MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori B8 chromosome

Total Repeats: 853

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014256	GCGCAC	2	12	2086	2097	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	298735502
2	NC_014256	CAAAAG	2	12	4187	4198	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	298735504
3	NC_014256	AAAATA	2	12	6625	6636	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	298735506
4	NC_014256	GTCAAA	2	12	10053	10064	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	298735509
5	NC_014256	AAAAGA	2	12	10538	10549	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	298735509
6	NC_014256	TGATTT	2	12	10748	10759	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	298735509
7	NC_014256	AGAAAA	2	12	12534	12545	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	298735510
8	NC_014256	AAAAAG	2	12	13388	13399	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	298735510
9	NC_014256	AAAAGA	2	12	15959	15970	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	298735511
10	NC_014256	TCTTTA	2	12	18513	18524	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	298735514
11	NC_014256	TTCCAA	2	12	18536	18547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298735514
12	NC_014256	TTTCTT	2	12	20106	20117	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	298735515
13	NC_014256	CGCTCG	2	12	20358	20369	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	298735515
14	NC_014256	CCGCTT	2	12	22813	22824	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	298735517
15	NC_014256	CACTTC	2	12	22937	22948	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	298735517
16	NC_014256	AAAATA	2	12	24204	24215	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	298735520
17	NC_014256	TAGCGA	2	12	24490	24501	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	298735520
18	NC_014256	ATGACA	2	12	25536	25547	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	298735521
19	NC_014256	TGAGCG	2	12	27027	27038	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	298735522
20	NC_014256	TTAGAA	2	12	32462	32473	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	298735526
21	NC_014256	GACGCT	2	12	34316	34327	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	298735528
22	NC_014256	TGATAA	2	12	38471	38482	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	298735532
23	NC_014256	TAAACT	2	12	40259	40270	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	298735534
24	NC_014256	AATTTT	2	12	42699	42710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298735536
25	NC_014256	TCGCTC	2	12	44009	44020	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	298735539
26	NC_014256	GTGGAA	2	12	52252	52263	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	298735545
27	NC_014256	GTTTTT	2	12	52941	52952	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	298735547
28	NC_014256	CTTATT	2	12	53390	53401	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	298735547
29	NC_014256	GAAAAT	2	12	55279	55290	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	298735550
30	NC_014256	ATTTTG	2	12	58331	58342	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	298735551
31	NC_014256	TAAGAC	2	12	58511	58522	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	298735552
32	NC_014256	TTTTTA	2	12	62324	62335	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	298735556
33	NC_014256	TTAAAA	2	12	65645	65656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298735559
34	NC_014256	TTGATT	2	12	65829	65840	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	298735559
35	NC_014256	ACTAAA	2	12	66861	66872	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	298735561
36	NC_014256	AAAGAC	2	12	68493	68504	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	298735561
37	NC_014256	GGGATT	2	12	72167	72178	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	298735565
38	NC_014256	TTACAA	2	12	72670	72681	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	298735565
39	NC_014256	TGCGAT	2	12	73074	73085	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	298735565
40	NC_014256	AGAAAA	2	12	75225	75236	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	298735568
41	NC_014256	AGAGCA	2	12	75759	75770	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	298735569
42	NC_014256	TAAAAA	2	12	77470	77481	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014256	GCTCTT	2	12	81020	81031	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	298735572
44	NC_014256	GATAAG	2	12	81136	81147	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	298735572
45	NC_014256	GTTGCG	2	12	83043	83054	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	298735575
46	NC_014256	AAGAAT	2	12	85096	85107	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	298735578
47	NC_014256	CTATAG	2	12	87207	87218	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	298735581
48	NC_014256	TTGGGT	3	18	88056	88073	0 %	50 %	50 %	0 %	298735581
49	NC_014256	CAAGTT	2	12	88529	88540	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	298735582
50	NC_014256	ATCAAT	2	12	90144	90155	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	298735583
51	NC_014256	GTTTCT	2	12	90328	90339	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	298735583
52	NC_014256	GTTTTT	2	12	90341	90352	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	298735583
53	NC_014256	TAAACA	2	12	93187	93198	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_014256	CGCTCC	2	12	94599	94610	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	298735591
55	NC_014256	GCCTGT	2	12	95862	95873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298735593
56	NC_014256	TCAAAA	2	12	101037	101048	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_014256	CTTTTT	2	12	101419	101430	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	298735599
58	NC_014256	ATGCGA	2	12	102124	102135	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	298735601
59	NC_014256	ACTTAG	2	12	102430	102441	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_014256	ATCGCT	2	12	105172	105183	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	298735606
