MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 plasmid 2

Total Repeats: 1046

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014299	ATCT	2	8	85	92	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014299	ATCC	2	8	1004	1011	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_014299	ATAG	2	8	1210	1217	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014299	CATA	2	8	1218	1225	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014299	TAAT	2	8	1681	1688	50 %	50 %	0 %	0 %	300712771
6	NC_014299	GAGT	2	8	3970	3977	25 %	25 %	50 %	0 %	300712775
7	NC_014299	CAAA	2	8	4063	4070	75 %	0 %	0 %	25 %	300712775
8	NC_014299	TCGG	2	8	4303	4310	0 %	25 %	50 %	25 %	300712776
9	NC_014299	CGCC	2	8	4677	4684	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10	NC_014299	GAAC	2	8	5083	5090	50 %	0 %	25 %	25 %	300712777
11	NC_014299	GGTG	2	8	5168	5175	0 %	25 %	75 %	0 %	300712777
12	NC_014299	AGAC	2	8	5830	5837	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014299	GCAA	2	8	6015	6022	50 %	0 %	25 %	25 %	300712778
14	NC_014299	CGGA	2	8	6025	6032	25 %	0 %	50 %	25 %	300712778
15	NC_014299	CGAA	2	8	6226	6233	50 %	0 %	25 %	25 %	300712779
16	NC_014299	ATCT	2	8	7036	7043	25 %	50 %	0 %	25 %	300712779
17	NC_014299	ACTC	2	8	7136	7143	25 %	25 %	0 %	50 %	300712779
18	NC_014299	AAGT	2	8	7251	7258	50 %	25 %	25 %	0 %	300712779
19	NC_014299	CTCG	2	8	7387	7394	0 %	25 %	25 %	50 %	300712779
20	NC_014299	AAGG	2	8	7753	7760	50 %	0 %	50 %	0 %	300712779
21	NC_014299	AGCG	2	8	8650	8657	25 %	0 %	50 %	25 %	300712779
22	NC_014299	ACCA	2	8	8939	8946	50 %	0 %	0 %	50 %	300712779
23	NC_014299	GATA	2	8	8991	8998	50 %	25 %	25 %	0 %	300712779
24	NC_014299	AGTG	2	8	9087	9094	25 %	25 %	50 %	0 %	300712779
25	NC_014299	ACTC	2	8	9321	9328	25 %	25 %	0 %	50 %	300712779
26	NC_014299	ATCA	2	8	9667	9674	50 %	25 %	0 %	25 %	300712779
27	NC_014299	AGAC	2	8	10013	10020	50 %	0 %	25 %	25 %	300712779
28	NC_014299	CGTT	2	8	10079	10086	0 %	50 %	25 %	25 %	300712779
29	NC_014299	CGAA	2	8	10501	10508	50 %	0 %	25 %	25 %	300712780
30	NC_014299	ACAA	2	8	10628	10635	75 %	0 %	0 %	25 %	300712780
31	NC_014299	GTCA	2	8	10902	10909	25 %	25 %	25 %	25 %	300712780
32	NC_014299	TCGA	2	8	10955	10962	25 %	25 %	25 %	25 %	300712780
33	NC_014299	TGCG	2	8	11517	11524	0 %	25 %	50 %	25 %	300712780
34	NC_014299	AGAT	2	8	11676	11683	50 %	25 %	25 %	0 %	300712780
35	NC_014299	GATC	2	8	12040	12047	25 %	25 %	25 %	25 %	300712780
36	NC_014299	CCGA	2	8	12262	12269	25 %	0 %	25 %	50 %	300712780
37	NC_014299	AGGT	2	8	12423	12430	25 %	25 %	50 %	0 %	300712780
38	NC_014299	TCGA	2	8	12511	12518	25 %	25 %	25 %	25 %	300712780
39	NC_014299	AGTC	2	8	13354	13361	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014299	AGTT	2	8	13400	13407	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014299	GAAT	2	8	13646	13653	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014299	CGGT	2	8	14982	14989	0 %	25 %	50 %	25 %	300712782
43	NC_014299	CGTC	2	8	15050	15057	0 %	25 %	25 %	50 %	300712782
44	NC_014299	TCTA	2	8	15399	15406	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_014299	TACT	2	8	15407	15414	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_014299	TGTA	2	8	15456	15463	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014299	TCCA	2	8	15684	15691	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_014299	GCAC	2	8	16727	16734	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_014299	GTGC	2	8	17381	17388	0 %	25 %	50 %	25 %	300712787
