MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Croceibacter atlanticus HTCC2559 chromosome

Total Repeats: 1494

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014230	AGTAGC	2	12	28556	28567	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	298206595
2	NC_014230	ACAGCT	2	12	36950	36961	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	298206597
3	NC_014230	TGCTTC	2	12	38103	38114	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	298206599
4	NC_014230	TTAACG	2	12	38406	38417	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	298206600
5	NC_014230	ACAGTA	2	12	39555	39566	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	298206602
6	NC_014230	GTTTCA	2	12	44606	44617	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	298206607
7	NC_014230	ATAACC	2	12	44951	44962	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	298206608
8	NC_014230	TTGCAA	2	12	46345	46356	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	298206609
9	NC_014230	CTTTTT	2	12	46420	46431	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	298206609
10	NC_014230	TAAGAA	2	12	47064	47075	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	298206610
11	NC_014230	AGTTTT	2	12	48938	48949	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	298206611
12	NC_014230	TGGTAA	2	12	49449	49460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298206611
13	NC_014230	CATTTA	2	12	51969	51980	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	298206614
14	NC_014230	TAATGT	2	12	52222	52233	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	298206614
15	NC_014230	GTTTCA	2	12	52970	52981	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	298206615
16	NC_014230	GGAACA	2	12	53183	53194	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	298206615
17	NC_014230	TGCTAA	2	12	60038	60049	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	298206623
18	NC_014230	CCTGTT	2	12	62133	62144	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	298206625
19	NC_014230	AGAAAA	2	12	62937	62948	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	298206626
20	NC_014230	AATTAA	2	12	65487	65498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298206626
21	NC_014230	TAGAGA	2	12	66100	66111	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	298206627
22	NC_014230	TCTTAG	2	12	67673	67684	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	298206628
23	NC_014230	TGTAAT	2	12	69117	69128	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	298206628
24	NC_014230	TGCTAA	2	12	70115	70126	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	298206629
25	NC_014230	TCTGTA	2	12	70925	70936	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	298206631
26	NC_014230	ACCTGT	2	12	71323	71334	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	298206631
27	NC_014230	ACCAGT	2	12	71821	71832	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	298206631
28	NC_014230	TTTTGG	2	12	72338	72349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298206631
29	NC_014230	TATTGC	2	12	72499	72510	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	298206631
30	NC_014230	TTGAAA	2	12	73016	73027	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	298206632
31	NC_014230	AAGAAA	2	12	83144	83155	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	298206642
32	NC_014230	GAGAAG	2	12	86444	86455	50 %	0 %	50 %	0 %	298206645
33	NC_014230	TGCTTC	2	12	86562	86573	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	298206645
34	NC_014230	AAAGAA	2	12	88040	88051	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	298206648
35	NC_014230	GAATTT	2	12	90605	90616	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	298206651
36	NC_014230	ACTTGG	2	12	91097	91108	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	298206652
37	NC_014230	AACTTA	2	12	92811	92822	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	298206654
38	NC_014230	ATACAA	2	12	104807	104818	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	298206666
39	NC_014230	CTTTTA	2	12	105903	105914	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	298206668
40	NC_014230	ATTTAT	2	12	118538	118549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298206680
41	NC_014230	ATTTGC	2	12	121610	121621	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	298206684
42	NC_014230	CATTAT	2	12	124912	124923	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	298206689
43	NC_014230	GCATTG	2	12	126134	126145	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	298206690
44	NC_014230	AGCTTC	2	12	128476	128487	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	298206692
45	NC_014230	TATCTA	2	12	129568	129579	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	298206693
46	NC_014230	CTCTGT	2	12	131220	131231	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	298206694
47	NC_014230	CAATAA	2	12	132627	132638	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	298206695
48	NC_014230	CAGGTT	2	12	136455	136466	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	298206701
49	NC_014230	ATAACT	2	12	136685	136696	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	298206701
50	NC_014230	GGTATT	2	12	136890	136901	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	298206701
51	NC_014230	AATGGA	2	12	137858	137869	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	298206702
52	NC_014230	AAATAA	2	12	139968	139979	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	298206703
53	NC_014230	TTTTGG	2	12	140134	140145	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298206704
54	NC_014230	CAGATT	2	12	142545	142556	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	298206706
55	NC_014230	TTTTAA	2	12	143810	143821	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298206707
56	NC_014230	CTGCTC	2	12	145875	145886	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	298206709
57	NC_014230	CATTAA	2	12	146785	146796	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	298206709
58	NC_014230	TGATTG	2	12	147356	147367	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	298206710
59	NC_014230	TTTCAT	2	12	147867	147878	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	298206711
60	NC_014230	CATCTA	2	12	149052	149063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298206711
61	NC_014230	GAGTTA	2	12	151078	151089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298206714
62	NC_014230	AAATTT	2	12	152806	152817	50 %	50 %	0 %	0 %	298206715
63	NC_014230	TGTACC	2	12	154048	154059	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	298206715
64	NC_014230	TTGCAG	2	12	154656	154667	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	298206715
65	NC_014230	TGAGAA	2	12	157244	157255	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	298206717
66	NC_014230	CTGGAG	2	12	158756	158767	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	298206719
