MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 plasmid 2

Total Repeats: 422

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014299	AC	3	6	1882	1887	50 %	0 %	0 %	50 %	300712771
2	NC_014299	GA	3	6	1940	1945	50 %	0 %	50 %	0 %	300712771
3	NC_014299	CA	3	6	2298	2303	50 %	0 %	0 %	50 %	300712772
4	NC_014299	GC	3	6	2992	2997	0 %	0 %	50 %	50 %	300712772
5	NC_014299	CT	3	6	3273	3278	0 %	50 %	0 %	50 %	300712773
6	NC_014299	CT	3	6	4364	4369	0 %	50 %	0 %	50 %	300712776
7	NC_014299	AT	4	8	4528	4535	50 %	50 %	0 %	0 %	300712776
8	NC_014299	GA	3	6	5126	5131	50 %	0 %	50 %	0 %	300712777
9	NC_014299	GC	4	8	5365	5372	0 %	0 %	50 %	50 %	300712777
10	NC_014299	CA	3	6	5481	5486	50 %	0 %	0 %	50 %	300712777
11	NC_014299	GA	3	6	5645	5650	50 %	0 %	50 %	0 %	300712777
12	NC_014299	AG	3	6	7071	7076	50 %	0 %	50 %	0 %	300712779
13	NC_014299	GT	3	6	7793	7798	0 %	50 %	50 %	0 %	300712779
14	NC_014299	GC	3	6	8459	8464	0 %	0 %	50 %	50 %	300712779
15	NC_014299	TC	3	6	8905	8910	0 %	50 %	0 %	50 %	300712779
16	NC_014299	TA	3	6	8931	8936	50 %	50 %	0 %	0 %	300712779
17	NC_014299	AC	3	6	9341	9346	50 %	0 %	0 %	50 %	300712779
18	NC_014299	CA	3	6	9394	9399	50 %	0 %	0 %	50 %	300712779
19	NC_014299	CT	3	6	9595	9600	0 %	50 %	0 %	50 %	300712779
20	NC_014299	GC	3	6	9955	9960	0 %	0 %	50 %	50 %	300712779
21	NC_014299	CA	3	6	11086	11091	50 %	0 %	0 %	50 %	300712780
22	NC_014299	CA	3	6	11157	11162	50 %	0 %	0 %	50 %	300712780
23	NC_014299	TC	3	6	12367	12372	0 %	50 %	0 %	50 %	300712780
24	NC_014299	GA	3	6	13023	13028	50 %	0 %	50 %	0 %	300712780
25	NC_014299	GC	3	6	14771	14776	0 %	0 %	50 %	50 %	300712782
26	NC_014299	TG	3	6	14926	14931	0 %	50 %	50 %	0 %	300712782
27	NC_014299	GA	3	6	15951	15956	50 %	0 %	50 %	0 %	300712784
28	NC_014299	GA	3	6	16058	16063	50 %	0 %	50 %	0 %	300712784
29	NC_014299	GA	3	6	16220	16225	50 %	0 %	50 %	0 %	300712784
30	NC_014299	AC	3	6	16900	16905	50 %	0 %	0 %	50 %	300712786
31	NC_014299	CG	3	6	21029	21034	0 %	0 %	50 %	50 %	300712791
32	NC_014299	TC	3	6	23019	23024	0 %	50 %	0 %	50 %	300712793
33	NC_014299	CG	3	6	23093	23098	0 %	0 %	50 %	50 %	300712793
34	NC_014299	GA	3	6	23455	23460	50 %	0 %	50 %	0 %	300712794
35	NC_014299	GA	3	6	24124	24129	50 %	0 %	50 %	0 %	300712794
36	NC_014299	GT	3	6	24296	24301	0 %	50 %	50 %	0 %	300712794
37	NC_014299	GT	3	6	24409	24414	0 %	50 %	50 %	0 %	300712794
38	NC_014299	TC	4	8	24509	24516	0 %	50 %	0 %	50 %	300712794
39	NC_014299	AG	3	6	24947	24952	50 %	0 %	50 %	0 %	300712794
40	NC_014299	GC	3	6	24994	24999	0 %	0 %	50 %	50 %	300712794
41	NC_014299	CA	3	6	25496	25501	50 %	0 %	0 %	50 %	300712794
42	NC_014299	GC	3	6	26560	26565	0 %	0 %	50 %	50 %	300712794
43	NC_014299	AT	3	6	28291	28296	50 %	50 %	0 %	0 %	300712795
44	NC_014299	TC	3	6	28410	28415	0 %	50 %	0 %	50 %	300712795
