MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Methanohalobium evestigatum Z-7303 plasmid pMETEV01

Total Repeats: 105

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014254	TTTAC	2	10	4916	4925	20 %	60 %	0 %	20 %	298676130
2	NC_014254	TTTAC	2	10	6290	6299	20 %	60 %	0 %	20 %	298676130
3	NC_014254	ACAGT	2	10	9053	9062	40 %	20 %	20 %	20 %	298676131
4	NC_014254	ATGTC	2	10	10386	10395	20 %	40 %	20 %	20 %	298676132
5	NC_014254	TATCA	2	10	11495	11504	40 %	40 %	0 %	20 %	298676132
6	NC_014254	GAAAA	2	10	11778	11787	80 %	0 %	20 %	0 %	298676132
7	NC_014254	AATTT	2	10	12070	12079	40 %	60 %	0 %	0 %	298676132
8	NC_014254	TTACA	2	10	14146	14155	40 %	40 %	0 %	20 %	298676133
9	NC_014254	TAAGT	2	10	25569	25578	40 %	40 %	20 %	0 %	298676138
10	NC_014254	ATGCC	2	10	28648	28657	20 %	20 %	20 %	40 %	298676140
11	NC_014254	TTATC	2	10	29315	29324	20 %	60 %	0 %	20 %	298676141
12	NC_014254	ACATC	2	10	29738	29747	40 %	20 %	0 %	40 %	298676141
13	NC_014254	GATTA	2	10	31051	31060	40 %	40 %	20 %	0 %	298676142
14	NC_014254	ACCTA	2	10	32698	32707	40 %	20 %	0 %	40 %	298676143
15	NC_014254	ATTAT	2	10	36313	36322	40 %	60 %	0 %	0 %	298676146
16	NC_014254	CTATT	2	10	37302	37311	20 %	60 %	0 %	20 %	298676147
17	NC_014254	TTAAT	2	10	37516	37525	40 %	60 %	0 %	0 %	298676147
18	NC_014254	TAATA	2	10	38274	38283	60 %	40 %	0 %	0 %	298676148
19	NC_014254	AATTT	2	10	38954	38963	40 %	60 %	0 %	0 %	298676148
20	NC_014254	ATATA	2	10	40115	40124	60 %	40 %	0 %	0 %	298676149
21	NC_014254	TTTAC	2	10	42356	42365	20 %	60 %	0 %	20 %	298676150
22	NC_014254	TAATT	2	10	42613	42622	40 %	60 %	0 %	0 %	298676150
23	NC_014254	TTTAT	2	10	42932	42941	20 %	80 %	0 %	0 %	298676150
24	NC_014254	AATAA	2	10	43257	43266	80 %	20 %	0 %	0 %	298676151
25	NC_014254	TACTT	2	10	43898	43907	20 %	60 %	0 %	20 %	298676151
26	NC_014254	ATTTT	2	10	44646	44655	20 %	80 %	0 %	0 %	298676151
27	NC_014254	ATTTT	2	10	46452	46461	20 %	80 %	0 %	0 %	298676153
28	NC_014254	AATAT	2	10	47811	47820	60 %	40 %	0 %	0 %	298676154
29	NC_014254	TATAA	2	10	47954	47963	60 %	40 %	0 %	0 %	298676154
30	NC_014254	ATCCT	2	10	48913	48922	20 %	40 %	0 %	40 %	298676154
31	NC_014254	ATTTA	2	10	55871	55880	40 %	60 %	0 %	0 %	298676158
32	NC_014254	ATTGT	2	10	57695	57704	20 %	60 %	20 %	0 %	298676159
33	NC_014254	TTATC	2	10	58648	58657	20 %	60 %	0 %	20 %	298676160
34	NC_014254	ATTTG	2	10	63565	63574	20 %	60 %	20 %	0 %	298676163
