MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Xenorhabdus nematophila ATCC 19061 chromosome

Total Repeats: 715

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014228	TTAAA	2	10	6907	6916	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014228	TAATT	2	10	7639	7648	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014228	ATAAC	2	10	24614	24623	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_014228	TTGTT	2	10	35472	35481	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014228	CAGAT	2	10	44430	44439	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6	NC_014228	TTAAT	2	10	47995	48004	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014228	GCTGA	2	10	48150	48159	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_014228	CCCGC	2	10	65873	65882	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
9	NC_014228	TTTAT	2	10	79913	79922	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014228	TTTAT	2	10	87072	87081	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014228	TTCCC	2	10	96293	96302	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
12	NC_014228	TTTAT	2	10	96564	96573	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014228	TATCA	2	10	111358	111367	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_014228	TTGTG	2	10	115682	115691	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014228	TCAGG	2	10	120250	120259	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_014228	CCATA	2	10	120389	120398	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_014228	ACATA	2	10	141335	141344	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014228	AAGGG	2	10	153838	153847	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014228	CAAAA	2	10	159079	159088	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_014228	TAAAT	2	10	169544	169553	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014228	TTTGT	2	10	180718	180727	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014228	ATACG	2	10	185844	185853	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_014228	TTTTA	2	10	196053	196062	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014228	AATTT	2	10	216181	216190	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014228	AAAAT	2	10	216243	216252	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014228	TAAAA	2	10	223031	223040	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014228	ATGCA	2	10	226105	226114	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_014228	TTATT	2	10	230256	230265	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014228	CAATT	2	10	232304	232313	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_014228	GCTGA	2	10	246003	246012	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_014228	TTTTA	2	10	251326	251335	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014228	ATGCA	2	10	255758	255767	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_014228	GGGAT	2	10	259900	259909	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014228	ATAAA	2	10	265556	265565	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014228	AATAA	2	10	284255	284264	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014228	TCAGG	2	10	285904	285913	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_014228	TTTCA	2	10	331721	331730	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_014228	GTTTT	2	10	334093	334102	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014228	CTTGT	2	10	342162	342171	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_014228	TAAAT	2	10	351311	351320	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014228	TACGA	2	10	352402	352411	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
42	NC_014228	TGGCT	2	10	352641	352650	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
43	NC_014228	TAAAA	2	10	360080	360089	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014228	CTTTT	2	10	360335	360344	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_014228	TTTTA	2	10	383177	383186	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014228	GCAGA	2	10	384486	384495	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
47	NC_014228	TTATG	2	10	384520	384529	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014228	AGTTA	2	10	393697	393706	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014228	TTTTA	2	10	399177	399186	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014228	ACTGA	2	10	403139	403148	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
51	NC_014228	TGACA	2	10	405616	405625	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_014228	GTGTG	2	10	427090	427099	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014228	TATAT	2	10	451580	451589	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014228	ATTTT	2	10	451677	451686	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014228	TAAAT	2	10	452007	452016	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014228	ATTTA	2	10	452076	452085	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014228	CAAAA	2	10	463863	463872	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_014228	TATTT	2	10	465204	465213	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014228	ATAAG	2	10	465459	465468	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014228	GCTAT	2	10	469263	469272	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
61	NC_014228	ATATA	2	10	476999	477008	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014228	TAGAC	2	10	479372	479381	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_014228	AACGA	2	10	481802	481811	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_014228	GATAT	2	10	493193	493202	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014228	ATATA	2	10	493209	493218	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014228	CTTCG	2	10	497085	497094	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_014228	AAAGA	2	10	506151	506160	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014228	AAAGA	2	10	506541	506550	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014228	TTTGA	2	10	512517	512526	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014228	TGTTT	2	10	512713	512722	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014228	TGTTT	2	10	512834	512843	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014228	TGTTT	2	10	512955	512964	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014228	TTAGC	2	10	525111	525120	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_014228	TGTAA	2	10	525190	525199	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014228	ATTTG	2	10	552749	552758	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014228	TTTAA	2	10	552856	552865	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014228	ATTAA	2	10	553095	553104	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014228	CTGTC	2	10	553428	553437	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_014228	ATGGT	2	10	553860	553869	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014228	GTTTT	2	10	554665	554674	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014228	TCTAT	2	10	563321	563330	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_014228	GTTAC	2	10	564125	564134	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_014228	GCTAA	2	10	564342	564351	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_014228	TTTTC	2	10	573361	573370	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_014228	TAAAT	2	10	574483	574492	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014228	TGATG	2	10	581407	581416	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014228	TTTGG	2	10	588276	588285	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014228	TACAA	2	10	600310	600319	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_014228	TTTAA	2	10	600374	600383	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014228	CTTAT	2	10	612756	612765	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_014228	GAAAA	2	10	614988	614997	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014228	AGGCG	2	10	623629	623638	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
