MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Pantoea vagans C9-1 plasmid pPag3

Total Repeats: 7661

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014258	AAC	2	6	33	38	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014258	TAT	2	6	47	52	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014258	TCA	2	6	60	65	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014258	GCA	2	6	235	240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717100
5	NC_014258	CTG	2	6	574	579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717100
6	NC_014258	ACG	2	6	680	685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717100
7	NC_014258	GCA	2	6	763	768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717100
8	NC_014258	TGA	2	6	849	854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717100
9	NC_014258	GGC	2	6	909	914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717100
10	NC_014258	CGA	2	6	1050	1055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717100
11	NC_014258	GTG	2	6	1109	1114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717100
12	NC_014258	ACT	2	6	1136	1141	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717100
13	NC_014258	GCA	2	6	1239	1244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717100
14	NC_014258	GAA	2	6	1306	1311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298717100
15	NC_014258	CGG	2	6	1395	1400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717100
16	NC_014258	GAA	2	6	1404	1409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298717100
17	NC_014258	GAA	2	6	1476	1481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298717100
18	NC_014258	CCG	2	6	1482	1487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717100
19	NC_014258	GCA	2	6	1551	1556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717101
20	NC_014258	CCA	2	6	1617	1622	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717101
21	NC_014258	GCA	2	6	1800	1805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717101
22	NC_014258	GCA	2	6	1878	1883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717101
23	NC_014258	TCC	2	6	1891	1896	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298717101
24	NC_014258	TCA	2	6	2096	2101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717101
25	NC_014258	TTG	2	6	2159	2164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298717101
26	NC_014258	TGC	2	6	2356	2361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717101
27	NC_014258	GAT	2	6	2384	2389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717101
28	NC_014258	AGC	2	6	2423	2428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717101
29	NC_014258	GGT	2	6	2445	2450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717101
30	NC_014258	CGG	2	6	2603	2608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717101
31	NC_014258	CCG	2	6	2715	2720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_014258	GCC	2	6	2834	2839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717102
33	NC_014258	CAG	2	6	2854	2859	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717102
34	NC_014258	AAT	2	6	2878	2883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298717102
35	NC_014258	TGC	2	6	2885	2890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717102
36	NC_014258	CCA	2	6	3016	3021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717102
37	NC_014258	TGG	2	6	3134	3139	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014258	GAC	2	6	3174	3179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014258	CGC	2	6	3234	3239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717103
40	NC_014258	CAG	2	6	3301	3306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717103
41	NC_014258	GCA	2	6	3369	3374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717103
42	NC_014258	CCG	2	6	3396	3401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717103
43	NC_014258	CCA	2	6	3456	3461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717103
44	NC_014258	ACC	2	6	3470	3475	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717103
45	NC_014258	CGC	2	6	3504	3509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717103
46	NC_014258	ATC	2	6	3520	3525	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717103
47	NC_014258	CCA	2	6	3561	3566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717103
48	NC_014258	GGT	2	6	3684	3689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717103
49	NC_014258	GCA	2	6	3748	3753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717103
50	NC_014258	TCA	2	6	3785	3790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717103
51	NC_014258	CGT	2	6	3875	3880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717103
52	NC_014258	AGC	2	6	3908	3913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717103
53	NC_014258	AAT	2	6	4021	4026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014258	TAA	2	6	4045	4050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014258	GAA	2	6	4103	4108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014258	GCA	2	6	4121	4126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717104
57	NC_014258	AGG	2	6	4195	4200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298717104
58	NC_014258	CAG	2	6	4236	4241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717104
59	NC_014258	TGC	2	6	4345	4350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717104
60	NC_014258	TGA	2	6	4445	4450	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717104
61	NC_014258	CAG	2	6	4476	4481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717105
62	NC_014258	TCG	2	6	4522	4527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717105
63	NC_014258	CCA	2	6	4583	4588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717105
64	NC_014258	AAT	3	9	4605	4613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298717105
65	NC_014258	CAG	2	6	4674	4679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717105
66	NC_014258	CGG	2	6	4771	4776	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717105
67	NC_014258	GAC	2	6	4787	4792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717105
68	NC_014258	CAG	2	6	4806	4811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717105
