MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Croceibacter atlanticus HTCC2559 chromosome

Total Repeats: 283

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014230	CATTA	2	10	5463	5472	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014230	ATAGT	2	10	7660	7669	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014230	TATTG	2	10	8697	8706	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014230	TACAT	2	10	8929	8938	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_014230	TACTA	2	10	17895	17904	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_014230	AAATC	2	10	21643	21652	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_014230	AAGGT	2	10	39778	39787	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014230	AGATA	2	10	49825	49834	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014230	CTTCT	2	10	62355	62364	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_014230	TAAGT	2	10	72585	72594	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014230	AGTTT	3	15	72600	72614	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014230	GTTAA	2	10	73814	73823	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014230	CCCGA	2	10	75249	75258	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
14	NC_014230	ATTAA	2	10	75678	75687	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014230	TAAAA	2	10	76894	76903	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014230	ATTTT	2	10	79115	79124	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014230	AATTA	2	10	79189	79198	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014230	TTGTA	2	10	83633	83642	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014230	AGAAA	2	10	100823	100832	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014230	TTAAA	2	10	104401	104410	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014230	TAAAC	2	10	107512	107521	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_014230	AAAAT	2	10	129450	129459	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014230	TTGTG	2	10	149297	149306	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014230	TTGTA	2	10	166237	166246	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014230	TTTAA	2	10	169382	169391	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014230	AGATT	2	10	185313	185322	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014230	ACAAG	2	10	198417	198426	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_014230	TAAAA	2	10	202785	202794	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014230	TTTAA	2	10	230602	230611	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014230	AAACT	2	10	231210	231219	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_014230	AAATT	2	10	238648	238657	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014230	TTCAT	2	10	238885	238894	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_014230	CTCTA	2	10	245045	245054	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_014230	ATACA	2	10	283949	283958	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_014230	TATAA	2	10	287114	287123	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014230	GTATT	2	10	287125	287134	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014230	AATAA	2	10	303092	303101	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014230	TAATT	2	10	313774	313783	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014230	TTAAA	2	10	314333	314342	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014230	ATTTT	2	10	345353	345362	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014230	AATTA	2	10	348840	348849	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014230	CTTTA	2	10	353173	353182	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_014230	GTTTT	2	10	390085	390094	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014230	AATAA	2	10	399979	399988	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014230	CTAGT	2	10	407710	407719	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
46	NC_014230	CATTA	2	10	413302	413311	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_014230	TGTTT	2	10	416468	416477	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014230	AACTA	2	10	416976	416985	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
49	NC_014230	TACAA	2	10	423428	423437	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_014230	TGTGC	2	10	425436	425445	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
51	NC_014230	ACTTA	2	10	431640	431649	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_014230	CCAAA	2	10	438037	438046	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
53	NC_014230	ACTAT	2	10	456894	456903	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_014230	GTTTT	2	10	457427	457436	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014230	GAAAA	2	10	461837	461846	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014230	TTTAA	2	10	466760	466769	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014230	TATTG	2	10	489369	489378	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014230	ATTTT	2	10	504551	504560	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014230	CAATA	2	10	528854	528863	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
60	NC_014230	TCTCT	2	10	578234	578243	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
61	NC_014230	TTTAA	2	10	578809	578818	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014230	TTTGT	2	10	594940	594949	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014230	TATAT	2	10	620838	620847	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014230	ATGAT	2	10	627099	627108	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014230	AAGAA	2	10	630564	630573	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014230	GTTTA	2	10	638577	638586	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014230	TTAAT	2	10	650021	650030	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014230	TTTCT	2	10	654361	654370	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_014230	AGTTT	2	10	656106	656115	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014230	TTTGT	2	10	710517	710526	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014230	ATATA	2	10	722302	722311	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014230	TTTAT	2	10	784333	784342	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014230	CTATA	2	10	788498	788507	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_014230	TTTTG	2	10	788953	788962	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014230	ATAAA	2	10	817663	817672	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014230	GAATT	2	10	823053	823062	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014230	CTAAA	2	10	833300	833309	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_014230	TTATT	2	10	847537	847546	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014230	ATTTG	2	10	896877	896886	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014230	TCAAA	2	10	921874	921883	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_014230	CTAAA	2	10	927936	927945	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_014230	TAGTT	2	10	947353	947362	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014230	AAAAG	2	10	967639	967648	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014230	ATGTT	2	10	973180	973189	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014230	ATTTT	2	10	989445	989454	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014230	TACAT	2	10	1009285	1009294	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_014230	TTGAA	2	10	1013312	1013321	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014230	CGCTT	2	10	1039740	1039749	