MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Helicobacter pylori B8 chromosome

Total Repeats: 1346

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014256	TAAAA	2	10	1736	1745	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014256	GAATT	2	10	2950	2959	40 %	40 %	20 %	0 %	298735502
3	NC_014256	CAAGC	2	10	3268	3277	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_014256	TGAAA	2	10	3372	3381	60 %	20 %	20 %	0 %	298735503
5	NC_014256	AGGGT	2	10	4684	4693	20 %	20 %	60 %	0 %	298735504
6	NC_014256	ATTTT	2	10	4882	4891	20 %	80 %	0 %	0 %	298735505
7	NC_014256	TAATT	2	10	5138	5147	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014256	AGAAA	2	10	5344	5353	80 %	0 %	20 %	0 %	298735506
9	NC_014256	TCATT	2	10	5617	5626	20 %	60 %	0 %	20 %	298735506
10	NC_014256	GTCAA	2	10	11271	11280	40 %	20 %	20 %	20 %	298735509
11	NC_014256	CAAGA	2	10	12299	12308	60 %	0 %	20 %	20 %	298735510
12	NC_014256	ATATA	2	10	13644	13653	60 %	40 %	0 %	0 %	298735510
13	NC_014256	GATAG	2	10	14401	14410	40 %	20 %	40 %	0 %	298735510
14	NC_014256	AGAAA	2	10	14562	14571	80 %	0 %	20 %	0 %	298735510
15	NC_014256	ACGCT	2	10	14703	14712	20 %	20 %	20 %	40 %	298735510
16	NC_014256	AAAAG	2	10	14922	14931	80 %	0 %	20 %	0 %	298735510
17	NC_014256	AGAAA	2	10	16950	16959	80 %	0 %	20 %	0 %	298735512
18	NC_014256	TTTAA	2	10	17676	17685	40 %	60 %	0 %	0 %	298735513
19	NC_014256	TGGGT	2	10	20268	20277	0 %	40 %	60 %	0 %	298735515
20	NC_014256	TAAAC	2	10	20498	20507	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_014256	GCCCG	2	10	21749	21758	0 %	0 %	40 %	60 %	298735517
22	NC_014256	ATCCA	2	10	21809	21818	40 %	20 %	0 %	40 %	298735517
23	NC_014256	CCGAT	2	10	24664	24673	20 %	20 %	20 %	40 %	298735520
24	NC_014256	AAATA	2	10	24812	24821	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014256	TCAAA	2	10	26068	26077	60 %	20 %	0 %	20 %	298735521
26	NC_014256	GGCGT	2	10	28188	28197	0 %	20 %	60 %	20 %	298735523
27	NC_014256	TATTT	2	10	30253	30262	20 %	80 %	0 %	0 %	298735525
28	NC_014256	TTTGG	2	10	31883	31892	0 %	60 %	40 %	0 %	298735526
29	NC_014256	TAAAA	2	10	36485	36494	80 %	20 %	0 %	0 %	298735530
30	NC_014256	TATTT	2	10	37408	37417	20 %	80 %	0 %	0 %	298735531
31	NC_014256	AAAAT	2	10	38076	38085	80 %	20 %	0 %	0 %	298735531
32	NC_014256	ATAAA	2	10	39174	39183	80 %	20 %	0 %	0 %	298735532
33	NC_014256	AAAAT	2	10	39248	39257	80 %	20 %	0 %	0 %	298735532
34	NC_014256	TAAAA	2	10	40564	40573	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014256	TAATG	2	10	40841	40850	40 %	40 %	20 %	0 %	298735535
36	NC_014256	TGTGG	2	10	41961	41970	0 %	40 %	60 %	0 %	298735536
37	NC_014256	AAAAC	2	10	43406	43415	80 %	0 %	0 %	20 %	298735537
38	NC_014256	ATAGA	2	10	43901	43910	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014256	GGGCG	2	10	44193	44202	0 %	0 %	80 %	20 %	298735539
40	NC_014256	AAACA	2	10	48081	48090	80 %	0 %	0 %	20 %	298735541
41	NC_014256	TGGCG	2	10	48961	48970	0 %	20 %	60 %	20 %	298735542
42	NC_014256	TAGGG	2	10	49486	49495	20 %	20 %	60 %	0 %	298735542
43	NC_014256	TTGTT	2	10	49532	49541	0 %	80 %	20 %	0 %	298735543
44	NC_014256	ACAAG	2	10	49566	49575	60 %	0 %	20 %	20 %	298735543
45	NC_014256	TCAAA	2	10	49740	49749	60 %	20 %	0 %	20 %	298735543
46	NC_014256	TTTTA	2	10	50227	50236	20 %	80 %	0 %	0 %	298735543
47	NC_014256	AACGC	2	10	51076	51085	40 %	0 %	20 %	40 %	298735544
48	NC_014256	TTATT	2	10	52406	52415	20 %	80 %	0 %	0 %	298735546
49	NC_014256	TTTGC	2	10	53827	53836	0 %	60 %	20 %	20 %	298735549
50	NC_014256	TTTGC	2	10	58667	58676	0 %	60 %	20 %	20 %	298735552
51	NC_014256	TCAAA	2	10	58820	58829	60 %	20 %	0 %	20 %	298735552
