MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 1581

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014251	AGCCA	2	10	2391	2400	40 %	0 %	20 %	40 %	298501508
2	NC_014251	ATGGT	2	10	2948	2957	20 %	40 %	40 %	0 %	298501508
3	NC_014251	TTTAT	2	10	4261	4270	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014251	TAGCG	2	10	6482	6491	20 %	20 %	40 %	20 %	298501511
5	NC_014251	CTTGG	2	10	9220	9229	0 %	40 %	40 %	20 %	298501514
6	NC_014251	ATGGG	2	10	10080	10089	20 %	20 %	60 %	0 %	298501515
7	NC_014251	GCCTT	2	10	10795	10804	0 %	40 %	20 %	40 %	298501515
8	NC_014251	TGAAA	2	10	11164	11173	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014251	AAAGG	2	10	13359	13368	60 %	0 %	40 %	0 %	298501518
10	NC_014251	CTTTT	2	10	16254	16263	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_014251	TACTA	2	10	16374	16383	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_014251	TTAAA	2	10	16721	16730	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014251	TTCTA	2	10	16966	16975	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_014251	CATGG	2	10	18270	18279	20 %	20 %	40 %	20 %	298501522
15	NC_014251	ATTGA	2	10	18326	18335	40 %	40 %	20 %	0 %	298501522
16	NC_014251	TTTTC	2	10	19918	19927	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_014251	ATCTT	2	10	20611	20620	20 %	60 %	0 %	20 %	298501525
18	NC_014251	CTTGA	2	10	22282	22291	20 %	40 %	20 %	20 %	298501527
19	NC_014251	CTTCA	2	10	22631	22640	20 %	40 %	0 %	40 %	298501527
20	NC_014251	AGCCA	2	10	23938	23947	40 %	0 %	20 %	40 %	298501528
21	NC_014251	AGGAT	2	10	24875	24884	40 %	20 %	40 %	0 %	298501529
22	NC_014251	TTTGT	2	10	25245	25254	0 %	80 %	20 %	0 %	298501529
23	NC_014251	AGGAG	2	10	25455	25464	40 %	0 %	60 %	0 %	298501529
24	NC_014251	ATCTT	2	10	25787	25796	20 %	60 %	0 %	20 %	298501529
25	NC_014251	AATCC	2	10	28795	28804	40 %	20 %	0 %	40 %	298501534
26	NC_014251	CCATT	2	10	29590	29599	20 %	40 %	0 %	40 %	298501535
27	NC_014251	AAAGG	2	10	29901	29910	60 %	0 %	40 %	0 %	298501536
28	NC_014251	AACCA	2	10	30918	30927	60 %	0 %	0 %	40 %	298501536
29	NC_014251	TCTTA	2	10	31841	31850	20 %	60 %	0 %	20 %	298501537
30	NC_014251	CTTTT	2	10	32943	32952	0 %	80 %	0 %	20 %	298501539
31	NC_014251	AACTC	2	10	34085	34094	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
32	NC_014251	AACCA	2	10	34370	34379	60 %	0 %	0 %	40 %	298501542
33	NC_014251	TCCCA	2	10	36065	36074	20 %	20 %	0 %	60 %	298501543
34	NC_014251	AGCAA	2	10	36138	36147	60 %	0 %	20 %	20 %	298501543
35	NC_014251	AAATC	2	10	36624	36633	60 %	20 %	0 %	20 %	298501544
36	NC_014251	TTTAG	2	10	37079	37088	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014251	CTTCT	2	10	37236	37245	0 %	60 %	0 %	40 %	298501545
38	NC_014251	CAAGG	2	10	38631	38640	40 %	0 %	40 %	20 %	298501548
39	NC_014251	TTCCT	2	10	41026	41035	0 %	60 %	0 %	40 %	298501552
40	NC_014251	CTCTT	2	10	44017	44026	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
