MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 chromosome

Total Repeats: 1768

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014297	GGGAC	2	10	914	923	20 %	0 %	60 %	20 %	300709372
2	NC_014297	TGACC	2	10	1949	1958	20 %	20 %	20 %	40 %	300709374
3	NC_014297	ACGTC	2	10	19518	19527	20 %	20 %	20 %	40 %	300709389
4	NC_014297	CTCGA	2	10	21349	21358	20 %	20 %	20 %	40 %	300709391
5	NC_014297	GAACG	2	10	25814	25823	40 %	0 %	40 %	20 %	300709394
6	NC_014297	GATGG	2	10	28134	28143	20 %	20 %	60 %	0 %	300709395
7	NC_014297	CCGTC	2	10	33357	33366	0 %	20 %	20 %	60 %	300709399
8	NC_014297	CGAGG	2	10	33727	33736	20 %	0 %	60 %	20 %	300709399
9	NC_014297	ACGCG	2	10	35082	35091	20 %	0 %	40 %	40 %	300709400
10	NC_014297	ATCGA	2	10	35336	35345	40 %	20 %	20 %	20 %	300709400
11	NC_014297	CGGGC	2	10	35603	35612	0 %	0 %	60 %	40 %	300709401
12	NC_014297	GGTCG	2	10	36991	37000	0 %	20 %	60 %	20 %	300709401
13	NC_014297	AGCGA	2	10	38535	38544	40 %	0 %	40 %	20 %	300709402
14	NC_014297	GGCCG	2	10	40268	40277	0 %	0 %	60 %	40 %	300709405
15	NC_014297	TCGGG	2	10	40670	40679	0 %	20 %	60 %	20 %	300709405
16	NC_014297	CCAGG	2	10	41181	41190	20 %	0 %	40 %	40 %	300709406
17	NC_014297	CGACG	2	10	45207	45216	20 %	0 %	40 %	40 %	300709408
18	NC_014297	GTCGA	2	10	46263	46272	20 %	20 %	40 %	20 %	300709410
19	NC_014297	TCTCG	2	10	49834	49843	0 %	40 %	20 %	40 %	300709413
20	NC_014297	GATCT	2	10	51692	51701	20 %	40 %	20 %	20 %	300709414
21	NC_014297	GTCGG	2	10	54654	54663	0 %	20 %	60 %	20 %	300709417
22	NC_014297	CTGGG	2	10	55045	55054	0 %	20 %	60 %	20 %	300709418
23	NC_014297	CGACG	2	10	55647	55656	20 %	0 %	40 %	40 %	300709418
24	NC_014297	CTGGC	2	10	57090	57099	0 %	20 %	40 %	40 %	300709420
25	NC_014297	CGCAT	2	10	62167	62176	20 %	20 %	20 %	40 %	300709425
26	NC_014297	CGAAC	2	10	64613	64622	40 %	0 %	20 %	40 %	300709426
27	NC_014297	AGCGA	2	10	64887	64896	40 %	0 %	40 %	20 %	300709426
28	NC_014297	GACGA	2	10	65351	65360	40 %	0 %	40 %	20 %	300709427
29	NC_014297	CGCCA	2	10	67943	67952	20 %	0 %	20 %	60 %	300709431
30	NC_014297	GCGCC	2	10	69082	69091	0 %	0 %	40 %	60 %	300709431
31	NC_014297	GGCGA	2	10	69793	69802	20 %	0 %	60 %	20 %	300709433
32	NC_014297	CGACG	2	10	69941	69950	20 %	0 %	40 %	40 %	300709433
33	NC_014297	GTCGA	2	10	71653	71662	20 %	20 %	40 %	20 %	300709433
34	NC_014297	CGGGC	2	10	72300	72309	0 %	0 %	60 %	40 %	300709434
35	NC_014297	CGGAA	2	10	73743	73752	40 %	0 %	40 %	20 %	300709435
36	NC_014297	GGACG	2	10	73936	73945	20 %	0 %	60 %	20 %	300709435
37	NC_014297	CGCGG	2	10	74244	74253	0 %	0 %	60 %	40 %	300709435
38	NC_014297	CGCTT	2	10	78352	78361	0 %	40 %	20 %	40 %	300709442
39	NC_014297	GTCGC	2	10	78998	79007	0 %	20 %	40 %	40 %	300709442
40	NC_014297	TCCGA	2	10	79098	79107	20 %	20 %	20 %	40 %	300709443
41	NC_014297	CCCGA	2	10	83765	83774	20 %	0 %	20 %	60 %	300709448
42	NC_014297	GGGTC	2	10	84318	84327	0 %	20 %	60 %	20 %	300709449
43	NC_014297	CATGG	2	10	85600	85609	20 %	20 %	40 %	20 %	300709452
44	NC_014297	ACGGC	2	10	85998	86007	20 %	0 %	40 %	40 %	300709452
45	NC_014297	GCTGT	2	10	86543	86552	0 %	40 %	40 %	20 %	300709452