35	NC_014254	TCTAT	2	10	65330	65339	20 %	60 %	0 %	20 %	298676163
36	NC_014254	TATAT	2	10	66751	66760	40 %	60 %	0 %	0 %	298676163
37	NC_014254	TTACA	2	10	66846	66855	40 %	40 %	0 %	20 %	298676163
38	NC_014254	TGATA	2	10	67939	67948	40 %	40 %	20 %	0 %	298676163
39	NC_014254	ATTTT	2	10	68969	68978	20 %	80 %	0 %	0 %	298676163
40	NC_014254	GTTAT	2	10	69116	69125	20 %	60 %	20 %	0 %	298676163
41	NC_014254	TACTT	2	10	70268	70277	20 %	60 %	0 %	20 %	298676164
42	NC_014254	TTCTC	2	10	71188	71197	0 %	60 %	0 %	40 %	298676164
43	NC_014254	CTTAA	2	10	73331	73340	40 %	40 %	0 %	20 %	298676166
44	NC_014254	AATAG	2	10	74422	74431	60 %	20 %	20 %	0 %	298676166
45	NC_014254	TTTTC	2	10	74903	74912	0 %	80 %	0 %	20 %	298676167
46	NC_014254	TAAAT	2	10	76555	76564	60 %	40 %	0 %	0 %	298676167
47	NC_014254	TTTAA	2	10	78418	78427	40 %	60 %	0 %	0 %	298676168
48	NC_014254	GAAAA	2	10	78834	78843	80 %	0 %	20 %	0 %	298676168
49	NC_014254	CAGTT	2	10	80754	80763	20 %	40 %	20 %	20 %	298676171
50	NC_014254	GATGC	2	10	81620	81629	20 %	20 %	40 %	20 %	298676172
51	NC_014254	GGAAA	2	10	82597	82606	60 %	0 %	40 %	0 %	298676172
52	NC_014254	GATAA	2	10	83402	83411	60 %	20 %	20 %	0 %	298676172
53	NC_014254	TAAAC	2	10	92856	92865	60 %	20 %	0 %	20 %	298676181
54	NC_014254	TTTGA	2	10	93457	93466	20 %	60 %	20 %	0 %	298676181
55	NC_014254	CAAAC	2	10	93569	93578	60 %	0 %	0 %	40 %	298676181
56	NC_014254	ATCCA	2	10	94311	94320	40 %	20 %	0 %	40 %	298676182
57	NC_014254	CTCAT	2	10	94441	94450	20 %	40 %	0 %	40 %	298676182
58	NC_014254	TGAAA	2	10	94527	94536	60 %	20 %	20 %	0 %	298676182
59	NC_014254	CTATA	2	10	96941	96950	40 %	40 %	0 %	20 %	298676185
60	NC_014254	AAACA	2	10	98661	98670	80 %	0 %	0 %	20 %	298676186
61	NC_014254	TTGTA	2	10	99705	99714	20 %	60 %	20 %	0 %	298676187
62	NC_014254	TGATT	2	10	101086	101095	20 %	60 %	20 %	0 %	298676188
63	NC_014254	TAAAA	2	10	101380	101389	80 %	20 %	0 %	0 %	298676188
64	NC_014254	AACAA	2	10	102493	102502	80 %	0 %	0 %	20 %	298676190
65	NC_014254	TAAAC	2	10	105117	105126	60 %	20 %	0 %	20 %	298676194
66	NC_014254	CATAA	2	10	106513	106522	60 %	20 %	0 %	20 %	298676194
67	NC_014254	AAAAC	2	10	106600	106609	80 %	0 %	0 %	20 %	298676194
68	NC_014254	AAACA	2	10	107852	107861	80 %	0 %	0 %	20 %	298676194
69	NC_014254	TTGAA	2	10	107900	107909	40 %	40 %	20 %	0 %	298676194
70	NC_014254	AAACA	2	10	112003	112012	80 %	0 %	0 %	20 %	298676197
