MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 plasmid 1

Total Repeats: 1215

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014298	CGTT	2	8	41	48	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014298	AAAC	2	8	127	134	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014298	ACGC	2	8	332	339	25 %	0 %	25 %	50 %	300712407
4	NC_014298	TTCC	2	8	478	485	0 %	50 %	0 %	50 %	300712407
5	NC_014298	TGGT	2	8	530	537	0 %	50 %	50 %	0 %	300712407
6	NC_014298	CTCG	2	8	652	659	0 %	25 %	25 %	50 %	300712407
7	NC_014298	CATC	2	8	1068	1075	25 %	25 %	0 %	50 %	300712407
8	NC_014298	CGTT	2	8	1676	1683	0 %	50 %	25 %	25 %	300712407
9	NC_014298	GATT	2	8	1703	1710	25 %	50 %	25 %	0 %	300712407
10	NC_014298	CGAC	2	8	2698	2705	25 %	0 %	25 %	50 %	300712408
11	NC_014298	GGTT	2	8	2845	2852	0 %	50 %	50 %	0 %	300712408
12	NC_014298	TCGC	2	8	3332	3339	0 %	25 %	25 %	50 %	300712409
13	NC_014298	TCAC	2	8	3515	3522	25 %	25 %	0 %	50 %	300712409
14	NC_014298	AGCG	2	8	3664	3671	25 %	0 %	50 %	25 %	300712409
15	NC_014298	ATCG	2	8	4568	4575	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014298	GAGC	2	8	4908	4915	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014298	CCTG	2	8	5146	5153	0 %	25 %	25 %	50 %	300712411
18	NC_014298	GCGA	2	8	5665	5672	25 %	0 %	50 %	25 %	300712413
19	NC_014298	ATCG	2	8	6226	6233	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_014298	TGAT	2	8	6691	6698	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014298	GCGT	2	8	6807	6814	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014298	CCAG	2	8	7256	7263	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_014298	TTGA	2	8	7512	7519	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014298	GCCT	2	8	7904	7911	0 %	25 %	25 %	50 %	300712415
25	NC_014298	CCGC	2	8	8074	8081	0 %	0 %	25 %	75 %	300712415
26	NC_014298	CGAC	2	8	8168	8175	25 %	0 %	25 %	50 %	300712415
27	NC_014298	CGCT	2	8	8178	8185	0 %	25 %	25 %	50 %	300712415
28	NC_014298	CAGC	2	8	9370	9377	25 %	0 %	25 %	50 %	300712416
29	NC_014298	CGGA	2	8	9637	9644	25 %	0 %	50 %	25 %	300712416
30	NC_014298	TCCA	2	8	9785	9792	25 %	25 %	0 %	50 %	300712416
31	NC_014298	TCCG	2	8	9944	9951	0 %	25 %	25 %	50 %	300712416
32	NC_014298	CGAC	2	8	10772	10779	25 %	0 %	25 %	50 %	300712417
33	NC_014298	GTCG	2	8	10860	10867	0 %	25 %	50 %	25 %	300712417
34	NC_014298	CCGG	2	8	11305	11312	0 %	0 %	50 %	50 %	300712417
35	NC_014298	CGGT	2	8	11606	11613	0 %	25 %	50 %	25 %	300712417
36	NC_014298	AGTC	2	8	11792	11799	25 %	25 %	25 %	25 %	300712418
37	NC_014298	GACG	2	8	11916	11923	25 %	0 %	50 %	25 %	300712418
38	NC_014298	CCCG	2	8	11995	12002	0 %	0 %	25 %	75 %	300712418
39	NC_014298	CCCA	2	8	12019	12026	25 %	0 %	0 %	75 %	300712418
40	NC_014298	GACC	2	8	12081	12088	25 %	0 %	25 %	50 %	300712418
41	NC_014298	GTCC	2	8	12106	12113	0 %	25 %	25 %	50 %	300712418
42	NC_014298	TCCG	2	8	13183	13190	0 %	25 %	25 %	50 %	300712421
43	NC_014298	CGAC	2	8	13967	13974	25 %	0 %	25 %	50 %	300712422
44	NC_014298	CGGG	2	8	14420	14427	0 %	0 %	75 %	25 %	300712422
45	NC_014298	CCGG	2	8	14628	14635	0 %	0 %	50 %	50 %	300712422
46	NC_014298	CCGA	2	8	14647	14654	25 %	0 %	25 %	50 %	300712422
47	NC_014298	GAAG	2	8	14838	14845	50 %	0 %	50 %	0 %	300712422
48	NC_014298	TGGC	2	8	15023	15030	0 %	25 %	50 %	25 %	300712422
49	NC_014298	GTTG	2	8	15657	15664	0 %	50 %	50 %	0 %	300712422
