MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 chromosome

Total Repeats: 9232

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014297	CCGA	2	8	260	267	25 %	0 %	25 %	50 %	300709372
2	NC_014297	GAGC	2	8	293	300	25 %	0 %	50 %	25 %	300709372
3	NC_014297	CGCC	2	8	515	522	0 %	0 %	25 %	75 %	300709372
4	NC_014297	CCGC	2	8	886	893	0 %	0 %	25 %	75 %	300709372
5	NC_014297	TCGG	2	8	1039	1046	0 %	25 %	50 %	25 %	300709372
6	NC_014297	CGGT	2	8	1341	1348	0 %	25 %	50 %	25 %	300709373
7	NC_014297	GCGG	2	8	1574	1581	0 %	0 %	75 %	25 %	300709373
8	NC_014297	GCCA	2	8	1647	1654	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_014297	CCGT	2	8	1667	1674	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_014297	GCGG	2	8	2034	2041	0 %	0 %	75 %	25 %	300709374
11	NC_014297	CTCG	2	8	2210	2217	0 %	25 %	25 %	50 %	300709374
12	NC_014297	GTCT	2	8	2696	2703	0 %	50 %	25 %	25 %	300709375
13	NC_014297	CGAG	2	8	2811	2818	25 %	0 %	50 %	25 %	300709375
14	NC_014297	CGTT	2	8	2855	2862	0 %	50 %	25 %	25 %	300709375
15	NC_014297	CGCA	2	8	2895	2902	25 %	0 %	25 %	50 %	300709376
16	NC_014297	GCCC	2	8	3012	3019	0 %	0 %	25 %	75 %	300709376
17	NC_014297	ACGG	2	8	3186	3193	25 %	0 %	50 %	25 %	300709376
18	NC_014297	CGAA	2	8	3234	3241	50 %	0 %	25 %	25 %	300709376
19	NC_014297	CTAC	2	8	3330	3337	25 %	25 %	0 %	50 %	300709376
20	NC_014297	GGCC	2	8	3428	3435	0 %	0 %	50 %	50 %	300709376
21	NC_014297	GTCG	2	8	3672	3679	0 %	25 %	50 %	25 %	300709376
22	NC_014297	CGGT	2	8	3851	3858	0 %	25 %	50 %	25 %	300709377
23	NC_014297	AGGA	2	8	4186	4193	50 %	0 %	50 %	0 %	300709377
24	NC_014297	CCGG	2	8	4319	4326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_014297	CTCG	2	8	4331	4338	0 %	25 %	25 %	50 %	300709378
26	NC_014297	GGGC	2	8	4423	4430	0 %	0 %	75 %	25 %	300709378
27	NC_014297	CGTC	2	8	4525	4532	0 %	25 %	25 %	50 %	300709378
28	NC_014297	GGCC	2	8	6017	6024	0 %	0 %	50 %	50 %	300709379
29	NC_014297	AGCC	2	8	6572	6579	25 %	0 %	25 %	50 %	300709380
30	NC_014297	GCCG	3	12	6997	7008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014297	GCAC	2	8	7341	7348	25 %	0 %	25 %	50 %	300709382
32	NC_014297	GTCG	2	8	7542	7549	0 %	25 %	50 %	25 %	300709382
33	NC_014297	TCGA	2	8	7971	7978	25 %	25 %	25 %	25 %	300709383
34	NC_014297	GATC	2	8	8003	8010	25 %	25 %	25 %	25 %	300709383
35	NC_014297	GGGT	2	8	8403	8410	0 %	25 %	75 %	0 %	300709383
36	NC_014297	GCCT	2	8	8654	8661	0 %	25 %	25 %	50 %	300709383
37	NC_014297	CGTC	2	8	8788	8795	0 %	25 %	25 %	50 %	300709383
38	NC_014297	GTCG	2	8	9068	9075	0 %	25 %	50 %	25 %	300709383
39	NC_014297	AGCG	2	8	9460	9467	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014297	GCCG	2	8	9601	9608	0 %	0 %	50 %	50 %	300709384
41	NC_014297	CGAT	2	8	9735	9742	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_014297	GGAC	2	8	10086	10093	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014297	ATAG	2	8	10644	10651	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014297	CCTA	2	8	11132	11139	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_014297	GGCA	2	8	11507	11514	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_014297	TCGG	2	8	11747	11754	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_014297	ACGC	2	8	12921	12928	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_014297	GTGC	2	8	13386	13393	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014297	CCCA	2	8	13404	13411	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
