MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Helicobacter pylori B8 chromosome

Total Repeats: 492

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014256	AGCA	2	8	38	45	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014256	TTCA	2	8	87	94	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014256	TTCA	2	8	98	105	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_014256	TTCA	2	8	120	127	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014256	TCCA	2	8	1621	1628	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_014256	CTAT	2	8	1676	1683	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_014256	TTTA	2	8	12116	12123	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014256	TAAA	2	8	16483	16490	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014256	TCAT	2	8	17857	17864	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014256	TTTG	2	8	33459	33466	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014256	TTGA	2	8	66627	66634	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014256	AACA	2	8	72042	72049	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014256	TCTT	2	8	82479	82486	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_014256	TGTT	2	8	82525	82532	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014256	TTAA	2	8	82545	82552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014256	ATTC	2	8	85222	85229	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014256	CAAA	2	8	85781	85788	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_014256	CTTT	2	8	88330	88337	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014256	TGAC	2	8	97179	97186	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_014256	TGAT	2	8	97287	97294	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014256	TTTC	2	8	97352	97359	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014256	AGTC	2	8	98050	98057	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014256	AGGT	2	8	98123	98130	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014256	GATG	2	8	98277	98284	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014256	AAGA	2	8	99835	99842	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014256	TGAG	2	8	100002	100009	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014256	TGTT	2	8	101685	101692	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014256	TTTA	2	8	102391	102398	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014256	TGAA	2	8	106705	106712	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014256	AATT	2	8	111833	111840	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014256	CATT	2	8	112243	112250	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_014256	TCAA	2	8	112367	112374	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_014256	ATCA	2	8	114394	114401	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014256	TCAA	2	8	121108	121115	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
35	NC_014256	TAAA	2	8	121213	121220	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014256	TGAA	2	8	121933	121940	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014256	TAGA	2	8	121961	121968	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014256	TTCT	2	8	122005	122012	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_014256	TTTA	2	8	125999	126006	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014256	TAAA	2	8	126035	126042	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014256	TGAA	2	8	129987	129994	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014256	TTCG	2	8	134142	134149	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014256	AATT	2	8	134306	134313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014256	GTAG	2	8	149518	149525	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014256	AATC	2	8	165429	165436	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_014256	ATCT	2	8	169223	169230	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_014256	TAGG	2	8	169900	169907	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014256	CATA	2	8	178687	178694	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014256	ACTA	2	8	201032	201039	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_014256	AATG	2	8	210883	210890	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014256	AAGC	2	8	213386	213393	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014256	TTAG	2	8	213437	213444	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014256	CCAA	2	8	213744	213751	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_014256	ACTG	2	8	217315	217322	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_014256	ACAA	2	8	217336	217343	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_014256	AATT	2	8	218811	218818	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014256	ATTG	2	8	222900	222907	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014256	GAAT	2	8	223124	223131	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014256	AAAT	2	8	228283	228290	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014256	AGAT	2	8	236402	236409	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014256	TATC	2	8	236513	236520	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_014256	CTTG	2	8	243711	243718	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_014256	TTCT	2	8	251670	251677	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_014256	AGGG	2	8	251695	251702	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014256	TTAA	2	8	251882	251889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014256	GAAA	2	8	253122	253129	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014256	TTTG	2	8	254943	254950	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014256	ATGG	2	8	255005	255012	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014256	TTCT	2	8	255204	255211	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_014256	TCAA	2	8	255542	255549	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_014256	TTTA	2	8	255726	255733	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014256	AAGA	2	8	255915	255922	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014256	CTCA	2	8	256036	256043	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
74	NC_014256	TGAG	2	8	256700	256707	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014256	ATTT	2	8	256948	256955	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014256	ACCA	2	8	257401	257408	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_014256	TCAA	2	8	257420	257427	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_014256	CCAC	2	8	257615	257622	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
79	NC_014256	GCTC	2	8	257709	257716	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
80	NC_014256	GCTC	2	8	258053	258060	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_014256	TCAA	2	8	258148	258155	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_014256	AAAG	2	8	258243	258250	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014256	ATGG	2	8	258808	258815	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014256	TCGC	2	8	259186	259193	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_014256	AGCC	2	8	259305	259312	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_014256	TGAA	2	8	259739	259746	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014256	TGAA	2	8	260057	260064	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014256	GCAA	2	8	260261	260268	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_014256	TCCA	2	8	260573	260580	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_014256	CTTT	2	8	260800	260807	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_014256	TGAA	2	8	260852	260859	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014256	GATC	2	8	261735	261742	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_014256	TGAT	2	8	261779	261786	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014256	GCGA	2	8	262420	262427	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_014256	TTGA	2	8	262642	262649	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014256	AGTG	2	8	262662	262669	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014256	GCAA	2	8	263204	263211	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_014256	GACG	2	8	263256	263263	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