67	NC_014230	GCTTCG	2	12	161954	161965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	298206721
68	NC_014230	AAGTTC	2	12	168206	168217	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	298206729
69	NC_014230	ACCAAA	2	12	170652	170663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	298206730
70	NC_014230	TTTGAT	2	12	175943	175954	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	298206734
71	NC_014230	TAATTT	2	12	179122	179133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298206736
72	NC_014230	AATTAA	2	12	180494	180505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298206737
73	NC_014230	CTTTAT	2	12	183095	183106	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	298206740
74	NC_014230	CAGAAA	2	12	185181	185192	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	298206742
75	NC_014230	TTAAAT	2	12	186238	186249	50 %	50 %	0 %	0 %	298206744
76	NC_014230	TCCACA	2	12	187512	187523	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	298206745
77	NC_014230	AATGGT	2	12	187614	187625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298206745
78	NC_014230	GTCACC	2	12	187647	187658	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	298206745
79	NC_014230	TCTGCC	2	12	188508	188519	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	298206745
80	NC_014230	ATTGTC	2	12	189122	189133	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	298206745
81	NC_014230	GCATCT	2	12	191463	191474	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	298206745
82	NC_014230	ATCTGC	2	12	192047	192058	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	298206745
83	NC_014230	CTGCAT	2	12	192331	192342	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	298206745
84	NC_014230	ATCTGC	2	12	192626	192637	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	298206745
85	NC_014230	CTCCAT	2	12	193432	193443	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	298206745
86	NC_014230	AACTCT	2	12	203753	203764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298206758
87	NC_014230	TCTCTA	2	12	206823	206834	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	298206760
88	NC_014230	CAATAA	2	12	208001	208012	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	298206761
89	NC_014230	AAGATG	2	12	211206	211217	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	298206764
90	NC_014230	TACAAT	2	12	217326	217337	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	298206771
91	NC_014230	TTCATT	2	12	218876	218887	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	298206773
92	NC_014230	TACATC	2	12	223524	223535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298206778
93	NC_014230	ATTGCA	2	12	223690	223701	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	298206778
94	NC_014230	ATGTTG	2	12	224321	224332	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	298206778
95	NC_014230	CTTCTG	2	12	225397	225408	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	298206779
96	NC_014230	TTTCAT	2	12	226570	226581	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	298206780
97	NC_014230	TAGGAA	2	12	229587	229598	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	298206782
98	NC_014230	CAACTT	2	12	229890	229901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298206782
99	NC_014230	CTAAAT	2	12	230439	230450	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	298206782
100	NC_014230	ATCTGA	2	12	231056	231067	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	298206783
101	NC_014230	AGAGCT	2	12	234045	234056	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	298206786
102	NC_014230	CTACAT	2	12	235944	235955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298206789
103	NC_014230	TATATT	2	12	240710	240721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298206792
104	NC_014230	TTGGGC	2	12	242674	242685	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	298206793
105	NC_014230	CAAGAA	2	12	244130	244141	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	298206793
106	NC_014230	CAGATT	2	12	246581	246592	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	298206794
107	NC_014230	CAGATG	2	12	247190	247201	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	298206794
108	NC_014230	TGTTAC	2	12	247392	247403	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	298206794
109	NC_014230	ACTCCT	2	12	247882	247893	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	298206794
110	NC_014230	AGTTTC	2	12	248562	248573	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	298206794
111	NC_014230	GTTACT	2	12	249031	249042	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	298206794
112	NC_014230	AATAAA	2	12	252862	252873	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	298206796
113	NC_014230	TTTGAT	2	12	253750	253761	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	298206796
114	NC_014230	ATGGCT	2	12	255482	255493	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	298206798
115	NC_014230	ATCTCA	2	12	255546	255557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298206798
116	NC_014230	GTATTT	2	12	260107	260118	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	298206801
117	NC_014230	TCCACA	2	12	261684	261695	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	298206802
118	NC_014230	AATGGT	2	12	261786	261797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	298206802
119	NC_014230	GTCACC	2	12	261819	261830	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	298206802
120	NC_014230	TCTGCC	2	12	262680	262691	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	298206802
121	NC_014230	ATTGTC	2	12	263294	263305	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	298206802
122	NC_014230	TAGTAT	2	12	265005	265016	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	298206803
123	NC_014230	ATCTGC	2	12	265630	265641	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	298206803
124	NC_014230	AATGCA	2	12	266651	266662	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	298206803
125	NC_014230	TTAAAT	2	12	272870	272881	50 %	50 %	0 %	0 %	298206807
126	NC_014230	TTTAAT	2	12	278497	278508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298206812
127	NC_014230	TTTATA	2	12	281770	281781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298206815
128	NC_014230	GTTTTT	2	12	286620	286631	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	298206822
129	NC_014230	GCTTAT	2	12	288444	288455	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	298206824
130	NC_014230	TAAAAT	2	12	291804	291815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298206826
131	NC_014230	GTTTGT	2	12	296942	296953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	298206829
132	NC_014230	CCATCA	2	12	298590	298601	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	298206829
133	NC_014230	TACCAA	2	12	298936	298947	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	298206829