41	NC_014251	TTTCT	2	10	48294	48303	0 %	80 %	0 %	20 %	298501558
42	NC_014251	GTTCT	2	10	49298	49307	0 %	60 %	20 %	20 %	298501560
43	NC_014251	ACTGC	2	10	50579	50588	20 %	20 %	20 %	40 %	298501562
44	NC_014251	TTGTT	2	10	50994	51003	0 %	80 %	20 %	0 %	298501562
45	NC_014251	TTCTT	2	10	51123	51132	0 %	80 %	0 %	20 %	298501562
46	NC_014251	GCAAT	2	10	53166	53175	40 %	20 %	20 %	20 %	298501564
47	NC_014251	TGATT	2	10	55736	55745	20 %	60 %	20 %	0 %	298501566
48	NC_014251	AAATA	2	10	55855	55864	80 %	20 %	0 %	0 %	298501566
49	NC_014251	ACTAT	2	10	56201	56210	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_014251	ATTCA	2	10	57382	57391	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_014251	TCCCT	2	10	57587	57596	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
52	NC_014251	CTCCC	2	10	59798	59807	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
53	NC_014251	CACGA	2	10	61037	61046	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
54	NC_014251	TTATA	2	10	62641	62650	40 %	60 %	0 %	0 %	298501568
55	NC_014251	TATAT	2	10	64512	64521	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014251	TATCA	2	10	66838	66847	40 %	40 %	0 %	20 %	298501572
57	NC_014251	TTATA	2	10	68721	68730	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014251	CTGGA	2	10	69085	69094	20 %	20 %	40 %	20 %	298501574
59	NC_014251	AAGGT	2	10	70745	70754	40 %	20 %	40 %	0 %	298501575
60	NC_014251	TAGGA	2	10	71426	71435	40 %	20 %	40 %	0 %	298501576
61	NC_014251	TCTGC	2	10	73603	73612	0 %	40 %	20 %	40 %	298501576
62	NC_014251	TGGTT	2	10	75594	75603	0 %	60 %	40 %	0 %	298501578
63	NC_014251	AAGGG	2	10	77172	77181	40 %	0 %	60 %	0 %	298501580
64	NC_014251	TCTTG	2	10	77427	77436	0 %	60 %	20 %	20 %	298501580
65	NC_014251	TGCCA	2	10	82221	82230	20 %	20 %	20 %	40 %	298501585
66	NC_014251	CCTTT	2	10	83672	83681	0 %	60 %	0 %	40 %	298501587
67	NC_014251	GAAAT	2	10	86901	86910	60 %	20 %	20 %	0 %	298501591
68	NC_014251	AATAA	3	15	87108	87122	80 %	20 %	0 %	0 %	298501591
69	NC_014251	GCCAG	2	10	88020	88029	20 %	0 %	40 %	40 %	298501593
70	NC_014251	AATCA	2	10	88037	88046	60 %	20 %	0 %	20 %	298501593
71	NC_014251	TTCAT	2	10	88344	88353	20 %	60 %	0 %	20 %	298501593
72	NC_014251	TTTTC	2	10	90229	90238	0 %	80 %	0 %	20 %	298501595
73	NC_014251	ACTGA	2	10	91157	91166	40 %	20 %	20 %	20 %	298501596
74	NC_014251	CACTA	2	10	91792	91801	40 %	20 %	0 %	40 %	298501597
75	NC_014251	AAAGC	2	10	91808	91817	60 %	0 %	20 %	20 %	298501597
76	NC_014251	CAATC	2	10	92016	92025	40 %	20 %	0 %	40 %	298501597
77	NC_014251	CCGTC	2	10	93621	93630	0 %	20 %	20 %	60 %	298501597
78	NC_014251	TAAAT	2	10	93784	93793	60 %	40 %	0 %	0 %	298501597
79	NC_014251	CAGCC	2	10	96540	96549	20 %	0 %	20 %	60 %	298501599
80	NC_014251	ATTTC	2	10	96826	96835	20 %	60 %	0 %	20 %	298501599
81	NC_014251	ATTCT	2	10	98254	98263	20 %	60 %	0 %	20 %	298501601
82	NC_014251	TCGAT	2	10	99349	99358	20 %	40 %	20 %	20 %	298501603
