MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori B8 chromosome

Total Repeats: 193

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014256	TAAAA	2	10	1736	1745	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014256	CAAGC	2	10	3268	3277	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_014256	TAATT	2	10	5138	5147	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014256	TAAAC	2	10	20498	20507	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_014256	AAATA	2	10	24812	24821	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014256	TAAAA	2	10	40564	40573	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014256	ATAGA	2	10	43901	43910	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014256	TAATA	2	10	69398	69407	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014256	TTAGA	2	10	82671	82680	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014256	TCGTG	2	10	98535	98544	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_014256	GTTTG	2	10	99139	99148	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014256	TTTAG	2	10	100982	100991	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014256	GCATG	2	10	106023	106032	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_014256	TAGAA	2	10	111854	111863	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014256	ATCCA	3	15	112193	112207	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_014256	TTTAA	2	10	112316	112325	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014256	ATTTT	2	10	120966	120975	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014256	TTATA	2	10	132240	132249	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014256	TTTTA	2	10	150909	150918	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014256	AATAT	2	10	151912	151921	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014256	GAAAG	2	10	158650	158659	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014256	ATTGA	2	10	168500	168509	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014256	AAATT	2	10	209256	209265	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014256	TATTT	2	10	220599	220608	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014256	TTTTG	2	10	222946	222955	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014256	GCTTT	2	10	229335	229344	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_014256	CAAGT	2	10	249713	249722	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_014256	GTCTA	2	10	253937	253946	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_014256	GGATT	2	10	254487	254496	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014256	CAAGG	2	10	255874	255883	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_014256	AGGGT	2	10	256762	256771	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014256	GGCGC	2	10	259036	259045	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
33	NC_014256	TTGAT	2	10	259838	259847	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014256	CAAGC	2	10	262275	262284	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_014256	GATTG	2	10	272685	272694	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014256	AGAAC	2	10	273900	273909	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_014256	TGATT	2	10	281297	281306	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014256	AAACT	2	10	281346	281355	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_014256	AATTA	2	10	287042	287051	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014256	GCTTT	2	10	300345	300354	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
41	NC_014256	TTTTA	2	10	304239	304248	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014256	TTTAA	2	10	315028	315037	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014256	TGGAT	2	10	321550	321559	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014256	TTTAT	2	10	321969	321978	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014256	TCGTG	2	10	324619	324628	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_014256	ATTTT	2	10	325306	325315	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014256	TGTTT	2	10	325361	325370	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014256	TGAAT	2	10	344617	344626	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014256	GTTTT	2	10	344888	344897	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014256	GTTTT	2	10	358614	358623	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014256	TGATT	2	10	363447	363456	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014256	AAATC	2	10	365478	365487	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_014256	GAATA	2	10	377050	377059	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014256	TTAAA	2	10	377173	377182	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014256	GTGCG	2	10	382219	382228	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
56	NC_014256	TTTTA	2	10	391815	391824	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014256	CAATC	2	10	401275	401284	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
58	NC_014256	CAATT	2	10	406829	406838	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_014256	AAAAG	2	10	407492	407501	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014256	GCATC	2	10	433097	433106	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
61	NC_014256	AGTAA	2	10	448583	448592	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014256	AGTGA	2	10	448880	448889	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014256	AGATG	2	10	450357	450366	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014256	TTGAA	2	10	450589	450598	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014256	GATAA	2	10	451604	451613	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014256	AAAAT	2	10	452132	452141	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014256	CATAA	2	10	452149	452158	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_014256	TGCTA	2	10	488120	488129	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
