MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Acinetobacter oleivorans DR1 chromosome

Total Repeats: 231

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014259	AATTTA	2	12	166	177	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014259	AAAAAC	2	12	12907	12918	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_014259	GAAATC	2	12	22923	22934	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_014259	TTCTTA	2	12	40085	40096	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_014259	TACAGA	2	12	52635	52646	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_014259	TTATTT	2	12	63571	63582	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014259	AAATTG	2	12	72790	72801	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014259	AAAAGT	2	12	96016	96027	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014259	TAATTT	2	12	111201	111212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014259	AATTTA	2	12	133019	133030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014259	TAAAAT	2	12	137178	137189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014259	ATAAAA	2	12	155649	155660	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014259	AAAAGC	2	12	175293	175304	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_014259	TTTTTG	2	12	177925	177936	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014259	TAAAAG	2	12	189528	189539	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014259	TTTAAA	2	12	234636	234647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014259	AAATTA	2	12	237575	237586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014259	AATTTA	2	12	238785	238796	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014259	AATTTA	2	12	238839	238850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014259	TTTAAT	2	12	247800	247811	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014259	TTTTAA	2	12	258913	258924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014259	AAAAAG	2	12	269503	269514	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014259	ATTTTT	2	12	292436	292447	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014259	TAAAAC	2	12	314022	314033	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_014259	ATAAAT	2	12	345644	345655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014259	TATTTT	2	12	365919	365930	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014259	ATTTTT	2	12	391028	391039	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014259	ATTTAA	2	12	393313	393324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014259	AAAAAT	2	12	400885	400896	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014259	GATAAA	2	12	440294	440305	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014259	TTCTGT	2	12	443793	443804	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_014259	AAAATG	2	12	492489	492500	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014259	GAAATC	2	12	510057	510068	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014259	GAAATC	2	12	545589	545600	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014259	AAAATT	2	12	583796	583807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014259	ATGGTA	2	12	592211	592222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014259	TAATCT	2	12	597176	597187	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_014259	ATTTTT	2	12	619352	619363	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014259	GTCAAT	2	12	651115	651126	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_014259	GAAAAA	2	12	653234	653245	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014259	TTAATT	2	12	664543	664554	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014259	TAAAAA	2	12	681982	681993	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014259	AGGTTT	2	12	699600	699611	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014259	AAAGTT	2	12	711554	711565	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014259	ATATTT	2	12	718250	718261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014259	ATAAAG	2	12	726945	726956	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014259	ATTTTA	2	12	727445	727456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014259	TTGGTT	2	12	736884	736895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014259	GATGCG	2	12	808284	808295	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_014259	CAGATC	2	12	808780	808791	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014259	AACAGT	2	12	808952	808963	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_014259	AGTGTA	2	12	809328	809339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014259	ACAGCA	2	12	810816	810827	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014259	CGACTG	2	12	810961	810972	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014259	ACAGCA	2	12	811332	811343	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014259	CGACTG	2	12	811477	811488	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014259	ACAGCA	2	12	811848	811859	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014259	CGACTG	2	12	811993	812004	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_014259	ACAGCA	2	12	812364	812375	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014259	CGACTG	2	12	812509	812520	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014259	ACAGCA	2	12	812880	812891	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014259	CGACTG	2	12	813025	813036	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_014259	ACAGCA	2	12	813396	813407	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014259	CGACTG	2	12	813541	813552	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014259	ACAGCA	2	12	813912	813923	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014259	CGACTG	2	12	814057	814068	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014259	GGCACA	2	12	814701	814712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014259	GGCACA	2	12	815271	815282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014259	GGCACA	2	12	815841	815852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_014259	GGCACA	2	12	816411	816422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014259	TCTTGT	2	12	818304	818315	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_014259	TTTAGT	2	12	824647	824658	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014259	TTTTAT	2	12	885177	885188	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014259	TTTAAG	2	12	895114	895125	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014259	CAAAGT	2	12	979508	979519	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_014259	TATTCT	2	12	995441	995452	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_014259	AATCTT	2	12	1035866	1035877	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_014259	CAAAAA	2	12	1072851	1072862	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_014259	AAATGA	2	12	1083732	1083743	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014259	CGAAGC	2	12	1088718	1088729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_014259	AATATT	2	12	1128172	1128183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014259	TGAAAT	2	12	1137613	1137624	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014259	TAGAAA	2	12	1152606	1152617	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014259	TAAAAA	2	12	1162413	1162424	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014259	GACATT	2	12	1181362	1181373	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_014259	AGCAAA	2	12	1241188	1241199	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_014259	TTTAAT	2	12	1270418	1270429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014259	TATAAA	2	12	1292874	1292885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014259	ATTTTC	2	12	1301844	1301855	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_014259	AGCTTA	2	12	1311361	1311372	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_014259	TTTAAT	2	12	1350073	1350084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014259	TTTCAT	2	12	1352102	1352113	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_014259	CAAAAA	2	12	1359902	1359913	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_014259	ATGTTC	2	12	1364635	1364646	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_014259	TTTAAT	2	12	1392768	1392779	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014259	TTAAGA	2	12	1429517	1429528	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014259	TAAATT	2	12	1434610	1434621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014259	TAAAAA	2	12	1455317	1455328	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014259	TTTTAT	2	12	1466469	1466480	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014259	AAATAA	2	12	1469700	1469711	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014259	TTATCT	2	12	1470511	1470522	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_014259	ATCATT	2	12	1482179	1482190	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_014259	TAAAAA	2	12	1496384	1496395	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014259	GTCAGA	2	12	1519179	1519190	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_014259	AATGAT	2	12	1553598	1553609	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014259	ATATTT	2	12	1553725	1553736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014259	TTATTT	2	12	1555974	1555985	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014259	TAATTT	2	12	1588163	1588174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014259	CTTAAT	2	12	1632584	1632595	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_014259	GCCCTT	2	12	1654736	1654747	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
111	NC_014259	TAAAAA	2	12	1732557	1732568	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014259	CATACT	2	12	1751187	1751198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_014259	AATTTG	2	12	1794858	1794869	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014259	TTTAAT	2	12	1814361	1814372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014259	TTTAAA	2	12	1853915	1853926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014259	TTGATA	2	12	1866093	1866104	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014259	TCAAAA	2	12	1920029	1920040	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_014259	TTAATT	2	12	1924503	1924514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014259	AAAGGA	2	12	1932817	1932828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014259	TTTACT	2	12	1934634	1934645	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_014259	TTAAAA	2	12	1968521	1968532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014259	TATAAA	2	12	1968559	1968570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014259	TAATAC	2	12	1972015	1972026	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_014259	TACAAA	2	12	1978694	1978705	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_014259	ATATTT	2	12	1992915	1992926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014259	AGTAAA	2	12	2042656	2042667	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014259	ATATTT	2	12	2064163	2064174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014259	TAAAAA	2	12	2067943	2067954	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.