MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanohalobium evestigatum Z-7303 chromosome

Total Repeats: 401

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014253	ATTAA	2	10	14	23	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014253	TATAT	2	10	118	127	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014253	AATTT	2	10	27889	27898	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014253	TTTGG	2	10	36900	36909	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014253	GGCTC	2	10	50534	50543	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_014253	TCGTA	2	10	51132	51141	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_014253	TTAAG	2	10	53954	53963	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014253	TTATG	2	10	56839	56848	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014253	TATAT	2	10	95714	95723	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014253	GTTTT	2	10	108069	108078	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014253	ATTTA	2	10	121489	121498	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014253	TTTTG	2	10	129374	129383	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014253	GTTTC	2	10	130071	130080	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_014253	TTTTA	2	10	141999	142008	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014253	CTAAA	2	10	160874	160883	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_014253	AATAT	2	10	161364	161373	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014253	AGGTT	2	10	163432	163441	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014253	GAGAA	2	10	166682	166691	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014253	AAATC	2	10	171794	171803	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_014253	AATTA	2	10	172479	172488	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014253	AAAAC	2	10	180020	180029	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_014253	GATTT	2	10	180242	180251	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014253	CTACC	2	10	192878	192887	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
24	NC_014253	TTTAT	2	10	193868	193877	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014253	ATATA	2	10	196928	196937	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014253	ATTTT	2	10	201174	201183	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014253	ATAAA	2	10	205880	205889	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014253	ATATT	2	10	207998	208007	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014253	AATGA	2	10	231443	231452	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014253	AAATA	2	10	242063	242072	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014253	AATCA	2	10	242110	242119	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_014253	ATTTT	2	10	242597	242606	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014253	GGTTT	2	10	244698	244707	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014253	TCTAC	2	10	247931	247940	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
35	NC_014253	CAATT	2	10	248193	248202	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_014253	TTTAC	2	10	251879	251888	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_014253	TAAAT	2	10	277374	277383	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014253	CTAAA	2	10	278583	278592	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_014253	ATTAT	2	10	282663	282672	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014253	TTCAA	2	10	284682	284691	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
41	NC_014253	TTATT	2	10	295860	295869	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014253	GTTTG	2	10	300081	300090	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014253	GTAGG	2	10	304875	304884	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014253	ATTTA	2	10	316207	316216	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014253	AACTA	2	10	316245	316254	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_014253	TGTTT	2	10	323412	323421	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014253	AAACA	2	10	323484	323493	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_014253	CTATT	2	10	339365	339374	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_014253	ATATA	2	10	339919	339928	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014253	TTAAA	2	10	344435	344444	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014253	AAATT	2	10	344542	344551	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014253	TACTG	2	10	349619	349628	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_014253	CAGTT	2	10	359170	359179	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_014253	CCAAA	2	10	360183	360192	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
55	NC_014253	TTTCA	2	10	360415	360424	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_014253	GATGC	2	10	360457	360466	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_014253	TTTAC	2	10	367191	367200	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_014253	AAATG	2	10	367652	367661	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014253	AATTC	2	10	373763	373772	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_014253	GATGT	2	10	373879	373888	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014253	AAAAC	2	10	378607	378616	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_014253	AATTT	2	10	383640	383649	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014253	TTAAT	2	10	388272	388281	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014253	AAATC	2	10	389053	389062	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_014253	AAATA	2	10	389087	389096	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014253	ATTTG	2	10	389748	389757	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014253	TTTAT	2	10	389759	389768	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014253	ATATT	2	10	389790	389799	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014253	AAATA	2	10	394450	394459	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014253	AAAAT	2	10	395915	395924	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014253	ATATA	2	10	397535	397544	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014253	AAATC	2	10	397659	397668	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_014253	TTTCC	2	10	433837	433846	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_014253	ATCTT	2	10	437126	437135	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_014253	CTAAA	2	10	438118	438127	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_014253	ATTAT	2	10	438988	438997	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014253	TAATG	2	10	439067	439076	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014253	AGAAT	2	10	439140	439149	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014253	TATTT	2	10	443743	443752	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014253	AATTT	2	10	443995	444004	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014253	AAATT	2	10	444883	444892	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014253	CAATT	2	10	481982	481991	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_014253	AAAAC	2	10	483265	483274	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_014253	AAAAT	2	10	483368	483377	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014253	ATCCT	2	10	508404	508413	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_014253	AAAAT	2	10	515353	515362	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014253	TTTTC	2	10	535088	535097	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_014253	TTTCC	2	10	540265	540274	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