69	NC_014256	TGAAA	2	10	490223	490232	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014256	ATAAG	2	10	492324	492333	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014256	TCAAA	2	10	492480	492489	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_014256	CATGA	2	10	492879	492888	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_014256	TTGAT	2	10	495754	495763	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014256	AAGTT	2	10	496751	496760	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014256	TAATT	2	10	505406	505415	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014256	ATTAA	2	10	505472	505481	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014256	AATTA	2	10	507395	507404	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014256	TAAAC	2	10	542238	542247	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_014256	ACTTG	2	10	590359	590368	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_014256	TTTTA	2	10	621884	621893	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014256	TACGA	2	10	625398	625407	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_014256	AAAAT	2	10	631686	631695	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014256	AAATC	2	10	631725	631734	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_014256	TTATA	2	10	643120	643129	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014256	TAACT	2	10	655784	655793	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_014256	GTTTG	2	10	670576	670585	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014256	AAAAC	2	10	681808	681817	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_014256	ATTTG	2	10	682457	682466	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014256	TTGTT	2	10	685716	685725	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014256	CTTTA	2	10	716033	716042	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_014256	TTTTA	2	10	716629	716638	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014256	GCTAT	2	10	723652	723661	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_014256	ATTTT	2	10	723685	723694	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014256	TTGTA	2	10	727904	727913	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014256	ACTCT	2	10	751824	751833	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_014256	CTTAT	2	10	759669	759678	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_014256	TAAGG	2	10	763494	763503	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014256	CGCTT	2	10	763606	763615	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_014256	ATTTT	2	10	763721	763730	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014256	ATTTG	2	10	769642	769651	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014256	TTTAA	2	10	795652	795661	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014256	CACAA	2	10	824700	824709	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
103	NC_014256	CTTAT	2	10	871263	871272	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_014256	AAAAC	2	10	877728	877737	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_014256	TCCAC	2	10	900995	901004	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
106	NC_014256	ATCAA	2	10	904288	904297	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_014256	ATTTA	2	10	911740	911749	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014256	ATTCT	2	10	912321	912330	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_014256	TATAG	2	10	915667	915676	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014256	TTTCA	2	10	927246	927255	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_014256	TCTTT	2	10	950494	950503	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_014256	TTTTA	2	10	978071	978080	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014256	TTCTT	2	10	992380	992389	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_014256	CCTAT	2	10	1026698	1026707	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
115	NC_014256	TTAAA	2	10	1026869	1026878	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014256	TTTTA	2	10	1035283	1035292	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014256	TTTTA	2	10	1041314	1041323	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014256	TTTAA	2	10	1060310	1060319	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014256	ATTTT	2	10	1065032	1065041	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014256	TGATT	2	10	1069225	1069234	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014256	ACTCA	2	10	1069831	1069840	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
122	NC_014256	TAAAA	2	10	1072902	1072911	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014256	GGATA	2	10	1074702	1074711	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014256	TATTT	2	10	1075976	1075985	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014256	ATCAA	2	10	1089557	1089566	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_014256	TTTTA	2	10	1089658	1089667	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014256	TTATT	2	10	1089752	1089761	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014256	GCTTT	2	10	1098751	1098760	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_014256	TCATT	2	10	1104425	1104434	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_014256	ATTTT	3	15	1111988	1112002	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014256	ATTAA	2	10	1122192	1122201	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014256	CTTTA	2	10	1123812	1123821	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_014256	TGGTT	2	10	1137533	1137542	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014256	CACGC	2	10	1144899	1144908	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
135	NC_014256	GTTTT	2	10	1161546	1161555	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014256	TTTTA	2	10	1176146	1176155	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014256	AAAAC	2	10	1259235	1259244	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_014256	AAATG	2	10	1276965	1276974	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014256	GATTG	2	10	1283530	1283539	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014256	AATTT	2	10	1292642	1292651	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014256	GTTAG	2	10	1303311	1303320	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014256	TGTTT	2	10	1334842	1334851	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014256	TAAAT	2	10	1334864	1334873	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014256	TACTT	2	10	1338561	1338570	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_014256	TTATT	2	10	1345930	1345939	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014256	TTAAA	2	10	1359106	1359115	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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148	NC_014256	TTTAT	2	10	1362177	1362186	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014256	TTATT	2	10	1362291	1362300	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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185	NC_014256	TCACT	2	10	1591851	1591860	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
186	NC_014256	TTTTA	2	10	1593553	1593562	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_014256	CCATG	2	10	1621284	1621293	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
192	NC_014256	TGATT	2	10	1647761	1647770	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
193	NC_014256	TTTTG	2	10	1669161	1669170	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.