52	NC_014256	ATCAA	2	10	59362	59371	60 %	20 %	0 %	20 %	298735552
53	NC_014256	AATCA	2	10	61019	61028	60 %	20 %	0 %	20 %	298735553
54	NC_014256	GTTTA	2	10	61812	61821	20 %	60 %	20 %	0 %	298735555
55	NC_014256	TGCGT	2	10	61876	61885	0 %	40 %	40 %	20 %	298735555
56	NC_014256	AAATC	2	10	62993	63002	60 %	20 %	0 %	20 %	298735557
57	NC_014256	AAAAT	2	10	64581	64590	80 %	20 %	0 %	0 %	298735558
58	NC_014256	TAATA	2	10	69398	69407	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014256	ATTAT	2	10	69456	69465	40 %	60 %	0 %	0 %	298735562
60	NC_014256	CAATC	2	10	71711	71720	40 %	20 %	0 %	40 %	298735564
61	NC_014256	TTTTA	2	10	72747	72756	20 %	80 %	0 %	0 %	298735565
62	NC_014256	TGAAG	2	10	73259	73268	40 %	20 %	40 %	0 %	298735566
63	NC_014256	ATTCA	2	10	73973	73982	40 %	40 %	0 %	20 %	298735566
64	NC_014256	TTTAT	2	10	74069	74078	20 %	80 %	0 %	0 %	298735567
65	NC_014256	AAAAG	2	10	78609	78618	80 %	0 %	20 %	0 %	298735572
66	NC_014256	GAAAA	2	10	80179	80188	80 %	0 %	20 %	0 %	298735572
67	NC_014256	GTTTG	2	10	80193	80202	0 %	60 %	40 %	0 %	298735572
68	NC_014256	GATCT	2	10	80401	80410	20 %	40 %	20 %	20 %	298735572
69	NC_014256	AATGA	2	10	80440	80449	60 %	20 %	20 %	0 %	298735572
70	NC_014256	TTAGA	2	10	82671	82680	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014256	CCAAA	2	10	84039	84048	60 %	0 %	0 %	40 %	298735577
72	NC_014256	AACAA	2	10	84367	84376	80 %	0 %	0 %	20 %	298735578
73	NC_014256	ATCAA	2	10	84974	84983	60 %	20 %	0 %	20 %	298735578
74	NC_014256	GGCAA	2	10	85172	85181	40 %	0 %	40 %	20 %	298735578
75	NC_014256	AAAAT	2	10	90852	90861	80 %	20 %	0 %	0 %	298735584
76	NC_014256	GTTTC	2	10	92801	92810	0 %	60 %	20 %	20 %	298735586
77	NC_014256	CTTCA	2	10	94466	94475	20 %	40 %	0 %	40 %	298735590
78	NC_014256	AGAGA	2	10	96618	96627	60 %	0 %	40 %	0 %	298735594
79	NC_014256	AAAGA	2	10	96936	96945	80 %	0 %	20 %	0 %	298735594
80	NC_014256	TCGTG	2	10	98535	98544	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_014256	GTTTG	2	10	99139	99148	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014256	AGACC	2	10	99699	99708	40 %	0 %	20 %	40 %	298735595
83	NC_014256	TTTAG	2	10	100982	100991	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014256	TAAAA	2	10	102788	102797	80 %	20 %	0 %	0 %	298735603
85	NC_014256	GAAGG	2	10	103572	103581	40 %	0 %	60 %	0 %	298735604
86	NC_014256	AAAAC	2	10	104652	104661	80 %	0 %	0 %	20 %	298735605
87	NC_014256	ACAAA	2	10	104900	104909	80 %	0 %	0 %	20 %	298735606
88	NC_014256	GCATG	2	10	106023	106032	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
89	NC_014256	GTGGC	2	10	111307	111316	0 %	20 %	60 %	20 %	298735612
90	NC_014256	TAGAA	2	10	111854	111863	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014256	ATCCA	3	15	112193	112207	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
92	NC_014256	TTTAA	2	10	112316	112325	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014256	GTTTT	2	10	112629	112638	0 %	80 %	20 %	0 %	298735614
94	NC_014256	GCTTT	2	10	113826	113835	0 %	60 %	20 %	20 %	298735616
95	NC_014256	TTTGA	2	10	115044	115053	20 %	60 %	20 %	0 %	298735618
96	NC_014256	AATTC	2	10	115258	115267	40 %	40 %	0 %	20 %	298735618
97	NC_014256	AACAG	2	10	116366	116375	60 %	0 %	20 %	20 %	298735618
98	NC_014256	TTTGA	2	10	116793	116802	20 %	60 %	20 %	0 %	298735618
99	NC_014256	AATGA	2	10	119547	119556	60 %	20 %	20 %	0 %	298735621
100	NC_014256	ATTTT	2	10	120966	120975	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014256	AAATG	2	10	124474	124483	60 %	20 %	20 %	0 %	298735626
102	NC_014256	GCTTG	2	10	125289	125298	0 %	40 %	40 %	20 %	298735628