50	NC_014298	TGAC	2	8	16505	16512	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_014298	GCCA	2	8	17156	17163	25 %	0 %	25 %	50 %	300712424
52	NC_014298	ACCG	2	8	17364	17371	25 %	0 %	25 %	50 %	300712424
53	NC_014298	TCCG	2	8	17674	17681	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_014298	TGGC	2	8	18430	18437	0 %	25 %	50 %	25 %	300712425
55	NC_014298	CGTT	2	8	18735	18742	0 %	50 %	25 %	25 %	300712425
56	NC_014298	TCAC	2	8	19083	19090	25 %	25 %	0 %	50 %	300712425
57	NC_014298	GAAC	2	8	19444	19451	50 %	0 %	25 %	25 %	300712426
58	NC_014298	GGCC	2	8	19482	19489	0 %	0 %	50 %	50 %	300712426
59	NC_014298	ACCG	2	8	19583	19590	25 %	0 %	25 %	50 %	300712426
60	NC_014298	CGAA	2	8	19843	19850	50 %	0 %	25 %	25 %	300712427
61	NC_014298	GACG	2	8	19882	19889	25 %	0 %	50 %	25 %	300712427
62	NC_014298	TGGT	2	8	20043	20050	0 %	50 %	50 %	0 %	300712427
63	NC_014298	TTCG	2	8	20195	20202	0 %	50 %	25 %	25 %	300712427
64	NC_014298	TAGA	2	8	20701	20708	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014298	CAAA	2	8	21107	21114	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_014298	AAGT	2	8	21121	21128	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014298	TCGT	2	8	21427	21434	0 %	50 %	25 %	25 %	300712428
68	NC_014298	CTAT	2	8	22154	22161	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_014298	GATG	2	8	22208	22215	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014298	CGCT	2	8	22445	22452	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_014298	GAAC	2	8	22860	22867	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_014298	TGAA	2	8	22894	22901	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014298	CGAG	2	8	22906	22913	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_014298	TTCC	2	8	22971	22978	0 %	50 %	0 %	50 %	300712429
75	NC_014298	CGAA	2	8	22990	22997	50 %	0 %	25 %	25 %	300712429
76	NC_014298	AATA	2	8	23609	23616	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014298	CACC	2	8	23843	23850	25 %	0 %	0 %	75 %	300712430
78	NC_014298	CAAG	2	8	24090	24097	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_014298	GATC	2	8	24534	24541	25 %	25 %	25 %	25 %	300712431
80	NC_014298	CAGT	2	8	25720	25727	25 %	25 %	25 %	25 %	300712432
81	NC_014298	TTGT	2	8	26005	26012	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014298	GATG	2	8	26309	26316	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014298	TGCT	2	8	27048	27055	0 %	50 %	25 %	25 %	300712433
84	NC_014298	TAGC	2	8	27493	27500	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_014298	GGAA	2	8	27607	27614	50 %	0 %	50 %	0 %	300712434
86	NC_014298	TTCG	2	8	27989	27996	0 %	50 %	25 %	25 %	300712434
87	NC_014298	CTGA	2	8	28661	28668	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_014298	GATA	2	8	28727	28734	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014298	TCAT	2	8	28786	28793	25 %	50 %	0 %	25 %	300712435
90	NC_014298	AGTG	2	8	28827	28834	25 %	25 %	50 %	0 %	300712435
91	NC_014298	GGTG	2	8	28956	28963	0 %	25 %	75 %	0 %	300712435
92	NC_014298	AGCC	2	8	29263	29270	25 %	0 %	25 %	50 %	300712436
93	NC_014298	CGAT	2	8	29579	29586	25 %	25 %	25 %	25 %	300712436
94	NC_014298	GTTG	2	8	30179	30186	0 %	50 %	50 %	0 %	300712436
95	NC_014298	AGAA	2	8	30192	30199	75 %	0 %	25 %	0 %	300712436
96	NC_014298	CGAT	2	8	30529	30536	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_014298	ACTT	2	8	31191	31198	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_014298	CTCA	2	8	31513	31520	25 %	25 %	0 %	50 %	300712438