45	NC_014299	CG	3	6	30607	30612	0 %	0 %	50 %	50 %	300712798
46	NC_014299	GA	3	6	30778	30783	50 %	0 %	50 %	0 %	300712798
47	NC_014299	TG	3	6	32662	32667	0 %	50 %	50 %	0 %	300712800
48	NC_014299	CT	3	6	32939	32944	0 %	50 %	0 %	50 %	300712800
49	NC_014299	CT	3	6	32977	32982	0 %	50 %	0 %	50 %	300712800
50	NC_014299	GA	4	8	33809	33816	50 %	0 %	50 %	0 %	300712801
51	NC_014299	GT	3	6	37004	37009	0 %	50 %	50 %	0 %	300712803
52	NC_014299	GC	4	8	37988	37995	0 %	0 %	50 %	50 %	300712804
53	NC_014299	GA	3	6	38077	38082	50 %	0 %	50 %	0 %	300712804
54	NC_014299	GT	3	6	38090	38095	0 %	50 %	50 %	0 %	300712804
55	NC_014299	TC	3	6	38124	38129	0 %	50 %	0 %	50 %	300712804
56	NC_014299	TC	4	8	41769	41776	0 %	50 %	0 %	50 %	300712807
57	NC_014299	GA	4	8	46188	46195	50 %	0 %	50 %	0 %	300712812
58	NC_014299	GT	3	6	47617	47622	0 %	50 %	50 %	0 %	300712814
59	NC_014299	GA	3	6	48352	48357	50 %	0 %	50 %	0 %	300712815
60	NC_014299	CG	3	6	48695	48700	0 %	0 %	50 %	50 %	300712815
61	NC_014299	GC	3	6	49971	49976	0 %	0 %	50 %	50 %	300712816
62	NC_014299	GT	3	6	50097	50102	0 %	50 %	50 %	0 %	300712816
63	NC_014299	TC	3	6	50629	50634	0 %	50 %	0 %	50 %	300712816
64	NC_014299	GA	3	6	50681	50686	50 %	0 %	50 %	0 %	300712816
65	NC_014299	GA	3	6	50732	50737	50 %	0 %	50 %	0 %	300712816
66	NC_014299	CG	3	6	51542	51547	0 %	0 %	50 %	50 %	300712816
67	NC_014299	GT	3	6	51758	51763	0 %	50 %	50 %	0 %	300712816
68	NC_014299	CG	3	6	54197	54202	0 %	0 %	50 %	50 %	300712817
69	NC_014299	AC	3	6	54482	54487	50 %	0 %	0 %	50 %	300712817
70	NC_014299	CG	3	6	54637	54642	0 %	0 %	50 %	50 %	300712817
71	NC_014299	GC	3	6	55875	55880	0 %	0 %	50 %	50 %	300712817
72	NC_014299	GA	3	6	58276	58281	50 %	0 %	50 %	0 %	300712820
73	NC_014299	GC	3	6	59197	59202	0 %	0 %	50 %	50 %	300712821
74	NC_014299	GT	3	6	60882	60887	0 %	50 %	50 %	0 %	300712823
75	NC_014299	GC	3	6	61635	61640	0 %	0 %	50 %	50 %	300712824
76	NC_014299	CG	3	6	62189	62194	0 %	0 %	50 %	50 %	300712825
77	NC_014299	CG	3	6	63968	63973	0 %	0 %	50 %	50 %	300712826
78	NC_014299	GT	4	8	64031	64038	0 %	50 %	50 %	0 %	300712826
79	NC_014299	GT	3	6	64058	64063	0 %	50 %	50 %	0 %	300712826
80	NC_014299	CA	3	6	64814	64819	50 %	0 %	0 %	50 %	300712827
81	NC_014299	CG	3	6	65283	65288	0 %	0 %	50 %	50 %	300712828
82	NC_014299	CT	3	6	65963	65968	0 %	50 %	0 %	50 %	300712829
83	NC_014299	AC	3	6	65989	65994	50 %	0 %	0 %	50 %	300712829
84	NC_014299	AC	3	6	67369	67374	50 %	0 %	0 %	50 %	300712830
85	NC_014299	GA	3	6	67418	67423	50 %	0 %	50 %	0 %	300712830
86	NC_014299	GC	3	6	67759	67764	0 %	0 %	50 %	50 %	300712831
87	NC_014299	TG	3	6	68083	68088	0 %	50 %	50 %	0 %	300712831
88	NC_014299	CG	3	6	69458	69463	0 %	0 %	50 %	50 %	300712832
89	NC_014299	GA	3	6	70077	70082	50 %	0 %	50 %	0 %	300712833
