MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Pantoea vagans C9-1 plasmid pPag3

Total Repeats: 458

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3	NC_014258	T	8	8	11942	11949	0 %	100 %	0 %	0 %	298717111
4	NC_014258	T	6	6	12263	12268	0 %	100 %	0 %	0 %	298717112
5	NC_014258	A	7	7	14075	14081	100 %	0 %	0 %	0 %	298717113
6	NC_014258	A	7	7	14618	14624	100 %	0 %	0 %	0 %	298717113
7	NC_014258	T	6	6	15729	15734	0 %	100 %	0 %	0 %	298717114
8	NC_014258	T	6	6	16097	16102	0 %	100 %	0 %	0 %	298717114
9	NC_014258	T	7	7	18122	18128	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014258	T	6	6	18697	18702	0 %	100 %	0 %	0 %	298717118
11	NC_014258	C	6	6	20225	20230	0 %	0 %	0 %	100 %	298717119
12	NC_014258	A	7	7	20888	20894	100 %	0 %	0 %	0 %	298717120
13	NC_014258	A	6	6	20957	20962	100 %	0 %	0 %	0 %	298717120
14	NC_014258	A	6	6	21167	21172	100 %	0 %	0 %	0 %	298717120
15	NC_014258	G	6	6	22198	22203	0 %	0 %	100 %	0 %	298717122
16	NC_014258	T	7	7	23656	23662	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014258	T	6	6	24467	24472	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014258	T	6	6	26497	26502	0 %	100 %	0 %	0 %	298717128
19	NC_014258	A	6	6	26588	26593	100 %	0 %	0 %	0 %	298717128
20	NC_014258	A	7	7	26841	26847	100 %	0 %	0 %	0 %	298717128
21	NC_014258	C	6	6	28823	28828	0 %	0 %	0 %	100 %	298717133
22	NC_014258	A	6	6	31852	31857	100 %	0 %	0 %	0 %	298717135
23	NC_014258	T	7	7	32194	32200	0 %	100 %	0 %	0 %	298717135
24	NC_014258	A	7	7	32339	32345	100 %	0 %	0 %	0 %	298717136
25	NC_014258	A	6	6	33468	33473	100 %	0 %	0 %	0 %	298717137
26	NC_014258	A	7	7	34497	34503	100 %	0 %	0 %	0 %	298717139
27	NC_014258	T	6	6	37207	37212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014258	T	7	7	37781	37787	0 %	100 %	0 %	0 %	298717143
29	NC_014258	A	6	6	38397	38402	100 %	0 %	0 %	0 %	298717144
30	NC_014258	A	7	7	40316	40322	100 %	0 %	0 %	0 %	298717147
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32	NC_014258	T	7	7	42122	42128	0 %	100 %	0 %	0 %	298717148
33	NC_014258	T	7	7	44335	44341	0 %	100 %	0 %	0 %	298717150
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35	NC_014258	A	6	6	48041	48046	100 %	0 %	0 %	0 %	298717154
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40	NC_014258	A	7	7	52558	52564	100 %	0 %	0 %	0 %	298717157
41	NC_014258	A	7	7	52872	52878	100 %	0 %	0 %	0 %	298717157
42	NC_014258	T	7	7	53163	53169	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014258	T	9	9	53532	53540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.