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_014230	TAAGA	2	10	1040898	1040907	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014230	TTAAT	2	10	1041011	1041020	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014230	ATTTA	2	10	1041066	1041075	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014230	AACTA	2	10	1049646	1049655	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_014230	AGTTA	2	10	1063629	1063638	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014230	TAACA	2	10	1083673	1083682	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_014230	TGGTG	2	10	1088718	1088727	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014230	AATTT	2	10	1088793	1088802	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014230	AAATA	2	10	1112252	1112261	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014230	TTAAA	2	10	1120913	1120922	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014230	AAGTC	2	10	1120965	1120974	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_014230	AATAT	2	10	1137364	1137373	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014230	CAATG	2	10	1169052	1169061	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
102	NC_014230	GTCCC	2	10	1172757	1172766	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
103	NC_014230	TTAAG	2	10	1215547	1215556	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014230	CAAAG	2	10	1241421	1241430	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_014230	TAAAT	2	10	1245174	1245183	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014230	TTAAA	2	10	1245309	1245318	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014230	CAATT	2	10	1253012	1253021	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_014230	TCGGA	2	10	1257392	1257401	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_014230	AATTA	2	10	1257783	1257792	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014230	CAAGC	2	10	1258083	1258092	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_014230	CTGAA	2	10	1258250	1258259	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_014230	CCGTA	2	10	1259653	1259662	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_014230	ATTAA	2	10	1267206	1267215	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014230	TATGT	2	10	1283747	1283756	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014230	TCTTT	2	10	1290834	1290843	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_014230	ATTTT	2	10	1295788	1295797	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014230	TAAAG	2	10	1303148	1303157	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014230	AAACA	2	10	1333738	1333747	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_014230	AATTA	2	10	1336849	1336858	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014230	TTAAT	2	10	1343474	1343483	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014230	TACAG	2	10	1343883	1343892	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_014230	ATTTA	2	10	1345375	1345384	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014230	ATAGT	2	10	1375959	1375968	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014230	TTTTG	2	10	1385985	1385994	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014230	TTAAT	2	10	1385999	1386008	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014230	AGGTA	2	10	1410863	1410872	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014230	GATAT	2	10	1413456	1413465	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014230	TTATT	2	10	1421487	1421496	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014230	GTATT	2	10	1428983	1428992	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014230	TAAGA	2	10	1429120	1429129	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014230	TAAAT	2	10	1430330	1430339	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014230	TTTAG	2	10	1438068	1438077	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014230	TAAAA	2	10	1439028	1439037	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014230	CGCCA	2	10	1439599	1439608	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
135	NC_014230	TTAAA	2	10	1463709	1463718	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014230	CAAAT	2	10	1467441	1467450	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_014230	TTATG	2	10	1481519	1481528	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014230	TATAA	2	10	1511006	1511015	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014230	AAAAC	2	10	1517224	1517233	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
140	NC_014230	TGTTT	2	10	1518957	1518966	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014230	AGTTT	2	10	1523560	1523569	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014230	TTAAA	2	10	1543360	1543369	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014230	GAAAT	2	10	1559702	1559711	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014230	TAATC	2	10	1589491	1589500	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_014230	GTTTG	2	10	1591847	1591856	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014230	TTAGG	2	10	1591891	1591900	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014230	CCCGA	2	10	1591960	1591969	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
148	NC_014230	ACTTT	2	10	1602553	1602562	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
149	NC_014230	TTTAC	2	10	1603663	1603672	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
150	NC_014230	TAACC	2	10	1619689	1619698	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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153	NC_014230	AGTAA	2	10	1641442	1641451	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_014230	GACAA	2	10	1648349	1648358	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
156	NC_014230	ATTTT	2	10	1648397	1648406	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_014230	TTTAA	2	10	1695089	1695098	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_014230	ATTTC	2	10	1698676	1698685	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
159	NC_014230	ATTAA	2	10	1701718	1701727	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_014230	TGTAT	2	10	1722455	1722464	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
161	NC_014230	TTAGT	2	10	1742622	1742631	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
162	NC_014230	CATTT	2	10	1751309	1751318	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
163	NC_014230	ATTCT	2	10	1751343	1751352	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
164	NC_014230	TTTTA	2	10	1780484	1780493	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_014230	GAAAC	2	10	1793430	1793439	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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168	NC_014230	TAAAA	2	10	1807128	1807137	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_014230	TTTAA	2	10	1807272	1807281	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_014230	GTTTT	2	10	1810087	1810096	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_014230	TAAAG	2	10	1939450	1939459	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
183	NC_014230	AAAAG	2	10	1946189	1946198	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
184	NC_014230	ATTAA	2	10	1969634	1969643	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_014230	TAATT	2	10	1983002	1983011	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_014230	AAAAT	2	10	1984329	1984338	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_014230	AAGCA	2	10	2028626	2028635	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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283	NC_014230	TTAAA	2	10	2916803	2916812	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.