MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus pneumoniae TCH8431/19A chromosome

Total Repeats: 23863

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014251	TAC	2	6	121	126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501503
2	NC_014251	TGT	2	6	133	138	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501503
3	NC_014251	TTC	2	6	578	583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501504
4	NC_014251	ATA	2	6	638	643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501504
5	NC_014251	ATC	2	6	644	649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501504
6	NC_014251	CTT	2	6	694	699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501504
7	NC_014251	CTT	2	6	820	825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501504
8	NC_014251	CTA	2	6	828	833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501504
9	NC_014251	CTT	2	6	859	864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501504
10	NC_014251	CTT	2	6	934	939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501504
11	NC_014251	TTA	2	6	1159	1164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501505
12	NC_014251	AAT	2	6	1209	1214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501505
13	NC_014251	AAT	2	6	1303	1308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501505
14	NC_014251	AAC	2	6	1371	1376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501505
15	NC_014251	TCT	2	6	1435	1440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501505
16	NC_014251	CTT	2	6	1442	1447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501505
17	NC_014251	TCT	2	6	1667	1672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501506
18	NC_014251	TAA	2	6	1682	1687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501506
19	NC_014251	TAC	2	6	1734	1739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501506
20	NC_014251	AAG	2	6	1815	1820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501506
21	NC_014251	CTA	2	6	2148	2153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501508
22	NC_014251	ATC	2	6	2188	2193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501508
23	NC_014251	TAT	2	6	2202	2207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501508
24	NC_014251	TCA	2	6	2375	2380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501508
25	NC_014251	GTT	2	6	2477	2482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501508
26	NC_014251	ATA	2	6	2498	2503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501508
27	NC_014251	CAT	2	6	2554	2559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501508
28	NC_014251	CTA	2	6	2651	2656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501508
29	NC_014251	GGC	2	6	2695	2700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	298501508
30	NC_014251	CAG	2	6	2847	2852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501508
31	NC_014251	CTG	2	6	2994	2999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501508
32	NC_014251	AAC	2	6	3007	3012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501508
33	NC_014251	ATT	2	6	3265	3270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501508
34	NC_014251	ACC	2	6	3317	3322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501508
35	NC_014251	CAG	2	6	3402	3407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501508
36	NC_014251	CTG	2	6	3438	3443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501508
37	NC_014251	TAG	2	6	3477	3482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501508
38	NC_014251	TCT	2	6	3485	3490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501508
39	NC_014251	TCT	2	6	3602	3607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501508
40	NC_014251	GTT	2	6	3637	3642	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501508
41	NC_014251	CCA	2	6	3782	3787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501508
42	NC_014251	CAG	2	6	3798	3803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501508
43	NC_014251	AAG	2	6	3815	3820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501508
44	NC_014251	TCT	2	6	3863	3868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501508
45	NC_014251	TTC	2	6	3958	3963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501508
46	NC_014251	GAT	2	6	4098	4103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501508
47	NC_014251	ACG	2	6	4105	4110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501508
48	NC_014251	TAG	2	6	4176	4181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501508
49	NC_014251	AAT	2	6	4238	4243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501508
50	NC_014251	AAC	2	6	4408	4413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501509
51	NC_014251	AAG	3	9	4474	4482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501509
52	NC_014251	ATT	2	6	4543	4548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501509
53	NC_014251	ATT	2	6	4614	4619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501509
54	NC_014251	CTT	2	6	4674	4679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501509
55	NC_014251	CAT	2	6	5049	5054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501509
56	NC_014251	GAT	2	6	5215	5220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501509
57	NC_014251	ATT	2	6	5287	5292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501510
58	NC_014251	TCT	2	6	5472	5477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501510
59	NC_014251	GCT	2	6	5502	5507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501510
60	NC_014251	TCA	2	6	5526	5531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501510
61	NC_014251	AGC	2	6	5654	5659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501510
62	NC_014251	GCA	2	6	5685	5690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501510
63	NC_014251	CAC	3	9	5713	5721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501510
64	NC_014251	TAG	2	6	5767	5772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501510
65	NC_014251	TCA	2	6	5773	5778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501510
66	NC_014251	CAA	2	6	5785	5790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501510
67	NC_014251	GTA	2	6	5838	5843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501510
68	NC_014251	CGT	2	6	5884	5889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501510
69	NC_014251	CGT	2	6	5917	5922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501510
70	NC_014251	CCA	2	6	5925	5930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501510
71	NC_014251	AAC	2	6	5942	5947	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501510
72	NC_014251	GCT	2	6	5979	5984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501510
73	NC_014251	CAG	2	6	6067	6072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501510
74	NC_014251	CTT	2	6	6109	6114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501510
75	NC_014251	CAA	2	6	6161	6166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501510
76	NC_014251	ACG	2	6	6236	6241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501510
77	NC_014251	GAC	2	6	6250	6255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501510
78	NC_014251	TCC	2	6	6304	6309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298501510
79	NC_014251	AAT	2	6	6808	6813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501511
80	NC_014251	GCT	2	6	6830	6835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501511
81	NC_014251	TGA	2	6	6850	6855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501511
82	NC_014251	CTT	2	6	6937	6942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501511
83	NC_014251	TTC	2	6	6955	6960	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501511
84	NC_014251	TAC	2	6	6964	6969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501511
85	NC_014251	TGA	2	6	7055	7060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501511
86	NC_014251	TCC	2	6	7082	7087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298501511
87	NC_014251	TCA	2	6	7097	7102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501511
88	NC_014251	GCA	2	6	7154	7159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501511
89	NC_014251	ATT	2	6	7321	7326	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501511
90	NC_014251	ATC	2	6	7345	7350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501511
91	NC_014251	ACT	2	6	7361	7366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501511
