MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Croceibacter atlanticus HTCC2559 chromosome

Total Repeats: 157

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014230	TTACTG	2	12	4493	4504	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_014230	TATCTA	2	12	4652	4663	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_014230	ACCATT	2	12	5895	5906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014230	TACCAT	2	12	6623	6634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014230	ATCACC	2	12	8550	8561	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_014230	CTAAAT	2	12	8978	8989	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_014230	CTGAAA	2	12	9575	9586	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_014230	ATACAG	2	12	9758	9769	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014230	TGTTGA	2	12	10581	10592	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014230	GTGGCC	2	12	10771	10782	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_014230	GTGGCC	2	12	13984	13995	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014230	GTGGCC	2	12	14341	14352	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014230	GTGGCC	2	12	15055	15066	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014230	GTGGCC	2	12	15769	15780	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014230	GTGGCC	2	12	16126	16137	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014230	GTGGCC	2	12	16483	16494	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_014230	GTGGCC	2	12	16840	16851	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014230	GTGGCC	2	12	17197	17208	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014230	GCGTAA	2	12	17597	17608	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_014230	AGTTAA	2	12	18123	18134	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014230	ATCAAA	2	12	18675	18686	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_014230	CTCCAT	2	12	18758	18769	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_014230	CCATTT	2	12	18889	18900	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014230	ACCATC	2	12	19941	19952	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_014230	TATCTG	2	12	20012	20023	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_014230	CCATCT	2	12	20359	20370	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_014230	ATCGAA	2	12	20406	20417	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_014230	TATCAT	2	12	20462	20473	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_014230	ACCATC	2	12	20862	20873	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_014230	ATCTAT	2	12	21018	21029	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_014230	ACCATC	2	12	21249	21260	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_014230	TCCATT	2	12	22629	22640	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014230	CCATCA	2	12	22699	22710	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_014230	CATCTA	2	12	23435	23446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014230	CCATCT	2	12	23491	23502	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_014230	ATCTGT	2	12	23754	23765	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_014230	TCCATC	2	12	24573	24584	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_014230	ATCTAA	2	12	24648	24659	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_014230	CATCTG	2	12	24674	24685	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014230	ACCATC	2	12	24816	24827	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_014230	CTGTAA	2	12	25148	25159	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_014230	ATCTTG	2	12	25395	25406	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_014230	AGTAAT	2	12	25656	25667	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014230	ATTTTT	2	12	82835	82846	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014230	ATATTT	2	12	99492	99503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014230	AACTTA	2	12	100704	100715	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_014230	GCATAA	2	12	113978	113989	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_014230	ACAATA	2	12	160613	160624	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_014230	AACTAA	2	12	178437	178448	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_014230	AATTTA	2	12	215931	215942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014230	AGTGTG	2	12	225114	225125	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014230	ATTAAC	2	12	244596	244607	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_014230	TAAAAT	2	12	244708	244719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014230	ACCTTA	2	12	275068	275079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014230	TCATTT	2	12	275215	275226	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_014230	ACTTCT	2	12	275734	275745	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014230	CGTTTT	2	12	310387	310398	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014230	TTTCTG	2	12	353105	353116	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_014230	TCGAAA	2	12	378561	378572	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_014230	TCTTAA	2	12	381868	381879	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_014230	ACAATA	2	12	381943	381954	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_014230	ATTTAA	2	12	462364	462375	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014230	AAAATT	2	12	466474	466485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014230	ATTTTA	2	12	473665	473676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014230	CTTTTT	2	12	482490	482501	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_014230	AAACCA	2	12	506029	506040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014230	GTTTTT	2	12	557725	557736	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014230	TTTTAA	2	12	568872	568883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014230	TAAAAA	2	12	593360	593371	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014230	TTGTAT	2	12	620982	620993	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014230	ATAAAT	2	12	630756	630767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014230	TTTTGA	2	12	696186	696197	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014230	CAAATT	2	12	722347	722358	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_014230	AATTTT	2	12	764816	764827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014230	ATTTAT	2	12	770188	770199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014230	TAAAAT	2	12	788550	788561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014230	TCTAAA	2	12	802956	802967	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_014230	GATACT	2	12	902182	902193	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_014230	GCCTAA	2	12	924200	924211	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014230	ATTCAT	2	