MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 chromosome

Total Repeats: 1244

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014297	GCCA	2	8	1647	1654	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_014297	CCGT	2	8	1667	1674	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_014297	CCGG	2	8	4319	4326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014297	GCCG	3	12	6997	7008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014297	AGCG	2	8	9460	9467	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014297	CGAT	2	8	9735	9742	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_014297	GGAC	2	8	10086	10093	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014297	ATAG	2	8	10644	10651	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014297	CCTA	2	8	11132	11139	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_014297	GGCA	2	8	11507	11514	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_014297	TCGG	2	8	11747	11754	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014297	ACGC	2	8	12921	12928	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_014297	GTGC	2	8	13386	13393	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_014297	CCCA	2	8	13404	13411	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
15	NC_014297	GCGG	2	8	13888	13895	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014297	TTCC	2	8	14032	14039	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014297	GAGC	2	8	14606	14613	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_014297	TTTC	2	8	15456	15463	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014297	ATTC	2	8	15552	15559	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_014297	TCGG	2	8	15867	15874	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_014297	CGTG	2	8	15896	15903	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014297	CCGA	2	8	27296	27303	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_014297	CGGG	2	8	32522	32529	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014297	CGGT	2	8	37411	37418	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
25	NC_014297	GAGG	2	8	47350	47357	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014297	GGAC	2	8	47670	47677	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_014297	CGAC	2	8	49635	49642	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_014297	CGGA	2	8	50128	50135	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_014297	TCGG	2	8	50284	50291	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_014297	GCCG	2	8	55742	55749	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014297	CGAC	2	8	55855	55862	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_014297	GCCT	2	8	64186	64193	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
33	NC_014297	TCGG	2	8	66772	66779	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014297	CCGT	2	8	72119	72126	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014297	GCCG	2	8	72128	72135	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_014297	CCCG	2	8	76188	76195	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
37	NC_014297	CAGC	2	8	83149	83156	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_014297	TGCG	2	8	92391	92398	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
39	NC_014297	CGGA	2	8	97319	97326	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014297	TCGC	2	8	101177	101184	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_014297	GAGG	2	8	105868	105875	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014297	GATT	2	8	105940	105947	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014297	CGGA	2	8	111381	111388	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_014297	TCTA	2	8	112511	112518	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_014297	ATGT	2	8	112560	112567	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014297	CCGA	2	8	120622	120629	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_014297	TCGC	2	8	128625	128632	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_014297	AGCG	2	8	133639	133646	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014297	GGTT	2	8	136096	136103	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014297	CGGT	2	8	145035	145042	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_014297	TCGT	2	8	145056	145063	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014297	GAAT	2	8	145540	145547	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014297	CGGC	2	8	150187	150194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_014297	GATC	2	8	150211	150218	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_014297	CCGC	2	8	152423	152430	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
56	NC_014297	ACAA	2	8	160785	160792	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_014297	GTTC	2	8	163234	163241	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_014297	CGGA	2	8	164116	164123	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_014297	TCGG	2	8	167621	167628	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_014297	CCGA	2	8	167805	167812	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_014297	CCAT	2	8	167855	167862	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_014297	GAGC	2	8	171263	171270	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_014297	CGAC	2	8	178847	178854	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_014297	ACGG	2	8	181016	181023	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_014297	GATA	2	8	182480	182487	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014297	ACCC	2	8	182798	182805	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
67	NC_014297	TTTC	2	8	183160	183167	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_014297	AATA	2	8	183224	183231	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014297	CAAC	2	8	183467	183474	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_014297	CTTT	2	8	183492	183499	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_014297	TCAA	2	8	183583	183590	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_014297	TCGA	2	8	186229	186236	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
73	NC_014297	GGTG	2	8	188287	188294	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014297	ATCC	2	8	189615	189622	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_014297	CACC	2	8	193222	193229	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