61	NC_014256	ATCGCT	2	12	105715	105726	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	298735606
62	NC_014256	ATGGTG	2	12	106445	106456	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	298735608
63	NC_014256	ATGGTG	2	12	106487	106498	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	298735608
64	NC_014256	CTGTTG	2	12	106517	106528	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	298735608
65	NC_014256	AATTAG	2	12	107031	107042	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	298735609
66	NC_014256	CCCATG	2	12	108268	108279	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	298735610
67	NC_014256	GTGGGT	2	12	109870	109881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298735611
68	NC_014256	GCGATG	2	12	110465	110476	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	298735611
69	NC_014256	CTTGCA	2	12	110655	110666	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	298735611
70	NC_014256	ATTTTT	2	12	112226	112237	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014256	ATTTTT	2	12	112417	112428	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014256	CTAAAA	2	12	114062	114073	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_014256	GCATTT	2	12	114587	114598	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	298735618
74	NC_014256	AGAAAA	2	12	114731	114742	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	298735618
75	NC_014256	CTATTT	2	12	121171	121182	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_014256	TGAGCA	2	12	122490	122501	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	298735625
77	NC_014256	CTAAGG	2	12	122730	122741	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	298735625
78	NC_014256	GTGCCT	2	12	125606	125617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298735628
79	NC_014256	GATTTT	2	12	125942	125953	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	298735628
80	NC_014256	GTTTTT	2	12	129851	129862	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	298735632
81	NC_014256	TTGCAT	2	12	129870	129881	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	298735632
82	NC_014256	GGATTG	2	12	131463	131474	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	298735633
83	NC_014256	TGGTTT	2	12	131606	131617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298735633
84	NC_014256	AGGTTT	2	12	132877	132888	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	298735634
85	NC_014256	GGTTTG	2	12	132902	132913	0 %	50 %	50 %	0 %	298735634
86	NC_014256	GGTTTG	3	18	132926	132943	0 %	50 %	50 %	0 %	298735634
87	NC_014256	TGGAGA	2	12	133240	133251	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	298735634
88	NC_014256	GGGCAG	2	12	139042	139053	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	298735643
89	NC_014256	AGCGTC	2	12	143819	143830	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	298735647
90	NC_014256	TAGTTT	2	12	144425	144436	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	298735647
91	NC_014256	CCAAAC	2	12	145971	145982	50 %	0 %	0 %	50 %	298735648
92	NC_014256	GCTTAG	2	12	148533	148544	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	298735652
93	NC_014256	GATTTG	2	12	151567	151578	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	298735656
94	NC_014256	GTAAAG	2	12	155344	155355	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	298735663
95	NC_014256	CAAGGG	2	12	158208	158219	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	298735671
96	NC_014256	CAAAAC	2	12	160284	160295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298735675
97	NC_014256	ATCACT	2	12	162482	162493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298735680
98	NC_014256	ACACCA	2	12	165529	165540	50 %	0 %	0 %	50 %	298735686
99	NC_014256	TAGCTA	2	12	167736	167747	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	298735689
100	NC_014256	CGAATA	2	12	169137	169148	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	298735690
101	NC_014256	TTGCAA	2	12	170044	170055	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	298735692
102	NC_014256	CGAATA	2	12	171148	171159	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	298735693
103	NC_014256	TGCATA	2	12	171312	171323	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	298735693
104	NC_014256	TAACCT	2	12	172270	172281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298735694
105	NC_014256	AGAAAA	2	12	177091	177102	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	298735698
106	NC_014256	TAGGCT	2	12	179179	179190	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_014256	CGTGAG	2	12	183052	183063	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	298735702
108	NC_014256	CAAAAA	2	12	183421	183432	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	298735703
109	NC_014256	CCAAAA	2	12	184423	184434	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298735703
110	NC_014256	AAAATC	2	12	184717	184728	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	298735704
111	NC_014256	CAACAC	2	12	187560	187571	50 %	0 %	0 %	50 %	298735705
112	NC_014256	GCTTTA	2	12	187870	187881	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	298735705
113	NC_014256	CAAAGC	2	12	190966	190977	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	298735710
114	NC_014256	TTCATT	2	12	193771	193782	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	298735711
115	NC_014256	TAAGCG	2	12	195147	195158	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	298735713
116	NC_014256	TTGGTT	2	12	199866	199877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298735721
117	NC_014256	AAAACA	2	12	200374	200385	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	298735722
118	NC_014256	AAGAAA	2	12	205181	205192	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	298735726
119	NC_014256	AAATAC	2	12	208551	208562	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	298735729
120	NC_014256	AATGCA	2	12	210854	210865	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_014256	GCGCGA	2	12	211200	211211	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	298735733
122	NC_014256	TCTTTT	2	12	213260	213271	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	298735734