71	NC_014254	AAAAC	2	10	119784	119793	80 %	0 %	0 %	20 %	298676207
72	NC_014254	AAAGA	2	10	119848	119857	80 %	0 %	20 %	0 %	298676207
73	NC_014254	TGTTC	2	10	120689	120698	0 %	60 %	20 %	20 %	298676208
74	NC_014254	TCCTT	2	10	124760	124769	0 %	60 %	0 %	40 %	298676209
75	NC_014254	TAGAT	2	10	125945	125954	40 %	40 %	20 %	0 %	298676209
76	NC_014254	TTATT	2	10	126018	126027	20 %	80 %	0 %	0 %	298676209
77	NC_014254	CGAAT	2	10	130654	130663	40 %	20 %	20 %	20 %	298676212
78	NC_014254	TATGA	2	10	133023	133032	40 %	40 %	20 %	0 %	298676216
79	NC_014254	TTTTC	2	10	134927	134936	0 %	80 %	0 %	20 %	298676219
80	NC_014254	CTTTC	2	10	135164	135173	0 %	60 %	0 %	40 %	298676219
81	NC_014254	TCCAC	2	10	136805	136814	20 %	20 %	0 %	60 %	298676220
82	NC_014254	CAACA	2	10	136879	136888	60 %	0 %	0 %	40 %	298676220
83	NC_014254	TAACA	2	10	137296	137305	60 %	20 %	0 %	20 %	298676220
84	NC_014254	TTTCA	2	10	138784	138793	20 %	60 %	0 %	20 %	298676220
85	NC_014254	GAAAC	2	10	139381	139390	60 %	0 %	20 %	20 %	298676221
86	NC_014254	AAACC	2	10	139580	139589	60 %	0 %	0 %	40 %	298676221
87	NC_014254	AATAC	2	10	141972	141981	60 %	20 %	0 %	20 %	298676223
88	NC_014254	GTAAC	2	10	142554	142563	40 %	20 %	20 %	20 %	298676223
89	NC_014254	TTGGA	2	10	145713	145722	20 %	40 %	40 %	0 %	298676223
90	NC_014254	ACATT	2	10	148260	148269	40 %	40 %	0 %	20 %	298676223
91	NC_014254	GCAAA	2	10	149650	149659	60 %	0 %	20 %	20 %	298676224
92	NC_014254	AAAAT	2	10	150181	150190	80 %	20 %	0 %	0 %	298676224
93	NC_014254	ACAAA	2	10	150228	150237	80 %	0 %	0 %	20 %	298676224
94	NC_014254	AATTT	2	10	150660	150669	40 %	60 %	0 %	0 %	298676224
95	NC_014254	TATTG	2	10	151223	151232	20 %	60 %	20 %	0 %	298676224
96	NC_014254	TTAAA	2	10	152999	153008	60 %	40 %	0 %	0 %	298676227
97	NC_014254	AACTT	2	10	153459	153468	40 %	40 %	0 %	20 %	298676228
98	NC_014254	TTTGG	2	10	154185	154194	0 %	60 %	40 %	0 %	298676228
99	NC_014254	ATATA	2	10	155207	155216	60 %	40 %	0 %	0 %	298676229
100	NC_014254	ACCAA	2	10	155289	155298	60 %	0 %	0 %	40 %	298676229
101	NC_014254	CAAAC	2	10	156831	156840	60 %	0 %	0 %	40 %	298676229
102	NC_014254	ATGAC	2	10	156913	156922	40 %	20 %	20 %	20 %	298676229
103	NC_014254	GAAAC	2	10	158154	158163	60 %	0 %	20 %	20 %	298676230
104	NC_014254	AAACC	2	10	158353	158362	60 %	0 %	0 %	40 %	298676230
105	NC_014254	AGAGA	2	10	159866	159875	60 %	0 %	40 %	0 %	298676231

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.