99	NC_014256	GCAG	2	8	263351	263358	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_014256	AGGA	2	8	263685	263692	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014256	ATTT	2	8	267083	267090	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014256	TTTA	2	8	267098	267105	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014256	CACT	2	8	268349	268356	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_014256	AAAG	2	8	268782	268789	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014256	CTTT	2	8	268803	268810	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
106	NC_014256	TTGA	2	8	272508	272515	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014256	TAGC	2	8	272584	272591	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_014256	TTAT	2	8	273862	273869	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014256	AATA	2	8	274881	274888	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014256	AATA	2	8	277790	277797	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014256	TTGA	2	8	287069	287076	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014256	TAAA	2	8	287144	287151	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014256	TTTA	2	8	290939	290946	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014256	CAAA	2	8	293032	293039	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_014256	TTAA	2	8	302038	302045	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014256	TTAA	2	8	305169	305176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014256	GTTG	2	8	321723	321730	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014256	GAAA	2	8	321920	321927	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014256	TTAA	2	8	321928	321935	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014256	CGTT	2	8	322193	322200	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_014256	TGAC	2	8	323263	323270	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_014256	TGAT	2	8	323371	323378	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014256	TTTC	2	8	323436	323443	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_014256	AGTC	2	8	324134	324141	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_014256	AGGT	2	8	324207	324214	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014256	GATG	2	8	324361	324368	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014256	GTTG	2	8	330059	330066	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014256	ACAT	2	8	330156	330163	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
129	NC_014256	AAGG	2	8	330756	330763	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014256	GCGT	2	8	330817	330824	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_014256	GAAA	2	8	333321	333328	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014256	GTTT	2	8	344935	344942	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014256	TGAT	2	8	344979	344986	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014256	TTAA	2	8	348365	348372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014256	TTGC	2	8	351388	351395	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_014256	TTTG	2	8	351407	351414	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014256	AGCG	2	8	351468	351475	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_014256	TTAA	2	8	360058	360065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014256	TATT	2	8	363371	363378	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014256	ATTT	2	8	363415	363422	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014256	AATT	2	8	365550	365557	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014256	TTTA	2	8	374701	374708	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014256	AAAT	2	8	377041	377048	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014256	TCTA	2	8	384151	384158	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_014256	TCTT	2	8	388405	388412	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_014256	ACAA	2	8	388437	388444	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_014256	TTGA	2	8	388488	388495	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014256	TAAA	2	8	401232	401239	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014256	AAAT	2	8	418682	418689	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014256	TAAA	2	8	433031	433038	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014256	ATAA	2	8	433165	433172	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014256	AGGG	2	8	444300	444307	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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444	NC_014256	GGGA	2	8	1530570	1530577	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
445	NC_014256	AGCT	2	8	1530868	1530875	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
446	NC_014256	CTTT	2	8	1531226	1531233	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
447	NC_014256	GATT	2	8	1531350	1531357	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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450	NC_014256	TCGC	2	8	1532099	1532106	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
451	NC_014256	GCTT	2	8	1532737	1532744	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
452	NC_014256	GAAA	2	8	1532761	1532768	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
453	NC_014256	GAAA	2	8	1532780	1532787	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
454	NC_014256	AACC	2	8	1560225	1560232	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
455	NC_014256	CTTA	2	8	1566495	1566502	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
456	NC_014256	AATC	2	8	1566533	1566540	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
457	NC_014256	GCAT	2	8	1568856	1568863	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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459	NC_014256	TTAA	2	8	1571470	1571477	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
460	NC_014256	AACT	2	8	1575398	1575405	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
461	NC_014256	CTTT	2	8	1582122	1582129	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
462	NC_014256	AATA	2	8	1582172	1582179	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_014256	TGTT	2	8	1582289	1582296	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
464	NC_014256	CGCT	2	8	1584499	1584506	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
465	NC_014256	CAAA	2	8	1584596	1584603	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
466	NC_014256	CAAA	2	8	1586922	1586929	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
467	NC_014256	TTTA	2	8	1587102	1587109	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
468	NC_014256	AAAC	2	8	1589362	1589369	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
469	NC_014256	GAGC	2	8	1591884	1591891	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
470	NC_014256	GTTT	2	8	1592692	1592699	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
471	NC_014256	TGAG	2	8	1594035	1594042	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
472	NC_014256	AAAT	2	8	1594049	1594056	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
473	NC_014256	CAAG	2	8	1595977	1595984	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
474	NC_014256	AATG	2	8	1596011	1596018	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
475	NC_014256	ATGC	2	8	1596289	1596296	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
476	NC_014256	AATA	2	8	1596512	1596519	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
477	NC_014256	CTTT	2	8	1596707	1596714	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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481	NC_014256	TCAA	2	8	1623072	1623079	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
482	NC_014256	CTTT	2	8	1644936	1644943	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
483	NC_014256	AAAT	2	8	1645029	1645036	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
484	NC_014256	GATG	2	8	1647913	1647920	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
485	NC_014256	TGAT	2	8	1650373	1650380	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
486	NC_014256	TATT	2	8	1658604	1658611	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
487	NC_014256	TGCA	2	8	1659762	1659769	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
488	NC_014256	ATTT	2	8	1669069	1669076	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
489	NC_014256	TTAA	2	8	1669218	1669225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
490	NC_014256	TGAA	2	8	1670377	1670384	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
491	NC_014256	TGAA	2	8	1673742	1673749	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
492	NC_014256	TTCC	2	8	1673976	1673983	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.