50	NC_014299	TTGA	2	8	18139	18146	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014299	GGGT	2	8	18551	18558	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014299	GTTT	2	8	18567	18574	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014299	AACG	2	8	19346	19353	50 %	0 %	25 %	25 %	300712789
54	NC_014299	TCCC	2	8	19795	19802	0 %	25 %	0 %	75 %	300712790
55	NC_014299	GTGG	2	8	20618	20625	0 %	25 %	75 %	0 %	300712790
56	NC_014299	TTTG	2	8	21327	21334	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014299	TCGG	2	8	21565	21572	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_014299	TCGA	2	8	21782	21789	25 %	25 %	25 %	25 %	300712792
59	NC_014299	GCTC	2	8	23013	23020	0 %	25 %	25 %	50 %	300712793
60	NC_014299	ACGA	2	8	23427	23434	50 %	0 %	25 %	25 %	300712794
61	NC_014299	CGAA	2	8	25332	25339	50 %	0 %	25 %	25 %	300712794
62	NC_014299	AGCG	2	8	25421	25428	25 %	0 %	50 %	25 %	300712794
63	NC_014299	CTTG	2	8	25919	25926	0 %	50 %	25 %	25 %	300712794
64	NC_014299	TTGA	2	8	25944	25951	25 %	50 %	25 %	0 %	300712794
65	NC_014299	CGGA	2	8	26064	26071	25 %	0 %	50 %	25 %	300712794
66	NC_014299	TCGC	2	8	26161	26168	0 %	25 %	25 %	50 %	300712794
67	NC_014299	AAAT	2	8	27254	27261	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014299	GCGA	2	8	27831	27838	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_014299	CGAG	3	12	27892	27903	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_014299	GTGA	2	8	27959	27966	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014299	CGAG	2	8	28418	28425	25 %	0 %	50 %	25 %	300712795
72	NC_014299	TTCA	2	8	28768	28775	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
73	NC_014299	CGGA	2	8	29136	29143	25 %	0 %	50 %	25 %	300712796
74	NC_014299	TGAC	2	8	29549	29556	25 %	25 %	25 %	25 %	300712796
75	NC_014299	GCCG	2	8	29799	29806	0 %	0 %	50 %	50 %	300712797
76	NC_014299	AAGC	2	8	30039	30046	50 %	0 %	25 %	25 %	300712797
77	NC_014299	GTCG	2	8	31133	31140	0 %	25 %	50 %	25 %	300712798
78	NC_014299	CGTT	2	8	32752	32759	0 %	50 %	25 %	25 %	300712800
79	NC_014299	GTCG	2	8	32879	32886	0 %	25 %	50 %	25 %	300712800
80	NC_014299	TTGA	2	8	33532	33539	25 %	50 %	25 %	0 %	300712801
81	NC_014299	AGCC	2	8	34417	34424	25 %	0 %	25 %	50 %	300712801
82	NC_014299	GCGA	2	8	34551	34558	25 %	0 %	50 %	25 %	300712801
83	NC_014299	CTCG	2	8	34593	34600	0 %	25 %	25 %	50 %	300712801
84	NC_014299	GACG	2	8	34635	34642	25 %	0 %	50 %	25 %	300712801
85	NC_014299	TGCG	2	8	34740	34747	0 %	25 %	50 %	25 %	300712801
86	NC_014299	CCGA	2	8	34827	34834	25 %	0 %	25 %	50 %	300712801
87	NC_014299	ATTC	2	8	34847	34854	25 %	50 %	0 %	25 %	300712801
88	NC_014299	AGTC	2	8	35187	35194	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_014299	GTTG	2	8	35201	35208	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014299	TTGG	2	8	35319	35326	0 %	50 %	50 %	0 %	300712802
91	NC_014299	TGAA	2	8	35926	35933	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014299	TGCC	2	8	35957	35964	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
93	NC_014299	ATTC	2	8	35983	35990	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_014299	CGCT	2	8	36572	36579	0 %	25 %	25 %	50 %	300712803
95	NC_014299	GCCG	2	8	36645	36652	0 %	0 %	50 %	50 %	300712803
96	NC_014299	CGAT	2	8	37776	37783	25 %	25 %	25 %	25 %	300712804
97	NC_014299	TCTG	3	12	38762	38773	0 %	50 %	25 %	25 %	300712805
98	NC_014299	GACC	2	8	40165	40172	25 %	0 %	25 %	50 %	300712806
99	NC_014299	GGTC	2	8	41641	41648	0 %	25 %	50 %	25 %	300712807