50	NC_014297	GCGG	2	8	13888	13895	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
51	NC_014297	TTCC	2	8	14032	14039	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_014297	GAGC	2	8	14606	14613	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_014297	TTTC	2	8	15456	15463	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_014297	ATTC	2	8	15552	15559	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_014297	TCGG	2	8	15867	15874	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_014297	CGTG	2	8	15896	15903	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
57	NC_014297	TACC	2	8	17182	17189	25 %	25 %	0 %	50 %	300709387
58	NC_014297	CGAC	2	8	17508	17515	25 %	0 %	25 %	50 %	300709387
59	NC_014297	TCCC	2	8	18130	18137	0 %	25 %	0 %	75 %	300709388
60	NC_014297	CGGT	2	8	18479	18486	0 %	25 %	50 %	25 %	300709388
61	NC_014297	CCGT	2	8	18535	18542	0 %	25 %	25 %	50 %	300709388
62	NC_014297	GGTC	2	8	19159	19166	0 %	25 %	50 %	25 %	300709388
63	NC_014297	CCGA	2	8	19343	19350	25 %	0 %	25 %	50 %	300709389
64	NC_014297	GAGC	2	8	19419	19426	25 %	0 %	50 %	25 %	300709389
65	NC_014297	CGAG	2	8	19434	19441	25 %	0 %	50 %	25 %	300709389
66	NC_014297	GGAG	2	8	19469	19476	25 %	0 %	75 %	0 %	300709389
67	NC_014297	CGTC	2	8	19665	19672	0 %	25 %	25 %	50 %	300709389
68	NC_014297	GAGC	2	8	19675	19682	25 %	0 %	50 %	25 %	300709389
69	NC_014297	CGGG	2	8	19791	19798	0 %	0 %	75 %	25 %	300709389
70	NC_014297	GGCG	2	8	20295	20302	0 %	0 %	75 %	25 %	300709389
71	NC_014297	GTTC	2	8	20346	20353	0 %	50 %	25 %	25 %	300709389
72	NC_014297	GCAC	2	8	20781	20788	25 %	0 %	25 %	50 %	300709390
73	NC_014297	CCGT	2	8	20982	20989	0 %	25 %	25 %	50 %	300709390
74	NC_014297	ACGG	2	8	21492	21499	25 %	0 %	50 %	25 %	300709391
75	NC_014297	ACCG	2	8	21541	21548	25 %	0 %	25 %	50 %	300709391
76	NC_014297	CGCC	2	8	21656	21663	0 %	0 %	25 %	75 %	300709391
77	NC_014297	ACGA	2	8	21748	21755	50 %	0 %	25 %	25 %	300709391
78	NC_014297	CCCG	2	8	22018	22025	0 %	0 %	25 %	75 %	300709392
79	NC_014297	TCGA	2	8	22097	22104	25 %	25 %	25 %	25 %	300709392
80	NC_014297	CTCG	2	8	22222	22229	0 %	25 %	25 %	50 %	300709392
81	NC_014297	CCGG	2	8	22243	22250	0 %	0 %	50 %	50 %	300709392
82	NC_014297	CTCG	2	8	22573	22580	0 %	25 %	25 %	50 %	300709392
83	NC_014297	CCGT	2	8	22590	22597	0 %	25 %	25 %	50 %	300709392
84	NC_014297	AGCC	2	8	22847	22854	25 %	0 %	25 %	50 %	300709392
85	NC_014297	CGGC	2	8	23029	23036	0 %	0 %	50 %	50 %	300709392
86	NC_014297	CCGC	2	8	23037	23044	0 %	0 %	25 %	75 %	300709392
87	NC_014297	CGGG	2	8	23132	23139	0 %	0 %	75 %	25 %	300709392
88	NC_014297	CACC	2	8	23337	23344	25 %	0 %	0 %	75 %	300709392
89	NC_014297	CCTT	2	8	23924	23931	0 %	50 %	0 %	50 %	300709392
90	NC_014297	AGGC	2	8	25107	25114	25 %	0 %	50 %	25 %	300709393
91	NC_014297	GGGA	2	8	25140	25147	25 %	0 %	75 %	0 %	300709393
92	NC_014297	ACCG	2	8	26085	26092	25 %	0 %	25 %	50 %	300709394
93	NC_014297	GGCG	2	8	26378	26385	0 %	0 %	75 %	25 %	300709394
94	NC_014297	GGAT	2	8	26514	26521	25 %	25 %	50 %	0 %	300709394