83	NC_014251	ATTAT	2	10	100169	100178	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014251	AAAGT	2	10	102251	102260	60 %	20 %	20 %	0 %	298501606
85	NC_014251	TCAAG	2	10	102838	102847	40 %	20 %	20 %	20 %	298501607
86	NC_014251	GAAGA	2	10	104260	104269	60 %	0 %	40 %	0 %	298501607
87	NC_014251	ATCAA	2	10	104712	104721	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_014251	AAATC	2	10	106149	106158	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_014251	GTTCT	2	10	106796	106805	0 %	60 %	20 %	20 %	298501609
90	NC_014251	AAACC	2	10	111404	111413	60 %	0 %	0 %	40 %	298501614
91	NC_014251	CAAGC	2	10	112157	112166	40 %	0 %	20 %	40 %	298501615
92	NC_014251	AGACC	2	10	114057	114066	40 %	0 %	20 %	40 %	298501618
93	NC_014251	AACCA	2	10	114386	114395	60 %	0 %	0 %	40 %	298501618
94	NC_014251	TAGAG	2	10	114503	114512	40 %	20 %	40 %	0 %	298501618
95	NC_014251	AACCA	2	10	116819	116828	60 %	0 %	0 %	40 %	298501624
96	NC_014251	ATAGT	2	10	119467	119476	40 %	40 %	20 %	0 %	298501626
97	NC_014251	TTTCT	2	10	119824	119833	0 %	80 %	0 %	20 %	298501626
98	NC_014251	TGTCA	2	10	121902	121911	20 %	40 %	20 %	20 %	298501630
99	NC_014251	GTAAT	2	10	122624	122633	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014251	ATTTC	2	10	123692	123701	20 %	60 %	0 %	20 %	298501632
101	NC_014251	TCCCT	2	10	126372	126381	0 %	40 %	0 %	60 %	298501635
102	NC_014251	TTATC	2	10	126443	126452	20 %	60 %	0 %	20 %	298501635
103	NC_014251	ACTTT	2	10	129599	129608	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_014251	GAAGT	2	10	130027	130036	40 %	20 %	40 %	0 %	298501639
105	NC_014251	AAAAC	2	10	131612	131621	80 %	0 %	0 %	20 %	298501640
106	NC_014251	CCAAA	2	10	134614	134623	60 %	0 %	0 %	40 %	298501645
107	NC_014251	AAATT	2	10	137223	137232	60 %	40 %	0 %	0 %	298501647
108	NC_014251	TAGCA	2	10	138110	138119	40 %	20 %	20 %	20 %	298501647
109	NC_014251	TTGTC	2	10	138257	138266	0 %	60 %	20 %	20 %	298501647
110	NC_014251	CCTCT	2	10	144688	144697	0 %	40 %	0 %	60 %	298501650
111	NC_014251	TCCTC	2	10	144914	144923	0 %	40 %	0 %	60 %	298501650
112	NC_014251	TATGG	2	10	150003	150012	20 %	40 %	40 %	0 %	298501655
113	NC_014251	GGATC	2	10	151713	151722	20 %	20 %	40 %	20 %	298501656
114	NC_014251	CACTT	2	10	156625	156634	20 %	40 %	0 %	40 %	298501663
115	NC_014251	AAATC	2	10	157770	157779	60 %	20 %	0 %	20 %	298501663
116	NC_014251	CACTC	2	10	158865	158874	20 %	20 %	0 %	60 %	298501664
117	NC_014251	CCATT	2	10	159308	159317	20 %	40 %	0 %	40 %	298501664
118	NC_014251	AAAGA	2	10	161997	162006	80 %	0 %	20 %	0 %	298501665
119	NC_014251	GAAGA	2	10	162620	162629	60 %	0 %	40 %	0 %	298501665
120	NC_014251	AAGGA	2	10	171075	171084	60 %	0 %	40 %	0 %	298501675
121	NC_014251	ATTTT	2	10	171397	171406	20 %	80 %	0 %	0 %	298501675
122	NC_014251	TTTTG	2	10	171544	171553	0 %	80 %	20 %	0 %	298501675
123	NC_014251	TCCTT	2	10	174097	174106	0 %	60 %	0 %	40 %	298501678
124	NC_014251	TATAT	2	10	174231	174240	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014251	TCATT	2	10	174902	174911	20 %	60 %	0 %	20 %	298501679