76	NC_014297	TTAA	2	8	195861	195868	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014297	CTTT	2	8	195964	195971	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_014297	GATC	2	8	196695	196702	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_014297	CCGA	2	8	198804	198811	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_014297	TTAA	2	8	205046	205053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014297	CGAA	2	8	207852	207859	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_014297	CGTG	2	8	208040	208047	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_014297	GGGC	2	8	213799	213806	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
84	NC_014297	GGCG	2	8	216992	216999	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
85	NC_014297	GTCG	2	8	217031	217038	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_014297	GAGC	2	8	223601	223608	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_014297	CGAC	2	8	224081	224088	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_014297	GCCG	2	8	224104	224111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_014297	CGGT	2	8	224163	224170	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_014297	ACGG	2	8	224205	224212	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_014297	CCTA	2	8	226156	226163	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_014297	GAAC	2	8	226184	226191	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_014297	CGAA	2	8	227213	227220	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_014297	AGGA	2	8	227228	227235	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014297	GTCA	2	8	232684	232691	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_014297	TATC	2	8	233570	233577	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_014297	GACG	2	8	246452	246459	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_014297	GACG	2	8	247349	247356	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_014297	GCCA	2	8	250872	250879	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
100	NC_014297	ACGT	2	8	252568	252575	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_014297	TCGC	2	8	259642	259649	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_014297	GATA	2	8	261428	261435	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014297	CCCA	2	8	263802	263809	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
104	NC_014297	CGGT	2	8	265970	265977	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_014297	TCGA	2	8	265993	266000	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_014297	CGAC	2	8	271928	271935	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_014297	TCGC	2	8	271997	272004	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_014297	AGAT	2	8	272089	272096	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014297	GCGG	2	8	276514	276521	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
110	NC_014297	CCGC	2	8	276568	276575	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
111	NC_014297	GTCG	2	8	277192	277199	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_014297	CGTT	2	8	278729	278736	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_014297	GACC	2	8	280485	280492	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_014297	ACGG	2	8	282111	282118	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_014297	CGGT	2	8	282127	282134	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_014297	TATC	2	8	283660	283667	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_014297	GACC	2	8	283757	283764	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_014297	GCGA	2	8	283792	283799	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_014297	GAGG	2	8	283803	283810	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014297	GTCG	2	8	288321	288328	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
121	NC_014297	TCGC	2	8	288533	288540	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_014297	CGCT	2	8	288558	288565	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_014297	TGAG	2	8	291764	291771	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014297	TGCG	2	8	298266	298273	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_014297	CGCT	2	8	302082	302089	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_014297	CGGA	2	8	302689	302696	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_014297	GGGT	2	8	304800	304807	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014297	AGCG	2	8	314065	314072	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_014297	CTCC	2	8	314116	314123	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
130	NC_014297	ACGC	2	8	315167	315174	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_014297	GGAA	2	8	315198	315205	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014297	GAGT	2	8	315215	315222	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014297	CGAT	2	8	316240	316247	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_014297	GACG	2	8	316594	316601	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_014297	TAAA	2	8	316645	316652	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014297	TTTA	2	8	317810	317817	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014297	TTTA	2	8	317834	317841	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014297	CTAT	2	8	318887	318894	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_014297	CGAT	2	8	320192	320199	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_014297	CGCT	2	8	322769	322776	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_014297	CTCC	2	8	331875	331882	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
142	NC_014297	CAAC	2	8	331927	331934	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_014297	GCGA	2	8	331939	331946	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_014297	ATGG	2	8	339270	339277	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014297	TGGT	2	8	340655	340662	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014297	ACGG	2	8	340744	340751	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_014297	ATCG	2	8	340817	340824	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
148	NC_014297	TAGG	2	8	342357	342364	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014297	CGCC	2	8	343647	343654	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
150	NC_014297	ACCC	2	8	343750	343757	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
151	NC_014297	GCTA	2	8	347329	347336	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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