89	NC_014253	ATTTA	2	10	543667	543676	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014253	ATAAA	2	10	548844	548853	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014253	ATTTG	2	10	559173	559182	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014253	AAACA	2	10	567881	567890	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_014253	TAAAT	2	10	568232	568241	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014253	AGAAA	2	10	569562	569571	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014253	CAAAC	2	10	570491	570500	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_014253	CATTA	2	10	571323	571332	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
97	NC_014253	GAAAA	2	10	579732	579741	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014253	TTGAT	2	10	588442	588451	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014253	TTTAA	2	10	589593	589602	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014253	ACAAA	2	10	595762	595771	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_014253	TAATA	2	10	611791	611800	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014253	TATTT	2	10	633856	633865	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014253	TCCCC	2	10	635184	635193	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
104	NC_014253	TTAAA	2	10	638998	639007	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014253	TAAAA	2	10	640707	640716	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014253	GTATT	2	10	643921	643930	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014253	AGCAC	2	10	649616	649625	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
108	NC_014253	CATAC	2	10	653160	653169	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
109	NC_014253	TAATT	2	10	653520	653529	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014253	TAAAT	2	10	665407	665416	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014253	ATTAA	2	10	669812	669821	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014253	TAATA	2	10	669822	669831	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014253	ACGTT	2	10	674745	674754	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_014253	GATGC	2	10	674824	674833	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_014253	CCTGA	2	10	679702	679711	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_014253	ATTAC	2	10	716666	716675	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_014253	TTTAA	2	10	718058	718067	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014253	GACCA	2	10	722019	722028	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
119	NC_014253	CACTA	2	10	726958	726967	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_014253	GGAAA	2	10	729876	729885	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014253	CAGTA	2	10	747517	747526	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_014253	TGTAG	2	10	752826	752835	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014253	TAAAT	2	10	753440	753449	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014253	AAAAC	2	10	756170	756179	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_014253	AAATA	2	10	761687	761696	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014253	ACTAT	2	10	772164	772173	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_014253	ATATA	2	10	774445	774454	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014253	GACCA	2	10	774584	774593	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
129	NC_014253	AACTG	2	10	775638	775647	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_014253	TGCTA	2	10	785376	785385	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_014253	TAGAA	2	10	811975	811984	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014253	AATTT	2	10	831567	831576	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014253	GTATA	2	10	840533	840542	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014253	TTGTA	2	10	850733	850742	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014253	ATTTT	2	10	859243	859252	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014253	AAAGA	2	10	875574	875583	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014253	TAAAT	2	10	875616	875625	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014253	ATTTA	2	10	875781	875790	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014253	TATAT	2	10	884325	884334	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014253	GAGAA	2	10	884527	884536	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014253	ACCCA	2	10	885064	885073	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
142	NC_014253	ACTAA	2	10	885203	885212	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_014253	ATTAT	2	10	893814	893823	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014253	ATAAA	2	10	912149	912158	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014253	TACCA	2	10	912460	912469	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
146	NC_014253	AAACT	2	10	912531	912540	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_014253	AAAAT	2	10	915719	915728	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014253	ATAAA	2	10	918406	918415	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014253	TAAAG	2	10	919008	919017	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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154	NC_014253	TATTT	2	10	933174	933183	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014253	AACAA	2	10	943758	943767	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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157	NC_014253	ATTTT	2	10	963514	963523	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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177	NC_014253	TAAAA	2	10	1040959	1040968	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_014253	TAAAA	2	10	1085110	1085119	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
192	NC_014253	TCAAT	2	10	1116637	1116646	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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196	NC_014253	ATTAT	2	10	1125778	1125787	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_014253	ACTTT	2	10	1129797	1129806	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
198	NC_014253	AGTTC	2	10	1129903	1129912	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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266	NC_014253	TGTGT	2	10	1365913	1365922	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
267	NC_014253	CAATA	2	10	1373332	1373341	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
268	NC_014253	TTTAT	2	10	1384039	1384048	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_014253	ATTTT	2	10	1396035	1396044	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_014253	AGTAT	2	10	1397886	1397895	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
271	NC_014253	TATCA	4	20	1425923	1425942	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
272	NC_014253	TTTCA	2	10	1426317	1426326	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
273	NC_014253	GATGC	2	10	1426359	1426368	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
274	NC_014253	AATAA	2	10	1431060	1431069	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
275	NC_014253	ATTAT	2	10	1433400	1433409	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_014253	GTATA	2	10	1433481	1433490	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
277	NC_014253	AACCA	2	10	1454208	1454217	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
278	NC_014253	TTTTA	2	10	1456576	1456585	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
279	NC_014253	TATGA	2	10	1468454	1468463	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
280	NC_014253	TTTTG	2	10	1471287	1471296	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
281	NC_014253	TGGTC	2	10	1478695	1478704	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
282	NC_014253	AAGTT	2	10	1482659	1482668	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
283	NC_014253	CAGTC	2	10	1487726	1487735	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
284	NC_014253	AAATT	2	10	1491765	1491774	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_014253	AGATT	2	10	1494284	1494293	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
286	NC_014253	ATGAT	2	10	1498477	1498486	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.