95	NC_014297	CGAC	2	8	26674	26681	25 %	0 %	25 %	50 %	300709394
96	NC_014297	ACCA	2	8	26760	26767	50 %	0 %	0 %	50 %	300709394
97	NC_014297	CCGA	2	8	27296	27303	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_014297	GCGG	2	8	27617	27624	0 %	0 %	75 %	25 %	300709395
99	NC_014297	CGTG	2	8	27761	27768	0 %	25 %	50 %	25 %	300709395
100	NC_014297	CGAG	2	8	27961	27968	25 %	0 %	50 %	25 %	300709395
101	NC_014297	GGAC	2	8	28622	28629	25 %	0 %	50 %	25 %	300709396
102	NC_014297	CCCG	2	8	29230	29237	0 %	0 %	25 %	75 %	300709396
103	NC_014297	CGGG	2	8	29348	29355	0 %	0 %	75 %	25 %	300709396
104	NC_014297	TGGT	2	8	29627	29634	0 %	50 %	50 %	0 %	300709397
105	NC_014297	GGCG	2	8	30100	30107	0 %	0 %	75 %	25 %	300709397
106	NC_014297	CGAC	2	8	30234	30241	25 %	0 %	25 %	50 %	300709397
107	NC_014297	GAAC	2	8	30760	30767	50 %	0 %	25 %	25 %	300709397
108	NC_014297	GCGG	2	8	30949	30956	0 %	0 %	75 %	25 %	300709397
109	NC_014297	CCTG	2	8	31217	31224	0 %	25 %	25 %	50 %	300709398
110	NC_014297	ATCG	2	8	31494	31501	25 %	25 %	25 %	25 %	300709398
111	NC_014297	GGGC	2	8	32322	32329	0 %	0 %	75 %	25 %	300709398
112	NC_014297	CACC	2	8	32424	32431	25 %	0 %	0 %	75 %	300709398
113	NC_014297	CGGG	2	8	32522	32529	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
114	NC_014297	GTTC	2	8	32703	32710	0 %	50 %	25 %	25 %	300709399
115	NC_014297	TCCG	2	8	32818	32825	0 %	25 %	25 %	50 %	300709399
116	NC_014297	GGCG	2	8	33536	33543	0 %	0 %	75 %	25 %	300709399
117	NC_014297	CGAG	2	8	33807	33814	25 %	0 %	50 %	25 %	300709399
118	NC_014297	TCGG	2	8	33824	33831	0 %	25 %	50 %	25 %	300709399
119	NC_014297	CGAG	2	8	33978	33985	25 %	0 %	50 %	25 %	300709399
120	NC_014297	GATC	2	8	34152	34159	25 %	25 %	25 %	25 %	300709399
121	NC_014297	GCGG	2	8	34180	34187	0 %	0 %	75 %	25 %	300709399
122	NC_014297	GATC	2	8	34368	34375	25 %	25 %	25 %	25 %	300709399
123	NC_014297	CCGG	2	8	34616	34623	0 %	0 %	50 %	50 %	300709400
124	NC_014297	CCGC	2	8	34959	34966	0 %	0 %	25 %	75 %	300709400
125	NC_014297	GCGG	2	8	35129	35136	0 %	0 %	75 %	25 %	300709400
126	NC_014297	TGGG	2	8	35469	35476	0 %	25 %	75 %	0 %	300709401
127	NC_014297	CCCG	2	8	35506	35513	0 %	0 %	25 %	75 %	300709401
128	NC_014297	GTCG	2	8	35571	35578	0 %	25 %	50 %	25 %	300709401
129	NC_014297	GAAC	2	8	35832	35839	50 %	0 %	25 %	25 %	300709401
130	NC_014297	GGAC	2	8	36593	36600	25 %	0 %	50 %	25 %	300709401
131	NC_014297	GGCG	2	8	37152	37159	0 %	0 %	75 %	25 %	300709401
132	NC_014297	CCGG	2	8	37243	37250	0 %	0 %	50 %	50 %	300709401
133	NC_014297	CGGT	2	8	37411	37418	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_014297	TGGA	2	8	38081	38088	25 %	25 %	50 %	0 %	300709402
135	NC_014297	GCGG	2	8	38260	38267	0 %	0 %	75 %	25 %	300709402
136	NC_014297	AGTT	2	8	38340	38347	25 %	50 %	25 %	0 %	300709402
137	NC_014297	AGCG	2	8	38445	38452	25 %	0 %	50 %	25 %	300709402
138	NC_014297	GCCG	2	8	39032	39039	0 %	0 %	50 %	50 %	300709403
139	NC_014297	TCCC	2	8	40493	40500	0 %	25 %	0 %	75 %	300709405
140	NC_014297	CCGG	2	8	41441	41448	0 %	0 %	50 %	50 %	300709406
141	NC_014297	CGCA	2	8	42056	42063	25 %	0 %	25 %	50 %	300709407
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143	NC_014297	GACC	2	8	42290	42297	25 %	0 %	25 %	50 %	300709407
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