014300	GC	3	6	40362	40367	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_014300	AG	3	6	41084	41089	50 %	0 %	50 %	0 %	299883428
64	NC_014300	GA	3	6	41324	41329	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014300	CT	3	6	41523	41528	0 %	50 %	0 %	50 %	299883429
66	NC_014300	GT	3	6	41687	41692	0 %	50 %	50 %	0 %	299883429
67	NC_014300	GC	3	6	41804	41809	0 %	0 %	50 %	50 %	299883429
68	NC_014300	CG	3	6	41988	41993	0 %	0 %	50 %	50 %	299883429
69	NC_014300	CT	3	6	42617	42622	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_014300	TG	3	6	42722	42727	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014300	GT	3	6	42955	42960	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014300	GA	3	6	43304	43309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014300	GA	3	6	43352	43357	50 %	0 %	50 %	0 %	299883430
74	NC_014300	CG	3	6	43702	43707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_014300	CA	3	6	43712	43717	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_014300	GT	3	6	44443	44448	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014300	AG	4	8	44559	44566	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.