134	NC_014230	TGGATT	2	12	302207	302218	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	298206831
135	NC_014230	CTATTT	2	12	306105	306116	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	298206835
136	NC_014230	CTTCAA	2	12	308051	308062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298206837
137	NC_014230	AAGTGA	2	12	314936	314947	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	298206843
138	NC_014230	TGCTAC	2	12	316201	316212	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	298206843
139	NC_014230	AAAGAA	2	12	318388	318399	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	298206845
140	NC_014230	TCATAA	2	12	319226	319237	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	298206846
141	NC_014230	CATCTT	2	12	323848	323859	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	298206849
142	NC_014230	ATTTCC	2	12	325152	325163	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	298206850
143	NC_014230	TAACCA	2	12	328051	328062	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	298206853
144	NC_014230	ACCTTT	2	12	329962	329973	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	298206854
145	NC_014230	TTTTCC	2	12	332330	332341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	298206856
146	NC_014230	GAAAAA	2	12	336661	336672	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	298206860
147	NC_014230	TCTTCA	2	12	338416	338427	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	298206863
148	NC_014230	CATTAC	2	12	338876	338887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298206863
149	NC_014230	TCTTTT	2	12	339181	339192	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	298206863
150	NC_014230	TGTAAA	2	12	341217	341228	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	298206863
151	NC_014230	TGCAAA	2	12	341565	341576	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	298206863
152	NC_014230	TTAAAC	2	12	344772	344783	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	298206865
153	NC_014230	CTGTAT	2	12	350355	350366	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	298206870
154	NC_014230	ACCAAT	2	12	350524	350535	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	298206870
155	NC_014230	ATCTTA	2	12	350990	351001	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	298206871
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159	NC_014230	CTTCAC	2	12	357252	357263	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	298206877
160	NC_014230	TGAAGA	2	12	357304	357315	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	298206877
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163	NC_014230	TTTGAG	2	12	359607	359618	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	298206878
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169	NC_014230	GCTGTT	2	12	363089	363100	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	298206878
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179	NC_014230	CATCTA	2	12	383330	383341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	298206888
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185	NC_014230	GCAACA	2	12	398812	398823	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	298206902
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200	NC_014230	CTAGAG	2	12	425368	425379	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	298206930
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204	NC_014230	TCTGCA	2	12	431239	431250	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	298206936
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220	NC_014230	ATTATA	2	12	474829	474840	50 %	50 %	0 %	0 %	298206972
221	NC_014230	GCAAAA	2	12	474844	474855	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	298206972
222	NC_014230	AATGAA	2	12	478807	478818	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	298206976
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228	NC_014230	ATTTAT	2	12	496584	496595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	298206990
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230	NC_014230	ATTATA	2	12	498583	498594	50 %	50 %	0 %	0 %	298206994
231	NC_014230	ACACCT	2	12	500468	500479	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	298206996
232	NC_014230	ATTCTA	2	12	501560	501571	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	298206997
233	NC_014230	AATTAA	2	12	501876	501887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298206997
234	NC_014230	GTTTTA	2	12	502630	502641	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	298206998
235	NC_014230	GTTAAA	2	12	502776	502787	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	298206998
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250	NC_014230	ATGCTA	2	12	521926	521937	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	298207017
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341	NC_014230	GTACCA	2	12	700735	700746	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	298207194
342	NC_014230	GATCAC	2	12	701014	701025	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	298207194
343	NC_014230	TAAAAA	2	12	706557	706568	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	298207201
344	NC_014230	TGCCAT	2	12	709461	709472	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	298207203
345	NC_014230	CCTGCA	2	12	709628	709639	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	298207203
346	NC_014230	TTCTAT	2	12	716287	716298	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	298207210
347	NC_014230	AGTTTT	2	12	718418	718429	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	298207212
348	NC_014230	CTAAAT	2	12	719063	719074	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	298207213
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352	NC_014230	CTGGAG	2	12	723067	723078	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	298207218
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357	NC_014230	GATGGT	2	12	731362	731373	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	298207224
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373	NC_014230	TAATGA	2	12	754962	754973	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	298207239
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375	NC_014230	TATTTT	2	12	756300	756311	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	298207240
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459	NC_014230	AAGCCA	2	12	901816	901827	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	298207377
460	NC_014230	GGAAAC	2	12	903427	903438	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	298207379
461	NC_014230	AGTTAC	2	12	904574	904585	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	298207380
462	NC_014230	TTAAAA	2	12	907804	907815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	298207383
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