126	NC_014251	TCAAC	2	10	175617	175626	40 %	20 %	0 %	40 %	298501680
127	NC_014251	AGGTA	2	10	176608	176617	40 %	20 %	40 %	0 %	298501681
128	NC_014251	AGCTC	2	10	183752	183761	20 %	20 %	20 %	40 %	298501690
129	NC_014251	CAAAG	2	10	184458	184467	60 %	0 %	20 %	20 %	298501692
130	NC_014251	AACCA	2	10	184606	184615	60 %	0 %	0 %	40 %	298501692
131	NC_014251	ATGGA	2	10	187664	187673	40 %	20 %	40 %	0 %	298501694
132	NC_014251	GATTT	2	10	188135	188144	20 %	60 %	20 %	0 %	298501694
133	NC_014251	CAACC	2	10	188221	188230	40 %	0 %	0 %	60 %	298501694
134	NC_014251	GAAAG	2	10	189885	189894	60 %	0 %	40 %	0 %	298501695
135	NC_014251	AGCAT	2	10	189973	189982	40 %	20 %	20 %	20 %	298501696
136	NC_014251	CTTTT	2	10	192117	192126	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_014251	TTCTT	2	10	192177	192186	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
138	NC_014251	AGCTT	2	10	193619	193628	20 %	40 %	20 %	20 %	298501699
139	NC_014251	TTGGT	2	10	193686	193695	0 %	60 %	40 %	0 %	298501699
140	NC_014251	TGATT	2	10	194213	194222	20 %	60 %	20 %	0 %	298501699
141	NC_014251	GTTTA	2	10	195939	195948	20 %	60 %	20 %	0 %	298501703
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146	NC_014251	CTTTT	2	10	205519	205528	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
147	NC_014251	ATTTG	2	10	207058	207067	20 %	60 %	20 %	0 %	298501716
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163	NC_014251	ATTTT	2	10	236835	236844	20 %	80 %	0 %	0 %	298501747
164	NC_014251	TGATT	2	10	237845	237854	20 %	60 %	20 %	0 %	298501747
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192	NC_014251	AATTA	2	10	260188	260197	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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196	NC_014251	CTTCT	2	10	263097	263106	0 %	60 %	0 %	40 %	298501788
197	NC_014251	CTTTT	2	10	263428	263437	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
198	NC_014251	GTTTT	2	10	264474	264483	0 %	80 %	20 %	0 %	298501790
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216	NC_014251	TTGAA	2	10	284371	284380	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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252	NC_014251	AGCTC	2	10	333724	333733	20 %	20 %	20 %	40 %	298501855
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263	NC_014251	TAACC	2	10	349792	349801	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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273	NC_014251	CTATT	2	10	359068	359077	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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399	NC_014251	CAAGA	2	10	525089	525098	60 %	0 %	20 %	20 %	298502090
400	NC_014251	GTCTG	2	10	529583	529592	0 %	40 %	40 %	20 %	298502091
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402	NC_014251	TGATA	2	10	532971	532980	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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