90	NC_014299	GA	3	6	72703	72708	50 %	0 %	50 %	0 %	300712835
91	NC_014299	AC	3	6	72935	72940	50 %	0 %	0 %	50 %	300712835
92	NC_014299	CT	3	6	74001	74006	0 %	50 %	0 %	50 %	300712836
93	NC_014299	CA	3	6	74211	74216	50 %	0 %	0 %	50 %	300712836
94	NC_014299	CT	3	6	75745	75750	0 %	50 %	0 %	50 %	300712837
95	NC_014299	CT	3	6	75846	75851	0 %	50 %	0 %	50 %	300712837
96	NC_014299	TG	3	6	77739	77744	0 %	50 %	50 %	0 %	300712839
97	NC_014299	GC	3	6	77943	77948	0 %	0 %	50 %	50 %	300712839
98	NC_014299	GA	3	6	79199	79204	50 %	0 %	50 %	0 %	300712841
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101	NC_014299	TG	3	6	81088	81093	0 %	50 %	50 %	0 %	300712842
102	NC_014299	TG	3	6	81655	81660	0 %	50 %	50 %	0 %	300712843
103	NC_014299	GA	3	6	81955	81960	50 %	0 %	50 %	0 %	300712844
104	NC_014299	TA	3	6	82106	82111	50 %	50 %	0 %	0 %	300712845
105	NC_014299	AG	3	6	82590	82595	50 %	0 %	50 %	0 %	300712846
106	NC_014299	CG	3	6	82609	82614	0 %	0 %	50 %	50 %	300712846
107	NC_014299	GT	3	6	82847	82852	0 %	50 %	50 %	0 %	300712846
108	NC_014299	GT	3	6	83403	83408	0 %	50 %	50 %	0 %	300712846
109	NC_014299	CT	3	6	84523	84528	0 %	50 %	0 %	50 %	300712847
110	NC_014299	TC	3	6	84535	84540	0 %	50 %	0 %	50 %	300712847
111	NC_014299	GT	3	6	85658	85663	0 %	50 %	50 %	0 %	300712848
112	NC_014299	CA	3	6	85676	85681	50 %	0 %	0 %	50 %	300712848
113	NC_014299	GT	3	6	87281	87286	0 %	50 %	50 %	0 %	300712849
114	NC_014299	AG	3	6	88230	88235	50 %	0 %	50 %	0 %	300712850
115	NC_014299	AG	3	6	88569	88574	50 %	0 %	50 %	0 %	300712850
116	NC_014299	GA	3	6	91046	91051	50 %	0 %	50 %	0 %	300712853
117	NC_014299	AG	3	6	91329	91334	50 %	0 %	50 %	0 %	300712853
118	NC_014299	GC	3	6	91379	91384	0 %	0 %	50 %	50 %	300712853
119	NC_014299	GT	3	6	91449	91454	0 %	50 %	50 %	0 %	300712853
120	NC_014299	TA	3	6	92063	92068	50 %	50 %	0 %	0 %	300712854
121	NC_014299	GA	3	6	92121	92126	50 %	0 %	50 %	0 %	300712854
122	NC_014299	CA	3	6	92595	92600	50 %	0 %	0 %	50 %	300712855
123	NC_014299	AC	3	6	92695	92700	50 %	0 %	0 %	50 %	300712855
124	NC_014299	GT	3	6	93808	93813	0 %	50 %	50 %	0 %	300712858
125	NC_014299	AG	3	6	98028	98033	50 %	0 %	50 %	0 %	300712860
126	NC_014299	TG	3	6	98305	98310	0 %	50 %	50 %	0 %	300712860
127	NC_014299	CG	3	6	102303	102308	0 %	0 %	50 %	50 %	300712864
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129	NC_014299	CA	3	6	103498	103503	50 %	0 %	0 %	50 %	300712864
130	NC_014299	AG	3	6	103546	103551	50 %	0 %	50 %	0 %	300712864
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132	NC_014299	GA	3	6	104726	104731	50 %	0 %	50 %	0 %	300712865
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138	NC_014299	TG	3	6	107639	107644	0 %	50 %	50 %	0 %	300712868
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.