MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Helicobacter pylori B8 plasmid HPB8p

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014257	AAC	2	6	1017	1022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717636
2	NC_014257	CAA	2	6	1079	1084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717636
3	NC_014257	TGT	2	6	1170	1175	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298717636
4	NC_014257	TCA	2	6	1194	1199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717636
5	NC_014257	CAA	2	6	1886	1891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717638
6	NC_014257	TAA	2	6	1917	1922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298717638
7	NC_014257	TAA	2	6	1989	1994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298717638
8	NC_014257	AAC	2	6	2021	2026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717638
9	NC_014257	TGA	2	6	2269	2274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717639
10	NC_014257	ACA	2	6	2343	2348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717639
11	NC_014257	ACA	2	6	2533	2538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717639
12	NC_014257	ACT	2	6	2547	2552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717639
13	NC_014257	ACA	2	6	2553	2558	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717639
14	NC_014257	TTA	2	6	2639	2644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298717639
15	NC_014257	ATA	2	6	2660	2665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298717639
16	NC_014257	CAA	2	6	2738	2743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717639
17	NC_014257	AAT	2	6	2764	2769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298717639
18	NC_014257	ATG	2	6	2772	2777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717639
19	NC_014257	AAC	3	9	2934	2942	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717639
20	NC_014257	CTA	2	6	2971	2976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717639
21	NC_014257	CAA	2	6	3050	3055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717639
22	NC_014257	ACA	2	6	3061	3066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717639
23	NC_014257	TCA	2	6	3151	3156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717639
24	NC_014257	TCA	2	6	3166	3171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717639
25	NC_014257	TCA	2	6	3202	3207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717639
26	NC_014257	AAC	2	6	3285	3290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717639
27	NC_014257	CAG	2	6	3502	3507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298717639
28	NC_014257	ATT	2	6	3697	3702	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298717639
29	NC_014257	ACA	2	6	3852	3857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717639
30	NC_014257	CTT	2	6	3931	3936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298717639
31	NC_014257	AGA	2	6	3943	3948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298717639
32	NC_014257	ACA	2	6	4001	4006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298717639
33	NC_014257	TTC	2	6	4129	4134	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298717640
34	NC_014257	TTG	2	6	4255	4260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298717640
35	NC_014257	TCA	2	6	4321	4326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298717640
36	NC_014257	TCT	2	6	4378	4383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298717640
37	NC_014257	AGT	2	6	4423	4428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298717640
38	NC_014257	GTG	2	6	4525	4530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717640
39	NC_014257	AAG	2	6	5024	5029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298717640
40	NC_014257	TAA	2	6	5228	5233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298717640
41	NC_014257	TTA	2	6	5392	5397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298717640
42	NC_014257	GGT	2	6	5412	5417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717640
43	NC_014257	GTG	2	6	5489	5494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298717640
44	NC_014257	TTG	2	6	5631	5636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298717640

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.