93	NC_014228	TATAA	2	10	626460	626469	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014228	ATTTA	2	10	631109	631118	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014228	TGCTG	2	10	655570	655579	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
96	NC_014228	AGATA	2	10	667646	667655	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014228	ATGTT	2	10	670181	670190	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014228	ATGAT	2	10	670225	670234	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014228	AAATA	2	10	683360	683369	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014228	AATAT	2	10	696167	696176	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014228	TTAAT	2	10	698391	698400	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014228	ATTTT	2	10	698572	698581	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014228	ATTTT	2	10	711108	711117	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014228	TTATT	2	10	711286	711295	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014228	GTTTG	2	10	713903	713912	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014228	GTAGT	2	10	713929	713938	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014228	TGCAT	2	10	718871	718880	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
108	NC_014228	ATTAT	2	10	720238	720247	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014228	ATTCT	2	10	724359	724368	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_014228	AGCAC	2	10	724899	724908	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
111	NC_014228	TTAAC	2	10	740989	740998	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_014228	TGTAA	2	10	747915	747924	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014228	ATTAC	2	10	747964	747973	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_014228	TGGTA	2	10	772030	772039	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014228	AGTAC	2	10	783951	783960	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
116	NC_014228	GATAT	2	10	788028	788037	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014228	ATCAG	2	10	791298	791307	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_014228	CAAAA	2	10	813869	813878	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_014228	TCCAA	2	10	815070	815079	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
120	NC_014228	ATCAT	2	10	815158	815167	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
121	NC_014228	AAAAT	2	10	835838	835847	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014228	AGATA	2	10	836938	836947	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014228	CAATT	2	10	845333	845342	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_014228	ACTAA	2	10	849311	849320	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_014228	TATTT	2	10	859044	859053	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014228	TTGCT	2	10	870515	870524	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
127	NC_014228	TAAGT	2	10	870544	870553	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014228	AAAAC	2	10	888175	888184	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_014228	TTTTC	2	10	896701	896710	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_014228	ATTTT	2	10	901244	901253	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014228	TATTT	2	10	906221	906230	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014228	TTTAT	2	10	909848	909857	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014228	AACAG	2	10	909964	909973	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_014228	GTTTT	2	10	915829	915838	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014228	AATTT	2	10	916796	916805	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014228	GCTGA	2	10	940413	940422	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_014228	GTTAT	2	10	942065	942074	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014228	TCTTA	2	10	943244	943253	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_014228	ATTAT	2	10	947935	947944	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014228	AATAA	2	10	971552	971561	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014228	AAATA	2	10	972353	972362	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014228	AAAAT	2	10	980249	980258	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014228	GTATT	2	10	982779	982788	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014228	AGTTT	2	10	983796	983805	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014228	TAGCA	2	10	984324	984333	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
146	NC_014228	TTTTA	2	10	994921	994930	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014228	TATTG	2	10	995609	995618	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014228	ATTTA	2	10	1002062	1002071	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014228	TAATC	2	10	1003110	1003119	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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151	NC_014228	ATTAT	2	10	1008497	1008506	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_014228	GTGCT	2	10	1214197	1214206	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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287	NC_014228	TAGTT	2	10	1805217	1805226	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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465	NC_014228	TAGTG	2	10	2865528	2865537	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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467	NC_014228	AACGA	2	10	2869507	2869516	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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476	NC_014228	GGCGT	2	10	2903583	2903592	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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482	NC_014228	GCGAA	2	10	2947102	2947111	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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485	NC_014228	TCTAC	2	10	2966306	2966315	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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487	NC_014228	TGCAT	2	10	2973067	2973076	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
488	NC_014228	CAAAC	2	10	2994371	2994380	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
489	NC_014228	TTAAT	2	10	2995224	2995233	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
490	NC_014228	TCCAA	2	10	2995580	2995589	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
491	NC_014228	CGGCT	2	10	2997541	2997550	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
492	NC_014228	TCCTA	2	10	2998299	2998308	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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500	NC_014228	ACGTG	2	10	3092883	3092892	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding

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