69	NC_014258	ATG	2	6	4984	4989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717105
70	NC_014258	CCG	2	6	5224	5229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717106
71	NC_014258	GGC	2	6	5319	5324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717106
72	NC_014258	CTG	2	6	5352	5357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717106
73	NC_014258	CAT	2	6	5438	5443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717106
74	NC_014258	ATG	2	6	5446	5451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717106
75	NC_014258	GTG	2	6	5457	5462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717106
76	NC_014258	GCG	2	6	5562	5567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717106
77	NC_014258	GCG	2	6	5660	5665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717106
78	NC_014258	CGC	2	6	5713	5718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717106
79	NC_014258	GCT	2	6	5750	5755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717106
80	NC_014258	CTG	2	6	5760	5765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717106
81	NC_014258	ATC	2	6	5801	5806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717107
82	NC_014258	GCC	2	6	5825	5830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717107
83	NC_014258	CAG	2	6	5897	5902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717107
84	NC_014258	CTG	2	6	5930	5935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717107
85	NC_014258	ACC	2	6	5948	5953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717107
86	NC_014258	ATT	2	6	6050	6055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298717107
87	NC_014258	GCA	2	6	6065	6070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717107
88	NC_014258	GCT	2	6	6079	6084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717107
89	NC_014258	CTT	2	6	6109	6114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_014258	ATG	2	6	6190	6195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014258	TCA	2	6	6201	6206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014258	TTC	2	6	6486	6491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298717108
93	NC_014258	GTG	2	6	6647	6652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717108
94	NC_014258	GCG	2	6	6672	6677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298717108
95	NC_014258	TGG	2	6	6714	6719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717108
96	NC_014258	CCG	2	6	6782	6787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717108
97	NC_014258	CGC	2	6	6801	6806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717108
98	NC_014258	CGC	2	6	6813	6818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717108
99	NC_014258	GAG	2	6	6821	6826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298717108
100	NC_014258	GCA	2	6	6875	6880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717108
101	NC_014258	CAG	3	9	6941	6949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717108
102	NC_014258	AGC	2	6	7022	7027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717109
103	NC_014258	GGT	2	6	7088	7093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717109
104	NC_014258	CAC	2	6	7160	7165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717109
105	NC_014258	CAG	2	6	7166	7171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717109
106	NC_014258	CGT	2	6	7198	7203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717109
107	NC_014258	GCA	4	12	7273	7284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717109
108	NC_014258	TAA	2	6	7359	7364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298717109
109	NC_014258	GCA	2	6	7393	7398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717109
110	NC_014258	CTG	2	6	7477	7482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717109
111	NC_014258	AGA	2	6	7618	7623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298717109
112	NC_014258	CAG	2	6	7631	7636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717109
113	NC_014258	CGT	2	6	7768	7773	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717109
114	NC_014258	AGC	2	6	7889	7894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717110
115	NC_014258	CAC	2	6	7956	7961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298717110
116	NC_014258	GCA	2	6	7988	7993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717110
117	NC_014258	GCA	2	6	7997	8002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717110
118	NC_014258	GTA	2	6	8014	8019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717110
119	NC_014258	CAG	2	6	8028	8033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717110
120	NC_014258	CGC	2	6	8055	8060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717110
121	NC_014258	AAT	2	6	8064	8069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298717110
122	NC_014258	CTG	2	6	8073	8078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717110
123	NC_014258	ATC	2	6	8224	8229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717110
124	NC_014258	ATG	2	6	8293	8298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717110
125	NC_014258	ACG	2	6	8508	8513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717110
126	NC_014258	TGC	2	6	8578	8583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717110
127	NC_014258	TCA	2	6	8638	8643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717110
128	NC_014258	CGC	2	6	8702	8707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717110
129	NC_014258	GCA	2	6	8882	8887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717110
130	NC_014258	CAG	2	6	9024	9029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717110
131	NC_014258	GGT	2	6	9126	9131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717110
132	NC_014258	CGC	2	6	9138	9143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298717110
133	NC_014258	CAG	2	6	9309	9314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717110
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145	NC_014258	CTG	2	6	9990	9995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717110
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169	NC_014258	CGT	2	6	11737	11742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298717111
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