MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori B8 chromosome

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014256	TAAAAA	2	12	77470	77481	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014256	TAAACA	2	12	93187	93198	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_014256	TCAAAA	2	12	101037	101048	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_014256	ACTTAG	2	12	102430	102441	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_014256	ATTTTT	2	12	112226	112237	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014256	ATTTTT	2	12	112417	112428	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014256	CTAAAA	2	12	114062	114073	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_014256	CTATTT	2	12	121171	121182	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014256	TAGGCT	2	12	179179	179190	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014256	AATGCA	2	12	210854	210865	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_014256	CAATAA	2	12	218768	218779	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_014256	AAGTTT	2	12	228245	228256	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014256	GAATTT	2	12	236415	236426	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014256	AGTAAA	2	12	245306	245317	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014256	TTAAGT	2	12	251895	251906	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014256	TATATG	2	12	258877	258888	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014256	GAAAAA	2	12	259899	259910	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014256	CTCTTT	2	12	266891	266902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014256	ATACAA	2	12	269992	270003	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_014256	ATGCGC	2	12	272394	272405	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014256	TAAGGA	2	12	272412	272423	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014256	ATTTTT	2	12	289235	289246	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014256	TAGCGT	2	12	321631	321642	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_014256	TAATTT	2	12	322150	322161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014256	TAAAAT	2	12	464042	464053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014256	AAAAAC	2	12	492349	492360	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_014256	ATTTTG	2	12	492676	492687	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014256	AGATTT	2	12	493183	493194	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014256	TTGGTT	2	12	495785	495796	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014256	TTTTTG	2	12	529044	529055	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014256	TGATTG	2	12	530258	530269	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014256	ACCCAT	2	12	550591	550602	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_014256	ATTTTA	2	12	568679	568690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014256	AAGAAA	2	12	577333	577344	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014256	TTCAAT	2	12	600221	600232	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_014256	CCCAAA	2	12	606124	606135	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_014256	ATTATA	2	12	607717	607728	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014256	TCAAAA	2	12	628614	628625	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_014256	AATGCA	2	12	628697	628708	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_014256	TTTAAT	2	12	655925	655936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014256	AAAAAC	2	12	664613	664624	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_014256	TTTAAA	2	12	682299	682310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014256	TATGAT	2	12	685976	685987	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014256	TTACAA	2	12	688451	688462	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_014256	GAATTA	2	12	716651	716662	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014256	TTTAAA	2	12	723743	723754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014256	AGCTAA	2	12	730578	730589	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_014256	ATTTTA	2	12	756689	756700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014256	AAGAAA	2	12	868768	868779	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014256	AATGAG	2	12	868804	868815	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014256	AAAAAT	2	12	874573	874584	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014256	CTTTTT	2	12	888185	888196	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_014256	AATTAA	2	12	894957	894968	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014256	ATTTTT	2	12	1065120	1065131	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014256	AAAGAA	2	12	1103917	1103928	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014256	TTATTT	2	12	1111966	1111977	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014256	TATTTT	2	12	1112018	1112029	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014256	AAAAAC	2	12	1185206	1185217	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_014256	AACACA	2	12	1203069	1203080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014256	TCAAAA	2	12	1217465	1217476	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_014256	TAAAAT	2	12	1292675	1292686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014256	TTTTAA	2	12	1315569	1315580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014256	ATTTTT	2	12	1372340	1372351	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014256	GTTTTT	2	12	1376355	1376366	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014256	AAACAA	2	12	1386619	1386630	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_014256	TTTTAA	2	12	1399744	1399755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014256	CTAAAA	2	12	1408230	1408241	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_014256	TGTTTT	2	12	1411639	1411650	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014256	ATTTGT	2	12	1446199	1446210	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014256	ATCTTA	2	12	1448293	1448304	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_014256	TTAGGG	2	12	1453468	1453479	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014256	AGTTTT	2	12	1526698	1526709	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014256	AGCGGG	2	12	1540256	1540267	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_014256	AAGAAA	2	12	1569058	1569069	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014256	GTGTTT	2	12	1573707	1573718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014256	TTTAAT	2	12	1578337	1578348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014256	TTATAG	2	12	1582272	1582283	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014256	AAAATA	2	12	1593854	1593865	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014256	AGCTTA	2	12	1596122	1596133	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_014256	TAATCA	2	12	1596343	1596354	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_014256	GATAAG	2	12	1650445	1650456	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.