92	NC_014251	AAG	2	6	7374	7379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501511
93	NC_014251	GGA	2	6	7622	7627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298501512
94	NC_014251	CTC	2	6	7651	7656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298501512
95	NC_014251	ATA	3	9	7703	7711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501512
96	NC_014251	TCA	2	6	7776	7781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501512
97	NC_014251	TAG	2	6	8019	8024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501513
98	NC_014251	TGG	2	6	8194	8199	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	298501513
99	NC_014251	TAC	2	6	8285	8290	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501513
100	NC_014251	AAG	2	6	8346	8351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501513
101	NC_014251	ATA	2	6	8687	8692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501514
102	NC_014251	CGC	3	9	8701	8709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	298501514
103	NC_014251	CTT	2	6	8712	8717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501514
104	NC_014251	GCA	3	9	8720	8728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501514
105	NC_014251	GAT	2	6	8862	8867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501514
106	NC_014251	AGT	2	6	8920	8925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501514
107	NC_014251	ATC	2	6	8953	8958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501514
108	NC_014251	AGC	2	6	8977	8982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501514
109	NC_014251	TGT	2	6	9008	9013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501514
110	NC_014251	TGA	2	6	9116	9121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501514
111	NC_014251	ATG	2	6	9232	9237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501514
112	NC_014251	TCT	2	6	9278	9283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501514
113	NC_014251	GCT	2	6	9290	9295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501514
114	NC_014251	ATC	2	6	9304	9309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501514
115	NC_014251	TAA	2	6	9595	9600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501515
116	NC_014251	CTG	2	6	9660	9665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501515
117	NC_014251	CTT	2	6	9723	9728	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501515
118	NC_014251	CAA	2	6	9790	9795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501515
119	NC_014251	ACT	2	6	9921	9926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501515
120	NC_014251	AGG	2	6	10019	10024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298501515
121	NC_014251	TAT	2	6	10162	10167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501515
122	NC_014251	GAA	2	6	10192	10197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501515
123	NC_014251	CTC	2	6	10230	10235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	298501515
124	NC_014251	ACC	2	6	10254	10259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501515
125	NC_014251	CAG	2	6	10271	10276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501515
126	NC_014251	TTG	2	6	10302	10307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501515
127	NC_014251	AAG	2	6	10420	10425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501515
128	NC_014251	ACA	2	6	10536	10541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501515
129	NC_014251	CAT	2	6	10643	10648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501515
130	NC_014251	ATC	2	6	10653	10658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501515
131	NC_014251	CTA	2	6	10723	10728	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501515
132	NC_014251	TCA	2	6	10743	10748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501515
133	NC_014251	ATT	2	6	10815	10820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501515
134	NC_014251	ACC	2	6	10857	10862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	298501515
135	NC_014251	CTA	2	6	11258	11263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501516
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142	NC_014251	TCA	2	6	12555	12560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501517
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149	NC_014251	CAT	2	6	13112	13117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501518
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151	NC_014251	TGA	2	6	13150	13155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501518
152	NC_014251	CAT	2	6	13161	13166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501518
153	NC_014251	CTT	2	6	13185	13190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501518
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158	NC_014251	CTT	2	6	13541	13546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501518
159	NC_014251	TCT	2	6	13555	13560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501518
160	NC_014251	TGA	2	6	13657	13662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501518
161	NC_014251	ACT	2	6	13693	13698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501518
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163	NC_014251	AAT	2	6	14076	14081	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501518
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239	NC_014251	TAA	2	6	20050	20055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501523
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241	NC_014251	AGG	2	6	20070	20075	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	298501523
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244	NC_014251	TGT	2	6	20135	20140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501524
245	NC_014251	CTT	2	6	20197	20202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501524
246	NC_014251	TTG	2	6	20238	20243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298501524
247	NC_014251	CAT	2	6	20320	20325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298501524
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249	NC_014251	TTC	2	6	20553	20558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501525
250	NC_014251	ATA	2	6	20677	20682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298501525
251	NC_014251	AGC	2	6	21024	21029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501526
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253	NC_014251	ATT	2	6	21379	21384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298501527
254	NC_014251	AAC	2	6	21395	21400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501527
255	NC_014251	ACG	2	6	21548	21553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501527
256	NC_014251	GAA	2	6	21568	21573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501527
257	NC_014251	TTC	2	6	21575	21580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501527
258	NC_014251	AGC	2	6	21668	21673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501527
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261	NC_014251	CTG	2	6	21883	21888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501527
262	NC_014251	AGA	2	6	22054	22059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501527
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365	NC_014251	GAA	2	6	30357	30362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501536
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382	NC_014251	CTT	2	6	31360	31365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501537
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492	NC_014251	TGA	2	6	39964	39969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298501550
493	NC_014251	AAG	2	6	40038	40043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	298501551
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496	NC_014251	AAC	2	6	40155	40160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298501551
497	NC_014251	TTC	3	9	40167	40175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298501551
498	NC_014251	CAG	2	6	40191	40196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	298501551
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500	NC_014251	GTC	2	6	40486	40491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298501551

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