12	944187	944198	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_014230	TAAAGT	2	12	944410	944421	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014230	CAATAT	2	12	972490	972501	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_014230	AAAAGA	2	12	980741	980752	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014230	TTTTTA	2	12	996161	996172	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014230	CAGTTT	2	12	1027076	1027087	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_014230	TAATTT	2	12	1165501	1165512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014230	AATCAA	2	12	1167367	1167378	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_014230	TTCCTA	2	12	1187051	1187062	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014230	TGTTTT	2	12	1187167	1187178	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014230	TGTTTT	2	12	1187277	1187288	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014230	GAACCA	2	12	1258391	1258402	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014230	AGCGAG	2	12	1258731	1258742	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_014230	CGTTGA	2	12	1258843	1258854	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_014230	ATTAAA	2	12	1343680	1343691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014230	AAAACT	2	12	1402326	1402337	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_014230	AAATGA	2	12	1430273	1430284	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014230	ATTAAA	2	12	1431664	1431675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014230	ATCTCT	2	12	1438190	1438201	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_014230	CATAGG	2	12	1438826	1438837	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_014230	TTTAAT	2	12	1439906	1439917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014230	TTCTTT	2	12	1449176	1449187	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_014230	TAATCC	2	12	1475343	1475354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014230	GTAATG	2	12	1481426	1481437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014230	CTAAAT	2	12	1510777	1510788	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_014230	ATTCCT	2	12	1530419	1530430	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014230	AGTACC	2	12	1537771	1537782	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_014230	AACTTT	2	12	1539366	1539377	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_014230	ATAAAT	2	12	1545260	1545271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014230	GTTTGT	2	12	1589445	1589456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014230	TTATAG	2	12	1599882	1599893	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014230	ATTCTT	2	12	1602452	1602463	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_014230	TAATTT	2	12	1627469	1627480	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014230	ATTTTC	2	12	1627491	1627502	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_014230	ATTAAA	2	12	1663243	1663254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014230	TTTTTA	2	12	1683378	1683389	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014230	TAAAGG	2	12	1698690	1698701	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014230	CTTTTT	2	12	1701799	1701810	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_014230	TTGAAA	2	12	1708717	1708728	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014230	TTAAAA	2	12	1709852	1709863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014230	ATTAGT	2	12	1718255	1718266	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014230	ATCTAT	2	12	1733195	1733206	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_014230	TAAATC	2	12	1798207	1798218	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
123	NC_014230	ATTTGT	2	12	1822086	1822097	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014230	TAAATT	2	12	1824005	1824016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014230	CTTTAA	2	12	1828659	1828670	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_014230	TTGTAT	2	12	1839175	1839186	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014230	TCAAAA	2	12	1901903	1901914	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_014230	ATAGTT	2	12	1939419	1939430	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014230	AACTTT	2	12	1947883	1947894	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_014230	ATGTGT	2	12	1978506	1978517	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014230	GAACCA	2	12	2127626	2127637	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_014230	AGCGAG	2	12	2127966	2127977	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
133	NC_014230	CGTTGA	2	12	2128078	2128089	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_014230	TTAATT	2	12	2150599	2150610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014230	TTATTT	2	12	2206721	2206732	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014230	TGAGTA	2	12	2210394	2210405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014230	AATAAA	2	12	2228845	2228856	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014230	TAAAAT	2	12	2247667	2247678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014230	GTTTTA	2	12	2274099	2274110	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014230	TAAAAA	2	12	2291865	2291876	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014230	AAGAAA	2	12	2349781	2349792	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014230	TTAATG	2	12	2350278	2350289	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014230	TTTTAC	2	12	2353513	2353524	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
144	NC_014230	GAAAAA	2	12	2384829	2384840	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014230	GCATTT	2	12	2427573	2427584	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
146	NC_014230	ATAAAT	2	12	2480284	2480295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014230	TTGTTT	2	12	2484037	2484048	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014230	TATAAT	2	12	2494778	2494789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014230	ATCGCT	2	12	2549778	2549789	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_014230	AATTGA	2	12	2567072	2567083	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014230	TTTCTC	2	12	2584292	2584303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
152	NC_014230	TTTTAG	2	12	2608248	2608259	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014230	TATACA	2	12	2627726	2627737	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
154	NC_014230	ATTGAA	2	12	2663721	2663732	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014230	TAAAAA	2	12	2699301	2699312	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_014230	TCTTTT	2	12	2710062	2710073	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
157	NC_014230	ATCTTT	2	12	2782104	2782115	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.