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131	NC_014256	GGGGCT	2	12	229038	229049	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	298735755
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154	NC_014256	TAAGGA	2	12	272412	272423	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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224	NC_014256	GATATA	2	12	443413	443424	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	298735968
225	NC_014256	ATTTTT	2	12	444563	444574	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	298735971
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228	NC_014256	TTTAAA	2	12	458576	458587	50 %	50 %	0 %	0 %	298735983
229	NC_014256	GAACAA	2	12	461857	461868	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	298735986
230	NC_014256	ACAAAT	2	12	461884	461895	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	298735986
231	NC_014256	TAAAAT	2	12	464042	464053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
232	NC_014256	CGCATG	2	12	467549	467560	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	298735997
233	NC_014256	GGCTTG	2	12	475698	475709	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	298736002
234	NC_014256	TCTTGC	2	12	477160	477171	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	298736002
235	NC_014256	AATTTC	2	12	478908	478919	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	298736002
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342	NC_014256	GCATTT	2	12	666120	666131	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	298736185
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346	NC_014256	AACAAG	2	12	670474	670485	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	298736190
347	NC_014256	AGAAAA	2	12	671483	671494	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	298736193
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349	NC_014256	TTCAGC	2	12	673750	673761	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	298736194
350	NC_014256	GTTTAT	2	12	675399	675410	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	298736195
351	NC_014256	ATTTCA	2	12	679712	679723	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	298736200
352	NC_014256	TTTTTG	2	12	680448	680459	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	298736201
353	NC_014256	CTTTTT	2	12	681092	681103	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	298736201
354	NC_014256	TTTAAA	2	12	682299	682310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
355	NC_014256	AGTTTT	2	12	685273	685284	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	298736207
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357	NC_014256	TATGAT	2	12	685976	685987	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
358	NC_014256	TTACAA	2	12	688451	688462	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
359	NC_014256	AGAAAA	2	12	688929	688940	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	298736210
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361	NC_014256	TCCATA	2	12	696671	696682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298736213
362	NC_014256	TACTAT	2	12	697520	697531	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	298736214
363	NC_014256	TGATTT	2	12	698757	698768	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	298736214
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365	NC_014256	TTTTTC	2	12	701043	701054	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	298736218
366	NC_014256	CATTCA	2	12	701717	701728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298736218
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375	NC_014256	TTTAAA	2	12	723743	723754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
376	NC_014256	TGGGCA	2	12	726397	726408	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	298736243
377	NC_014256	CAAGAA	2	12	726431	726442	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	298736243
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379	NC_014256	CAGAGC	2	12	730201	730212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298736249
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381	NC_014256	AGCTAA	2	12	730578	730589	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
382	NC_014256	ATTGGT	2	12	732460	732471	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	298736253
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386	NC_014256	CGCCTT	2	12	740118	740129	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	298736261
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394	NC_014256	TGGCGA	2	12	758560	758571	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	298736283
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451	NC_014256	CAAGCC	2	12	891002	891013	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	298736397
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455	NC_014256	ATTCCA	2	12	895550	895561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298736404
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459	NC_014256	TAAAAA	2	12	900110	900121	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	298736407
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461	NC_014256	TGTATA	2	12	902421	902432	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	298736410
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463	NC_014256	GATTTG	2	12	905535	905546	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	298736411
464	NC_014256	AATAAG	2	12	906255	906266	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	298736414
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466	NC_014256	AATGGC	2	12	912957	912968	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	298736422
467	NC_014256	CTCGCG	2	12	915509	915520	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	298736423
468	NC_014256	GAGCCA	2	12	916073	916084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298736424
469	NC_014256	AGCTTG	2	12	918199	918210	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	298736425
470	NC_014256	CTTCCA	2	12	923068	923079	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	298736429
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