MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Halalkalicoccus jeotgali B3 chromosome

Total Repeats: 48175

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014297	GTC	2	6	110	115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300709372
2	NC_014297	CGG	2	6	134	139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300709372
3	NC_014297	ACG	2	6	193	198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300709372
4	NC_014297	GGA	2	6	245	250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300709372
5	NC_014297	CGC	2	6	268	273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300709372
6	NC_014297	CCT	2	6	335	340	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300709372
7	NC_014297	CGG	2	6	344	349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300709372
8	NC_014297	CAA	2	6	362	367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	300709372
9	NC_014297	GAA	2	6	392	397	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300709372
10	NC_014297	CGT	2	6	533	538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300709372
11	NC_014297	CGG	2	6	581	586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300709372
12	NC_014297	GGA	2	6	620	625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300709372
13	NC_014297	CGT	2	6	668	673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300709372
14	NC_014297	GAG	2	6	726	731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300709372
15	NC_014297	GGC	2	6	795	800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300709372
16	NC_014297	CGC	2	6	896	901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300709372
17	NC_014297	CGA	2	6	956	961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300709372
18	NC_014297	CGG	2	6	985	990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300709372
19	NC_014297	CGA	2	6	1067	1072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300709372
20	NC_014297	ATC	2	6	1116	1121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300709372
21	NC_014297	GGT	2	6	1319	1324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300709373
22	NC_014297	GTC	2	6	1523	1528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300709373
23	NC_014297	CGG	2	6	1567	1572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300709373
24	NC_014297	CGA	2	6	1612	1617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300709373
25	NC_014297	CGT	2	6	1856	1861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300709374
26	NC_014297	CGA	2	6	1874	1879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300709374
27	NC_014297	GGA	2	6	1889	1894	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300709374
28	NC_014297	GTC	2	6	1932	1937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300709374
29	NC_014297	TCG	2	6	1981	1986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300709374
30	NC_014297	GAG	2	6	1998	2003	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300709374
31	NC_014297	CGG	2	6	2006	2011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300709374
32	NC_014297	GCC	2	6	2042	2047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300709374
33	NC_014297	TGA	2	6	2107	2112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300709374
34	NC_014297	AGG	2	6	2131	2136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300709374
35	NC_014297	AGG	2	6	2197	2202	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300709374
36	NC_014297	GAG	2	6	2385	2390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300709374
37	NC_014297	CTC	2	6	2471	2476	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300709374
38	NC_014297	TCA	2	6	2491	2496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300709374
39	NC_014297	CGG	2	6	2519	2524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300709374
40	NC_014297	CGA	2	6	2560	2565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300709375
41	NC_014297	GAG	2	6	2585	2590	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300709375
42	NC_014297	CGA	2	6	2620	2625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300709375
43	NC_014297	GCC	2	6	2650	2655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300709375
44	NC_014297	TCC	2	6	2663	2668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300709375
45	NC_014297	GAG	2	6	2756	2761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300709375
46	NC_014297	CCG	2	6	2903	2908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300709376
47	NC_014297	GCC	2	6	2912	2917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300709376
48	NC_014297	CTT	2	6	2920	2925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300709376
49	NC_014297	CGC	2	6	2991	2996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300709376
50	NC_014297	GCG	2	6	2998	3003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300709376
51	NC_014297	CGA	2	6	3144	3149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300709376
52	NC_014297	CGG	2	6	3207	3212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300709376
53	NC_014297	GCC	2	6	3225	3230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300709376
54	NC_014297	CGG	2	6	3254	3259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300709376
55	NC_014297	CGA	2	6	3312	3317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300709376
56	NC_014297	CCG	2	6	3353	3358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300709376
57	NC_014297	CGA	2	6	3465	3470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300709376
58	NC_014297	CGG	2	6	3472	3477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300709376
59	NC_014297	CGC	2	6	3539	3544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300709376
60	NC_014297	TGA	2	6	3572	3577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300709376
61	NC_014297	CGG	2	6	3632	3637	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300709376
62	NC_014297	GTC	2	6	3696	3701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300709376
63	NC_014297	GCG	2	6	3713	3718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300709377
64	NC_014297	TCG	2	6	3787	3792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300709377
65	NC_014297	CGA	2	6	3821	3826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300709377
66	NC_014297	CGT	2	6	3834	3839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300709377