46	NC_014297	TCGAC	2	10	88893	88902	20 %	20 %	20 %	40 %	300709455
47	NC_014297	CCCGA	2	10	89154	89163	20 %	0 %	20 %	60 %	300709455
48	NC_014297	CTCAC	2	10	89466	89475	20 %	20 %	0 %	60 %	300709456
49	NC_014297	GGGGC	2	10	90366	90375	0 %	0 %	80 %	20 %	300709457
50	NC_014297	GTCCC	2	10	94744	94753	0 %	20 %	20 %	60 %	300709461
51	NC_014297	ACCGT	2	10	95459	95468	20 %	20 %	20 %	40 %	300709461
52	NC_014297	TCCCC	2	10	95553	95562	0 %	20 %	0 %	80 %	300709461
53	NC_014297	CAAGC	2	10	99441	99450	40 %	0 %	20 %	40 %	300709463
54	NC_014297	CGGCG	2	10	101793	101802	0 %	0 %	60 %	40 %	300709466
55	NC_014297	GGTGC	2	10	102499	102508	0 %	20 %	60 %	20 %	300709466
56	NC_014297	GGTCG	2	10	104848	104857	0 %	20 %	60 %	20 %	300709468
57	NC_014297	CGAGG	2	10	109735	109744	20 %	0 %	60 %	20 %	300709472
58	NC_014297	GGCGA	2	10	110464	110473	20 %	0 %	60 %	20 %	300709472
59	NC_014297	GCGCA	2	10	116979	116988	20 %	0 %	40 %	40 %	300709480
60	NC_014297	ACGAG	2	10	117065	117074	40 %	0 %	40 %	20 %	300709480
61	NC_014297	GGGCT	2	10	119475	119484	0 %	20 %	60 %	20 %	300709483
62	NC_014297	CATTC	2	10	120098	120107	20 %	40 %	0 %	40 %	300709484
63	NC_014297	CGATA	2	10	122093	122102	40 %	20 %	20 %	20 %	300709487
64	NC_014297	CGATC	2	10	122523	122532	20 %	20 %	20 %	40 %	300709488
65	NC_014297	CGGCC	2	10	130128	130137	0 %	0 %	40 %	60 %	300709494
66	NC_014297	GACGG	2	10	131170	131179	20 %	0 %	60 %	20 %	300709494
67	NC_014297	TCGCC	2	10	132119	132128	0 %	20 %	20 %	60 %	300709496
68	NC_014297	CGATT	2	10	137487	137496	20 %	40 %	20 %	20 %	300709503
69	NC_014297	GATCA	2	10	138495	138504	40 %	20 %	20 %	20 %	300709504
70	NC_014297	TCGGC	2	10	148100	148109	0 %	20 %	40 %	40 %	300709514
71	NC_014297	CGGGT	2	10	149355	149364	0 %	20 %	60 %	20 %	300709515
72	NC_014297	CGCTT	2	10	152750	152759	0 %	40 %	20 %	40 %	300709520
73	NC_014297	TCGCC	2	10	152768	152777	0 %	20 %	20 %	60 %	300709520
74	NC_014297	GCCCG	2	10	153363	153372	0 %	0 %	40 %	60 %	300709521
75	NC_014297	TCGCT	2	10	153734	153743	0 %	40 %	20 %	40 %	300709521
76	NC_014297	CCGTT	2	10	153799	153808	0 %	40 %	20 %	40 %	300709521
77	NC_014297	CTCCA	2	10	156019	156028	20 %	20 %	0 %	60 %	300709523
78	NC_014297	AGCGA	2	10	157454	157463	40 %	0 %	40 %	20 %	300709525
79	NC_014297	GCGAC	2	10	158834	158843	20 %	0 %	40 %	40 %	300709527
80	NC_014297	ATCGG	2	10	159785	159794	20 %	20 %	40 %	20 %	300709527
81	NC_014297	TTCGC	2	10	162413	162422	0 %	40 %	20 %	40 %	300709530
82	NC_014297	ACGTG	2	10	165711	165720	20 %	20 %	40 %	20 %	300709532
83	NC_014297	CATGA	2	10	168821	168830	40 %	20 %	20 %	20 %	300709534
84	NC_014297	TCGGT	2	10	169197	169206	0 %	40 %	40 %	20 %	300709534
85	NC_014297	GGGTC	2	10	171876	171885	0 %	20 %	60 %	20 %	300709536
86	NC_014297	ACTCG	2	10	174761	174770	20 %	20 %	20 %	40 %	300709539
87	NC_014297	GCGCC	2	10	178980	178989	0 %	0 %	40 %	60 %	300709543
88	NC_014297	GACGC	2	10	179996	180005	20 %	0 %	40 %	40 %	300709543
89	NC_014297	GGTTC	2	10	180834	180843	0 %	40 %	40 %	20 %	300709544
90	NC_014297	ACGCC	2	10	181391	181400	20 %	0 %	20 %	60 %	300709545
91	NC_014297	GGCGA	2	10	184522	184531	20 %	0 %	60 %	20 %	300709548
