MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 99

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014251	ATGATT	2	12	11500	11511	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014251	CCCGAA	2	12	56569	56580	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3	NC_014251	TATTAG	2	12	57443	57454	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014251	CACTTC	2	12	57474	57485	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014251	TCCTTA	2	12	60562	60573	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014251	GTTTTT	2	12	134092	134103	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014251	TAAATT	2	12	139889	139900	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014251	TCCAAC	2	12	145308	145319	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_014251	AAAATC	2	12	192090	192101	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014251	TGGTTT	2	12	192391	192402	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014251	TGGTTT	2	12	192424	192435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014251	TGGTTT	2	12	192457	192468	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014251	TGGTTT	2	12	192490	192501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014251	TGGTTT	2	12	192556	192567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014251	TGGTTT	2	12	192589	192600	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014251	TGGTTT	2	12	192622	192633	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014251	TAAGGA	2	12	281190	281201	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014251	GAAGTG	2	12	284278	284289	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014251	ACTAAT	2	12	284308	284319	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_014251	TAAAAA	2	12	303519	303530	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014251	TTCTAT	2	12	327102	327113	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_014251	TCCCAT	2	12	332951	332962	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_014251	TAAAAT	2	12	335328	335339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014251	TTATGT	2	12	359150	359161	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014251	AAGCAG	2	12	359941	359952	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_014251	ATAAAA	2	12	398308	398319	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014251	CACTAA	2	12	445019	445030	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014251	ATTTTG	2	12	451850	451861	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014251	TTTTAC	2	12	461394	461405	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_014251	TCTTAA	2	12	506494	506505	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_014251	GGTTGC	2	12	523464	523475	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_014251	TCTTTT	2	12	542908	542919	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_014251	GAAAAA	2	12	574131	574142	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014251	GCAGTT	2	12	614745	614756	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014251	AGAAAT	2	12	662768	662779	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014251	ATGAAG	2	12	673597	673608	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014251	GCTTGC	2	12	717636	717647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014251	AGTGGA	2	12	762267	762278	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014251	AAAAAT	2	12	765301	765312	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014251	TGCTTT	2	12	769414	769425	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_014251	AAAATG	2	12	788682	788693	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014251	TCTTTT	2	12	799753	799764	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_014251	AAAGTT	2	12	849699	849710	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014251	ACTTCT	2	12	866439	866450	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014251	AAAGGA	2	12	1021863	1021874	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014251	ACCATC	2	12	1038575	1038586	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_014251	TACCTA	2	12	1078291	1078302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014251	ATTTTT	2	12	1103284	1103295	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014251	TGATTG	2	12	1134338	1134349	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014251	AAATAA	2	12	1134470	1134481	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014251	AACAAA	2	12	1198740	1198751	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_014251	AAACAA	2	12	1207920	1207931	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_014251	AGTTCT	2	12	1216838	1216849	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_014251	AAAATT	2	12	1217769	1217780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014251	CTATTT	2	12	1231152	1231163	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_014251	TCAAAT	2	12	1316639	1316650	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_014251	ATCTGG	2	12	1318920	1318931	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014251	TACTTT	2	12	1324489	1324500	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_014251	ATATTT	2	12	1327120	1327131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014251	ATTTTA	2	12	1333080	1333091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014251	TTTTTA	2	12	1337614	1337625	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014251	AAGAAA	2	12	1373998	1374009	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014251	CTTTTT	2	12	1385749	1385760	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_014251	GAAATA	2	12	1385797	1385808	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014251	TAAAAA	2	12	1397284	1397295	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014251	CTTGGT	2	12	1416566	1416577	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_014251	CTTTTT	2	12	1417429	1417440	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_014251	TTTATA	2	12	1466861	1466872	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014251	TTTTAA	2	12	1470343	1470354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014251	ATAAAA	2	12	1491527	1491538	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014251	CCCGAA	2	12	1504512	1504523	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
72	NC_014251	GTTTTT	2	12	1527703	1527714	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014251	TCTTTT	2	12	1545749	1545760	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_014251	TGAAAA	2	12	1555626	1555637	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014251	ATCCTT	2	12	1577248	1577259	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014251	ACTAAA	2	12	1586065	1586076	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_014251	AAATTT	2	12	1600826	1600837	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014251	CTTTCT	2	12	1704819	1704830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014251	AAAAAC	2	12	1711570	1711581	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_014251	GAATCG	2	12	1757005	1757016	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_014251	TTAAAA	2	12	1767884	1767895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014251	ATTTGA	2	12	1825974	1825985	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014251	TAATCA	2	12	1833944	1833955	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_014251	CACTTC	2	12	1851734	1851745	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_014251	AAAAAT	2	12	1863003	1863014	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014251	GAACAT	2	12	1875291	1875302	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_014251	TAGGCT	2	12	1898123	1898134	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_014251	TCATTA	2	12	1908578	1908589	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_014251	TAATCA	2	12	1927419	1927430	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_014251	TATTAG	2	12	1955237	1955248	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014251	CACTTC	2	12	1955268	1955279	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_014251	TCCTTA	2	12	1958356	1958367	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014251	AATTGA	2	12	1981600	1981611	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014251	AAAAAC	2	12	1991035	1991046	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_014251	CCAGAA	2	12	1996148	1996159	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014251	AAAAAT	2	12	2070320	2070331	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014251	TATTAG	2	12	2084157	2084168	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014251	CACTTC	2	12	2084188	2084199	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_014251	TCCTTA	2	12	2087276	2087287	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.