MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 plasmid 1

Total Repeats: 80

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014298	ACAGT	2	10	4635	4644	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014298	TAGGG	2	10	23589	23598	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014298	GGTGA	2	10	23681	23690	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014298	TCGCT	2	10	26237	26246	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_014298	CCGAA	2	10	33683	33692	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_014298	GGGGA	2	10	33731	33740	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014298	CAATT	2	10	38042	38051	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_014298	TCGAG	2	10	51759	51768	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_014298	TACGG	2	10	63022	63031	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_014298	CGGAG	2	10	63122	63131	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_014298	CCTAC	2	10	67815	67824	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
12	NC_014298	AGACG	2	10	70966	70975	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_014298	AACTC	2	10	73260	73269	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_014298	CCCTT	2	10	80407	80416	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
15	NC_014298	GAACC	2	10	83439	83448	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_014298	CTCGT	2	10	85599	85608	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_014298	TTCGA	2	10	88321	88330	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014298	TCGAT	2	10	95982	95991	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_014298	AACGC	2	10	99082	99091	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
20	NC_014298	TACGG	2	10	99302	99311	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_014298	GACGG	2	10	103781	103790	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
22	NC_014298	CCGTC	2	10	104693	104702	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
23	NC_014298	TGAGA	2	10	113440	113449	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014298	TCGAT	2	10	130292	130301	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
25	NC_014298	AGATC	2	10	134069	134078	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014298	TCTTT	2	10	137057	137066	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_014298	TTTTC	2	10	141730	141739	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_014298	TTTGC	2	10	151224	151233	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_014298	CGCTC	2	10	158640	158649	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
30	NC_014298	GATGG	2	10	158843	158852	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014298	TTTGT	2	10	163459	163468	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014298	TCGTT	2	10	163663	163672	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_014298	TAACG	2	10	166620	166629	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
34	NC_014298	ATGGT	2	10	167778	167787	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014298	ACTGC	2	10	169862	169871	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_014298	GAGAA	2	10	173521	173530	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014298	GTCCG	2	10	176743	176752	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
38	NC_014298	GATCG	2	10	186053	186062	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_014298	CACCG	2	10	192420	192429	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
40	NC_014298	TCGGT	2	10	194647	194656	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_014298	AGGAA	2	10	199661	199670	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014298	AACGA	2	10	206236	206245	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_014298	CCAAC	2	10	209910	209919	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
44	NC_014298	TCTGT	2	10	216897	216906	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_014298	GACAG	2	10	217767	217776	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_014298	CACTA	2	10	221131	221140	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_014298	AATAA	2	10	221588	221597	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014298	TCGGA	2	10	231884	231893	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_014298	CCTTC	2	10	234973	234982	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
50	NC_014298	AAACA	2	10	236945	236954	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_014298	CACAG	2	10	241180	241189	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
52	NC_014298	CCTTA	2	10	245132	245141	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
53	NC_014298	GGTTA	2	10	245177	245186	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014298	GACTC	2	10	247613	247622	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_014298	CGAAG	2	10	251656	251665	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_014298	CAGAA	2	10	252408	252417	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
57	NC_014298	ACCGA	2	10	253201	253210	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_014298	CGGCG	2	10	257608	257617	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
59	NC_014298	ACGAA	2	10	257807	257816	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_014298	TGTAG	2	10	258305	258314	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014298	GATCG	2	10	266076	266085	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_014298	CCACA	2	10	269898	269907	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
63	NC_014298	TCCGT	2	10	301085	301094	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_014298	CGTCG	2	10	305510	305519	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
65	NC_014298	GAACA	2	10	310313	310322	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_014298	GGTGA	2	10	318936	318945	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014298	ATTAT	2	10	320873	320882	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014298	AGGAA	2	10	325819	325828	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014298	TGGTT	2	10	332767	332776	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014298	TCAAG	2	10	338800	338809	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_014298	AATGG	2	10	338923	338932	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014298	GATCG	2	10	341917	341926	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_014298	ATTCG	2	10	351661	351670	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_014298	CCTTC	2	10	359169	359178	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
75	NC_014298	CGACA	2	10	365367	365376	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
76	NC_014298	TCGAT	2	10	367234	367243	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
77	NC_014298	ATGAT	2	10	381090	381099	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014298	TGATT	2	10	382300	382309	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014298	CAACC	2	10	400321	400330	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
80	NC_014298	GTCTC	2	10	400507	400516	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.