67	NC_014297	CGT	2	6	3930	3935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300709377
68	NC_014297	GAC	2	6	3972	3977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300709377
69	NC_014297	ACC	2	6	4009	4014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300709377
70	NC_014297	AGC	2	6	4018	4023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300709377
71	NC_014297	CGG	2	6	4073	4078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300709377
72	NC_014297	ACG	2	6	4240	4245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300709377
73	NC_014297	GCG	2	6	4353	4358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300709378
74	NC_014297	CGG	2	6	4372	4377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300709378
75	NC_014297	ATG	2	6	4593	4598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300709378
76	NC_014297	GTC	2	6	4668	4673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300709379
77	NC_014297	GTC	2	6	4704	4709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300709379
78	NC_014297	TCG	2	6	4711	4716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300709379
79	NC_014297	AGG	2	6	4766	4771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300709379
80	NC_014297	TCC	2	6	4801	4806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300709379
81	NC_014297	TCG	2	6	4807	4812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300709379
82	NC_014297	CGA	3	9	4817	4825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300709379
83	NC_014297	TCG	2	6	4840	4845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300709379
84	NC_014297	CGG	2	6	4856	4861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300709379
85	NC_014297	CTG	2	6	4904	4909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300709379
86	NC_014297	ACC	2	6	4921	4926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300709379
87	NC_014297	AGG	2	6	5054	5059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300709379
88	NC_014297	CGA	2	6	5120	5125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300709379
89	NC_014297	CGA	2	6	5162	5167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300709379
90	NC_014297	TCG	2	6	5269	5274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300709379
91	NC_014297	TTC	2	6	5278	5283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300709379
92	NC_014297	TCG	2	6	5347	5352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300709379
93	NC_014297	GTA	2	6	5418	5423	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300709379
94	NC_014297	CGT	2	6	5429	5434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300709379
95	NC_014297	CGG	2	6	5471	5476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300709379
96	NC_014297	AGT	2	6	5492	5497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	300709379
97	NC_014297	CTC	2	6	5544	5549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300709379
98	NC_014297	GGA	2	6	5552	5557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300709379
99	NC_014297	TCG	2	6	5584	5589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300709379
100	NC_014297	CCG	2	6	5659	5664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300709379
101	NC_014297	CGG	2	6	5672	5677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300709379
102	NC_014297	TTC	2	6	5776	5781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300709379
103	NC_014297	CGG	2	6	5783	5788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300709379
104	NC_014297	TCG	3	9	5881	5889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300709379
105	NC_014297	CGA	2	6	5972	5977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300709379
106	NC_014297	TCC	2	6	6025	6030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300709379
107	NC_014297	TTC	2	6	6154	6159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	300709379
108	NC_014297	CAT	2	6	6222	6227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	300709379
109	NC_014297	TGG	2	6	6253	6258	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300709379
110	NC_014297	CGT	2	6	6293	6298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300709379
111	NC_014297	CTC	2	6	6327	6332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300709379
112	NC_014297	CTC	2	6	6387	6392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	300709379
113	NC_014297	TGT	2	6	6485	6490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	300709380
114	NC_014297	GGT	2	6	6513	6518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	300709380
115	NC_014297	CGG	2	6	6522	6527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300709380
116	NC_014297	CGC	2	6	6594	6599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300709380
117	NC_014297	GAA	2	6	6658	6663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	300709380
118	NC_014297	CAG	2	6	6670	6675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300709380
119	NC_014297	CGG	2	6	6681	6686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	300709380
120	NC_014297	GCC	2	6	6717	6722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300709380
121	NC_014297	GTC	2	6	6751	6756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300709380
122	NC_014297	CGT	2	6	6774	6779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300709380
123	NC_014297	CGA	2	6	7103	7108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300709381
124	NC_014297	CGA	2	6	7115	7120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300709381
125	NC_014297	GAG	2	6	7140	7145	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	300709381
126	NC_014297	ACC	2	6	7252	7257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	300709382
127	NC_014297	GTC	2	6	7309	7314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	300709382
128	NC_014297	CGC	2	6	7323	7328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300709382
129	NC_014297	GAC	2	6	7372	7377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	300709382
130	NC_014297	CGC	3	9	7389	7397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300709382
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500	NC_014297	CGC	2	6	34441	34446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	300709399

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