MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanohalobium evestigatum Z-7303 chromosome

Total Repeats: 158

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014253	CTTTTT	2	12	10922	10933	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_014253	TAAAAT	2	12	17325	17336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014253	AATCTT	2	12	26001	26012	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_014253	TAAAAA	2	12	26150	26161	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014253	ACGGGT	2	12	48929	48940	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_014253	TGTCTG	2	12	50424	50435	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_014253	TGATTT	2	12	54157	54168	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014253	AATTTT	2	12	65231	65242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014253	GTAGTG	2	12	111817	111828	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014253	AAAAGG	2	12	112111	112122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014253	AAAATA	2	12	123159	123170	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014253	TTTATT	2	12	130058	130069	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014253	TGAAAA	2	12	151421	151432	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014253	ACAGAA	2	12	170473	170484	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_014253	TAAATC	2	12	228767	228778	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_014253	TTTAAA	2	12	240684	240695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014253	GAAGTC	2	12	245926	245937	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_014253	CAAAAA	2	12	282608	282619	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_014253	TTCTTT	2	12	301581	301592	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_014253	TAAACA	2	12	307135	307146	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_014253	TGGAAG	2	12	316267	316278	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014253	ATTATC	2	12	321881	321892	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_014253	TTATTT	2	12	330384	330395	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014253	AGATGG	2	12	344212	344223	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014253	TCATTA	2	12	349524	349535	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_014253	TAAAAA	2	12	371295	371306	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014253	CAAAAG	2	12	379454	379465	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_014253	ATCCAC	2	12	387800	387811	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_014253	TTAAAT	2	12	405074	405085	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014253	CATTAC	2	12	440117	440128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014253	TAAAGA	2	12	447847	447858	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014253	CATGAG	2	12	452746	452757	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_014253	TATGTT	2	12	463824	463835	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014253	AAGTTT	2	12	508146	508157	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014253	CCAACT	2	12	509815	509826	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_014253	ATTGAG	2	12	521207	521218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014253	TTAAAT	2	12	545339	545350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014253	AATTAA	2	12	545428	545439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014253	CAAAAT	2	12	569444	569455	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_014253	TTATTG	2	12	595936	595947	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014253	TTATAA	2	12	613827	613838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014253	TTCAAA	2	12	615045	615056	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_014253	ACAAAA	2	12	626668	626679	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_014253	TCTATG	2	12	650720	650731	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_014253	TCTATG	2	12	651050	651061	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_014253	TCTATG	2	12	651380	651391	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_014253	TCTATG	2	12	651712	651723	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_014253	TCTATG	2	12	652042	652053	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_014253	TCTATG	2	12	652372	652383	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_014253	AATATA	2	12	670064	670075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014253	TAAATT	2	12	727101	727112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014253	ATATCC	2	12	727936	727947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014253	AGTATT	2	12	733867	733878	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014253	GAAAGA	2	12	775244	775255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014253	AAGTTT	2	12	777671	777682	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014253	TATTTA	2	12	793280	793291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014253	TGTTTT	2	12	795857	795868	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014253	TAAAAA	2	12	830229	830240	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014253	ACTGCT	2	12	838826	838837	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014253	TAATTC	2	12	839661	839672	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_014253	GACACA	2	12	853823	853834	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014253	TTAAAA	2	12	854810	854821	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014253	GTTTTC	2	12	854830	854841	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_014253	AAATAA	2	12	857112	857123	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014253	ATTTAT	2	12	918383	918394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014253	AACCTT	2	12	920613	920624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014253	TGTATA	2	12	923319	923330	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014253	TTTTTA	2	12	928512	928523	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014253	AAAATT	2	12	933036	933047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014253	AATTTG	2	12	943770	943781	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014253	AAATCA	2	12	943797	943808	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_014253	TAAAAA	2	12	966702	966713	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014253	TATTGT	2	12	1044421	1044432	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014253	TTTTTC	2	12	1045984	1045995	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_014253	ATTAAT	2	12	1047730	1047741	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014253	TTTTAT	2	12	1074346	1074357	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014253	AAGTTT	2	12	1085211	1085222	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014253	TATTTA	2	12	1125548	1125559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014253	TATTTT	2	12	1128297	1128308	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014253	ATTTAT	2	12	1129447	1129458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014253	TAAAAT	2	12	1129568	1129579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014253	ACCGAG	2	12	1129729	1129740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014253	TTCAAT	2	12	1131041	1131052	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_014253	ATTTTG	2	12	1140693	1140704	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014253	TTTTAT	2	12	1153760	1153771	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014253	TAAAAA	2	12	1153937	1153948	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014253	CGGTAA	2	12	1154377	1154388	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_014253	TTTATA	2	12	1164191	1164202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014253	ACTTTA	3	18	1164273	1164290	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_014253	TCAAAA	2	12	1171477	1171488	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_014253	TTCAAT	2	12	1173794	1173805	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_014253	TTCAAT	2	12	1198217	1198228	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_014253	ATTTGA	2	12	1206390	1206401	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014253	TTTTAT	2	12	1206992	1207003	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014253	AAAACA	2	12	1213498	1213509	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_014253	ATTTTT	2	12	1215293	1215304	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014253	TTTCAA	2	12	1215401	1215412	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_014253	ATGGTG	2	12	1220001	1220012	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014253	TCCAGA	2	12	1243413	1243424	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014253	ATTATA	2	12	1259361	1259372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014253	TTAATT	2	12	1271066	1271077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014253	TAAAAA	2	12	1272500	1272511	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014253	TTTGTT	2	12	1309810	1309821	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014253	ATAGTT	2	12	1315034	1315045	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014253	TTCATT	2	12	1335316	1335327	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_014253	GGATAT	2	12	1337305	1337316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014253	TTGAAT	2	12	1388767	1388778	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014253	AAGTTT	2	12	1420913	1420924	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014253	AAACCA	2	12	1456824	1456835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_014253	TTAAAC	2	12	1458378	1458389	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_014253	ATACCG	2	12	1486816	1486827	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_014253	TAACAA	2	12	1491910	1491921	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_014253	ACTATG	2	12	1498434	1498445	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_014253	TTAATA	2	12	1514118	1514129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014253	CAAAAA	2	12	1522452	1522463	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_014253	TTATAA	2	12	1524951	1524962	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014253	CAATTT	2	12	1559830	1559841	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_014253	AATTAA	2	12	1574490	1574501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014253	ATTTTT	2	12	1587527	1587538	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014253	TCTTTT	2	12	1602625	1602636	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_014253	TTTCTT	2	12	1609226	1609237	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_014253	TTTCTG	2	12	1609511	1609522	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_014253	AAACGG	2	12	1622816	1622827	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_014253	CATTCC	2	12	1623698	1623709	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_014253	CAACTG	2	12	1639145	1639156	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_014253	CATGTT	2	12	1646231	1646242	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_014253	AAAAGA	2	12	1658351	1658362	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014253	AAAATG	2	12	1695353	1695364	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014253	ATTGCT	2	12	1701705	1701716	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_014253	AACAAA	2	12	1702398	1702409	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_014253	TATTTA	2	12	1719664	1719675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014253	ATATCA	2	12	1721781	1721792	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_014253	TTAAAT	2	12	1721855	1721866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_014253	ACAAAA	2	12	2238534	2238545	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
158	NC_014253	TGACCC	2	12	2242199	2242210	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.