92	NC_014297	CGCCC	2	10	186968	186977	0 %	0 %	20 %	80 %	300709551
93	NC_014297	CGCGC	2	10	188526	188535	0 %	0 %	40 %	60 %	300709552
94	NC_014297	GCCGA	2	10	188680	188689	20 %	0 %	40 %	40 %	300709552
95	NC_014297	CTCGC	2	10	191031	191040	0 %	20 %	20 %	60 %	300709554
96	NC_014297	GCGCG	2	10	192902	192911	0 %	0 %	60 %	40 %	300709556
97	NC_014297	CGATC	2	10	197246	197255	20 %	20 %	20 %	40 %	300709561
98	NC_014297	CCGTA	2	10	198601	198610	20 %	20 %	20 %	40 %	300709563
99	NC_014297	GTGTC	2	10	199711	199720	0 %	40 %	40 %	20 %	300709564
100	NC_014297	GTTCG	2	10	199946	199955	0 %	40 %	40 %	20 %	300709565
101	NC_014297	GCTCG	2	10	200349	200358	0 %	20 %	40 %	40 %	300709565
102	NC_014297	CCTGT	2	10	200385	200394	0 %	40 %	20 %	40 %	300709565
103	NC_014297	GCCCC	2	10	200511	200520	0 %	0 %	20 %	80 %	300709565
104	NC_014297	GCCGC	2	10	203256	203265	0 %	0 %	40 %	60 %	300709568
105	NC_014297	ACGGG	2	10	206817	206826	20 %	0 %	60 %	20 %	300709572
106	NC_014297	TCGCC	2	10	207166	207175	0 %	20 %	20 %	60 %	300709572
107	NC_014297	GCCGG	2	10	209283	209292	0 %	0 %	60 %	40 %	300709574
108	NC_014297	GCGCG	2	10	212346	212355	0 %	0 %	60 %	40 %	300709576
109	NC_014297	TCGAC	2	10	212895	212904	20 %	20 %	20 %	40 %	300709578
110	NC_014297	CGGCG	2	10	213079	213088	0 %	0 %	60 %	40 %	300709578
111	NC_014297	GGGCC	2	10	220313	220322	0 %	0 %	60 %	40 %	300709586
112	NC_014297	GCGCC	2	10	220593	220602	0 %	0 %	40 %	60 %	300709586
113	NC_014297	CGACC	2	10	220916	220925	20 %	0 %	20 %	60 %	300709586
114	NC_014297	CCTCG	2	10	221810	221819	0 %	20 %	20 %	60 %	300709586
115	NC_014297	TCGAC	2	10	222683	222692	20 %	20 %	20 %	40 %	300709588
116	NC_014297	GTCGA	2	10	224396	224405	20 %	20 %	40 %	20 %	300709590
117	NC_014297	CGATG	2	10	226574	226583	20 %	20 %	40 %	20 %	300709594
118	NC_014297	TCCCC	2	10	227695	227704	0 %	20 %	0 %	80 %	300709596
119	NC_014297	CGGCC	2	10	229937	229946	0 %	0 %	40 %	60 %	300709598
120	NC_014297	GCCGA	2	10	230190	230199	20 %	0 %	40 %	40 %	300709599
121	NC_014297	GATCG	2	10	231591	231600	20 %	20 %	40 %	20 %	300709601
122	NC_014297	TCCGT	2	10	232396	232405	0 %	40 %	20 %	40 %	300709604
123	NC_014297	GGGAC	2	10	239972	239981	20 %	0 %	60 %	20 %	300709610
124	NC_014297	CCGAT	2	10	245083	245092	20 %	20 %	20 %	40 %	300709619
125	NC_014297	TTCGA	2	10	246763	246772	20 %	40 %	20 %	20 %	300709621
126	NC_014297	CCGTC	2	10	246849	246858	0 %	20 %	20 %	60 %	300709621
127	NC_014297	GAGCG	2	10	248097	248106	20 %	0 %	60 %	20 %	300709623
128	NC_014297	TCGAT	2	10	249298	249307	20 %	40 %	20 %	20 %	300709624
129	NC_014297	CGACG	2	10	250079	250088	20 %	0 %	40 %	40 %	300709624
130	NC_014297	GTACC	2	10	250106	250115	20 %	20 %	20 %	40 %	300709624
131	NC_014297	CGAAC	2	10	250490	250499	40 %	0 %	20 %	40 %	300709624
132	NC_014297	GCCCC	2	10	251793	251802	0 %	0 %	20 %	80 %	300709625
133	NC_014297	GCCCC	2	10	254429	254438	0 %	0 %	20 %	80 %	300709626
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387	NC_014297	CGACC	2	10	693394	693403	20 %	0 %	20 %	60 %	300710058
388	NC_014297	CGATC	2	10	696340	696349	20 %	20 %	20 %	40 %	300710060
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