99	NC_014298	ATCG	2	8	32108	32115	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_014298	ACCG	2	8	32629	32636	25 %	0 %	25 %	50 %	300712440
101	NC_014298	TCTG	2	8	32734	32741	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
102	NC_014298	TATC	2	8	32873	32880	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_014298	GGTA	2	8	32920	32927	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014298	TTGT	2	8	33012	33019	0 %	75 %	25 %	0 %	300712441
105	NC_014298	GTCG	2	8	33506	33513	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
106	NC_014298	CTCG	2	8	33531	33538	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_014298	ATTG	2	8	33772	33779	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014298	TCGT	2	8	34290	34297	0 %	50 %	25 %	25 %	300712442
109	NC_014298	CGCC	2	8	34328	34335	0 %	0 %	25 %	75 %	300712442
110	NC_014298	AACG	2	8	34558	34565	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_014298	CGTT	2	8	34933	34940	0 %	50 %	25 %	25 %	300712443
112	NC_014298	TCGC	2	8	35544	35551	0 %	25 %	25 %	50 %	300712444
113	NC_014298	TCAT	2	8	35810	35817	25 %	50 %	0 %	25 %	300712444
114	NC_014298	TGGG	2	8	36083	36090	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014298	ACTG	2	8	36707	36714	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
116	NC_014298	CCGG	2	8	37023	37030	0 %	0 %	50 %	50 %	300712446
117	NC_014298	TACG	2	8	37318	37325	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_014298	GTCT	2	8	37753	37760	0 %	50 %	25 %	25 %	300712447
119	NC_014298	GTTC	2	8	37782	37789	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_014298	ATTT	2	8	37816	37823	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014298	AACC	2	8	38182	38189	50 %	0 %	0 %	50 %	300712448
122	NC_014298	ACTG	2	8	38311	38318	25 %	25 %	25 %	25 %	300712448
123	NC_014298	GCAA	2	8	38527	38534	50 %	0 %	25 %	25 %	300712448
124	NC_014298	CGAA	2	8	38767	38774	50 %	0 %	25 %	25 %	300712449
125	NC_014298	AAAC	2	8	39370	39377	75 %	0 %	0 %	25 %	300712449
126	NC_014298	CAAG	2	8	40694	40701	50 %	0 %	25 %	25 %	300712450
127	NC_014298	CGTC	2	8	41686	41693	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_014298	TCGA	3	12	42132	42143	25 %	25 %	25 %	25 %	300712451
129	NC_014298	GGCT	2	8	42373	42380	0 %	25 %	50 %	25 %	300712451
130	NC_014298	ACCG	2	8	42424	42431	25 %	0 %	25 %	50 %	300712451
131	NC_014298	ACCG	2	8	42527	42534	25 %	0 %	25 %	50 %	300712452
132	NC_014298	ATCG	2	8	42926	42933	25 %	25 %	25 %	25 %	300712452
133	NC_014298	TTCG	2	8	43136	43143	0 %	50 %	25 %	25 %	300712452
134	NC_014298	CTCG	2	8	43214	43221	0 %	25 %	25 %	50 %	300712452
135	NC_014298	ACGC	2	8	43331	43338	25 %	0 %	25 %	50 %	300712452
136	NC_014298	GTTG	2	8	44044	44051	0 %	50 %	50 %	0 %	300712453
137	NC_014298	CCCT	2	8	44078	44085	0 %	25 %	0 %	75 %	300712453
138	NC_014298	CCCG	2	8	44280	44287	0 %	0 %	25 %	75 %	300712453
139	NC_014298	CCGT	2	8	44375	44382	0 %	25 %	25 %	50 %	300712453
140	NC_014298	AGGT	2	8	44951	44958	25 %	25 %	50 %	0 %	300712453
141	NC_014298	GCTC	2	8	45088	45095	0 %	25 %	25 %	50 %	300712454
142	NC_014298	CCGC	2	8	45142	45149	0 %	0 %	25 %	75 %	300712454
143	NC_014298	CTCA	2	8	45476	45483	25 %	25 %	0 %	50 %	300712455
144	NC_014298	TCGC	2	8	46241	46248	0 %	25 %	25 %	50 %	300712456
145	NC_014298	CGAG	2	8	46709	46716	25 %	0 %	50 %	25 %	300712456
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