103	NC_014256	AATTC	2	10	126346	126355	40 %	40 %	0 %	20 %	298735629
104	NC_014256	AAAAT	2	10	129043	129052	80 %	20 %	0 %	0 %	298735631
105	NC_014256	TCTTT	2	10	129670	129679	0 %	80 %	0 %	20 %	298735632
106	NC_014256	AGAAA	2	10	129950	129959	80 %	0 %	20 %	0 %	298735632
107	NC_014256	TTATA	2	10	132240	132249	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014256	TACAA	2	10	134824	134833	60 %	20 %	0 %	20 %	298735638
109	NC_014256	CAATT	2	10	136067	136076	40 %	40 %	0 %	20 %	298735639
110	NC_014256	TTTGT	2	10	136791	136800	0 %	80 %	20 %	0 %	298735640
111	NC_014256	GGCTT	2	10	137859	137868	0 %	40 %	40 %	20 %	298735641
112	NC_014256	CAAGG	2	10	139105	139114	40 %	0 %	40 %	20 %	298735643
113	NC_014256	TAAAA	2	10	141176	141185	80 %	20 %	0 %	0 %	298735646
114	NC_014256	TCATT	2	10	144361	144370	20 %	60 %	0 %	20 %	298735647
115	NC_014256	GTTTT	2	10	145073	145082	0 %	80 %	20 %	0 %	298735648
116	NC_014256	GATTT	2	10	146334	146343	20 %	60 %	20 %	0 %	298735649
117	NC_014256	ACGCA	2	10	146687	146696	40 %	0 %	20 %	40 %	298735650
118	NC_014256	TTGAA	2	10	147678	147687	40 %	40 %	20 %	0 %	298735650
119	NC_014256	GCATA	2	10	150385	150394	40 %	20 %	20 %	20 %	298735654
120	NC_014256	TTTTC	2	10	150509	150518	0 %	80 %	0 %	20 %	298735654
121	NC_014256	TTTTA	2	10	150909	150918	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014256	AATAT	2	10	151912	151921	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014256	TTAAA	2	10	155594	155603	60 %	40 %	0 %	0 %	298735664
124	NC_014256	GCAAG	2	10	155752	155761	40 %	0 %	40 %	20 %	298735665
125	NC_014256	GTTTG	2	10	156587	156596	0 %	60 %	40 %	0 %	298735668
126	NC_014256	AAACA	2	10	158441	158450	80 %	0 %	0 %	20 %	298735672
127	NC_014256	GAAAG	2	10	158650	158659	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014256	TTTGG	2	10	158797	158806	0 %	60 %	40 %	0 %	394895745
129	NC_014256	TGGGA	2	10	159199	159208	20 %	20 %	60 %	0 %	298735674
130	NC_014256	TCTAT	2	10	159342	159351	20 %	60 %	0 %	20 %	298735674
131	NC_014256	GCCAG	2	10	162907	162916	20 %	0 %	40 %	40 %	298735681
132	NC_014256	AAAGA	2	10	164418	164427	80 %	0 %	20 %	0 %	298735682
133	NC_014256	GTAAA	2	10	165712	165721	60 %	20 %	20 %	0 %	298735686
134	NC_014256	TGGAT	2	10	165760	165769	20 %	40 %	40 %	0 %	298735686
135	NC_014256	TTGAA	2	10	165999	166008	40 %	40 %	20 %	0 %	298735686
136	NC_014256	TAAAA	2	10	166297	166306	80 %	20 %	0 %	0 %	298735687
137	NC_014256	AAATC	2	10	167320	167329	60 %	20 %	0 %	20 %	298735688
138	NC_014256	ATTGA	2	10	168500	168509	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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259	NC_014256	TCGTG	2	10	324619	324628	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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261	NC_014256	TGTTT	2	10	325361	325370	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
262	NC_014256	CAATG	2	10	325499	325508	40 %	20 %	20 %	20 %	298735854
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403	NC_014256	AGACA	2	10	480398	480407	60 %	0 %	20 %	20 %	298736005
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406	NC_014256	TATGG	2	10	483275	483284	20 %	40 %	40 %	0 %	298736007
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420	NC_014256	CATGA	2	10	492879	492888	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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422	NC_014256	TTGAT	2	10	495754	495763	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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437	NC_014256	TTCAT	2	10	503954	503963	20 %	60 %	0 %	20 %	298736026
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