100	NC_014299	TTTG	2	8	41761	41768	0 %	75 %	25 %	0 %	300712807
101	NC_014299	CGAT	2	8	41900	41907	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_014299	GTTC	2	8	41925	41932	0 %	50 %	25 %	25 %	300712808
103	NC_014299	GTCC	2	8	42262	42269	0 %	25 %	25 %	50 %	300712808
104	NC_014299	TGGA	2	8	42704	42711	25 %	25 %	50 %	0 %	300712809
105	NC_014299	ACCC	2	8	42819	42826	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
106	NC_014299	AAGT	2	8	42930	42937	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014299	TGTT	2	8	43075	43082	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014299	TTTC	2	8	43292	43299	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_014299	CATT	2	8	43750	43757	25 %	50 %	0 %	25 %	300712810
110	NC_014299	GGAG	2	8	44113	44120	25 %	0 %	75 %	0 %	300712810
111	NC_014299	AGCA	2	8	44145	44152	50 %	0 %	25 %	25 %	300712810
112	NC_014299	ATCT	2	8	44544	44551	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_014299	CATC	2	8	44856	44863	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_014299	GCTG	2	8	45038	45045	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_014299	AACC	2	8	45283	45290	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_014299	TCGA	2	8	46089	46096	25 %	25 %	25 %	25 %	300712812
117	NC_014299	GGAG	2	8	46251	46258	25 %	0 %	75 %	0 %	300712812
118	NC_014299	CCGA	2	8	46259	46266	25 %	0 %	25 %	50 %	300712812
119	NC_014299	GTCT	2	8	46347	46354	0 %	50 %	25 %	25 %	300712812
120	NC_014299	TGAC	2	8	46358	46365	25 %	25 %	25 %	25 %	300712812
121	NC_014299	CGGT	2	8	47593	47600	0 %	25 %	50 %	25 %	300712814
122	NC_014299	GGGA	2	8	48017	48024	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014299	CGGT	2	8	48472	48479	0 %	25 %	50 %	25 %	300712815
124	NC_014299	TGAG	2	8	49054	49061	25 %	25 %	50 %	0 %	300712815
125	NC_014299	CTGG	2	8	49208	49215	0 %	25 %	50 %	25 %	300712815
126	NC_014299	TCCC	2	8	49580	49587	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
127	NC_014299	CTTG	2	8	50169	50176	0 %	50 %	25 %	25 %	300712816
128	NC_014299	TTTG	2	8	50405	50412	0 %	75 %	25 %	0 %	300712816
129	NC_014299	CGAG	2	8	51065	51072	25 %	0 %	50 %	25 %	300712816
130	NC_014299	GTAG	2	8	51102	51109	25 %	25 %	50 %	0 %	300712816
131	NC_014299	GTTG	2	8	51245	51252	0 %	50 %	50 %	0 %	300712816
132	NC_014299	AGGA	2	8	51646	51653	50 %	0 %	50 %	0 %	300712816
133	NC_014299	GTCT	2	8	51786	51793	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_014299	CGTG	2	8	52487	52494	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_014299	ATTG	2	8	52602	52609	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014299	AGTG	2	8	52679	52686	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014299	GCTG	2	8	52733	52740	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_014299	TCGT	2	8	52926	52933	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_014299	TCTG	2	8	53085	53092	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_014299	ATCC	2	8	53250	53257	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_014299	TAGC	2	8	53280	53287	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_014299	ATTC	2	8	53528	53535	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_014299	ATTT	2	8	53665	53672	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014299	TCCA	2	8	54100	54107	25 %	25 %	0 %	50 %	300712817
145	NC_014299	CGAG	2	8	54629	54636	25 %	0 %	50 %	25 %	300712817
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