MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Methanococcus voltae A3 chromosome

Total Repeats: 445

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014222	ATTTTT	2	12	749	760	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014222	ATTATA	2	12	2855	2866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014222	TTTTAT	2	12	19572	19583	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014222	TTTTAT	2	12	24350	24361	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014222	TGTTAA	2	12	27696	27707	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014222	AATAAA	2	12	33937	33948	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014222	ATAAAA	3	18	38022	38039	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014222	TAAAAT	2	12	39226	39237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014222	TTAAAA	2	12	39282	39293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014222	TTTGTT	2	12	48093	48104	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014222	TTATAT	2	12	48780	48791	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014222	TAAAAA	2	12	56460	56471	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014222	TTTAAA	2	12	57183	57194	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014222	TTTAAT	2	12	62584	62595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014222	TTTTAT	2	12	83828	83839	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014222	TTTTAT	2	12	88606	88617	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014222	TGTTAA	2	12	91952	91963	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014222	AATAAA	2	12	98193	98204	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014222	ATAAAA	3	18	102278	102295	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014222	TAAAAT	2	12	103482	103493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014222	TTAAAA	2	12	103538	103549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014222	TTTGTT	2	12	112349	112360	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014222	TTATAT	2	12	113036	113047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014222	TAAAAA	2	12	120716	120727	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014222	TTTAAA	2	12	121439	121450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014222	TTTAAT	2	12	126840	126851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014222	ATAAAA	2	12	137641	137652	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014222	ATAATT	2	12	145722	145733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014222	GATATT	2	12	154710	154721	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014222	TGTGTA	2	12	154953	154964	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014222	AAATTT	2	12	170908	170919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014222	ATTTTA	2	12	176591	176602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014222	TAAAAA	2	12	176890	176901	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014222	TAAAAA	3	18	178338	178355	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014222	AATTTA	2	12	180694	180705	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014222	TTTAAA	2	12	180779	180790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014222	ATTAAA	2	12	181882	181893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014222	ATTTTT	2	12	186812	186823	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014222	AATCTC	2	12	190341	190352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_014222	TGTAAT	2	12	191188	191199	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014222	AAATTA	2	12	194423	194434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014222	ATTAAT	2	12	196874	196885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014222	TTTAAA	2	12	204363	204374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014222	TTAAAA	2	12	204419	204430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014222	TAAATT	2	12	215610	215621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014222	ATTATG	2	12	229613	229624	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014222	ATATAA	2	12	229811	229822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014222	ATAAAA	2	12	237666	237677	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014222	AAATAA	2	12	258088	258099	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014222	AATTTT	2	12	267707	267718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014222	ATTTTT	2	12	269333	269344	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014222	TTTTAT	2	12	271934	271945	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014222	TTTGAA	2	12	275008	275019	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014222	AATTTA	2	12	300519	300530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014222	TAAAAA	2	12	307463	307474	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014222	TTTAAT	3	18	307965	307982	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014222	TTTTAA	2	12	307993	308004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014222	ATAATT	2	12	310665	310676	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014222	TAAAAA	2	12	311733	311744	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014222	TTAAAT	2	12	312794	312805	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014222	AAAAAC	2	12	314812	314823	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_014222	ATTTTT	4	24	319890	319913	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014222	CATTAT	2	12	323551	323562	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_014222	TGAAAT	2	12	340258	340269	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014222	GTTTCA	2	12	341852	341863	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_014222	TCGTTA	2	12	351858	351869	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_014222	AAAATA	2	12	363434	363445	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014222	AAATAA	2	12	364464	364475	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014222	TTAAAA	2	12	364974	364985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014222	AATTAA	2	12	365008	365019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014222	TTATTT	3	18	365108	365125	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014222	TTAATT	2	12	365917	365928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014222	TTTGAT	2	12	368328	368339	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014222	TTTATC	2	12	371532	371543	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_014222	TATTTT	4	24	372490	372513	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014222	ATTTAA	2	12	382318	382329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014222	CATTTG	2	12	385348	385359	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_014222	TAATAT	2	12	388025	388036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014222	ATTTTT	2	12	389120	389131	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014222	ATATGA	3	18	392434	392451	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014222	AATTAT	2	12	395149	395160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014222	AAAAAC	2	12	398118	398129	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_014222	TAAAAT	2	12	399160	399171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014222	TTAAAA	2	12	399172	399183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014222	TTAAAA	2	12	399185	399196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014222	AAAAGA	2	12	400178	400189	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014222	AAATAA	2	12	401619	401630	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014222	ATAATT	2	12	402185	402196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014222	TTTAAA	2	12	404086	404097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014222	TAAACT	4	24	411890	411913	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_014222	TATTTT	2	12	414644	414655	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014222	ATGTTA	2	12	415735	415746	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014222	TATTTT	2	12	423157	423168	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014222	AATTTA	2	12	427216	427227	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014222	TAAATT	2	12	429272	429283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014222	AATTAA	2	12	435431	435442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014222	TTTAAT	2	12	440038	440049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014222	TTAAAT	2	12	452519	452530	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014222	TTATTT	2	12	455372	455383	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014222	AATAAA	2	12	459993	460004	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014222	GTATTA	2	12	460673	460684	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014222	TTTTAA	2	12	465113	465124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014222	ATTTTT	2	12	473288	473299	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014222	ATTTAA	2	12	489413	489424	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014222	TAAAAA	2	12	489616	489627	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014222	TAAAAT	2	12	489645	489656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014222	TTTTCG	2	12	491705	491716	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_014222	TTTTCG	2	12	517615	517626	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_014222	GGTTAG	2	12	517777	517788	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014222	TTAGGT	2	12	517980	517991	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014222	AATTTT	2	12	524788	524799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014222	TATCAA	2	12	538686	538697	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_014222	TTGCAA	2	12	582059	582070	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_014222	TTTTCG	2	12	582534	582545	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_014222	GTCCAA	2	12	586268	586279	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_014222	CAAAAA	2	12	587355	587366	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_014222	CATATT	2	12	591237	591248	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_014222	TAAAAA	2	12	620222	620233	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014222	ATATCT	2	12	622631	622642	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_014222	TTTATT	2	12	631462	631473	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014222	ATATTA	2	12	644757	644768	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014222	AAATTA	2	12	644769	644780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014222	AATATA	2	12	645720	645731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014222	TTATTT	2	12	646281	646292	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014222	TTTTAT	2	12	647555	647566	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014222	TATGTA	2	12	649160	649171	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014222	TTTAAA	2	12	657353	657364	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014222	TCAAAT	2	12	660854	660865	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_014222	TTTTAT	2	12	670622	670633	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014222	TTATTT	2	12	672069	672080	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014222	TATATT	2	12	672101	672112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014222	ATAATT	2	12	675881	675892	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014222	ATTAAA	2	12	682108	682119	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014222	ATAAAT	2	12	687438	687449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014222	TTTAAA	2	12	689636	689647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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265	NC_014222	TTACTT	2	12	1108398	1108409	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
266	NC_014222	AATAAA	2	12	1112500	1112511	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
267	NC_014222	TATTAA	2	12	1114770	1114781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_014222	TTTAAT	2	12	1117479	1117490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
269	NC_014222	ATTTTA	2	12	1120075	1120086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
270	NC_014222	TATTAA	2	12	1121455	1121466	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
271	NC_014222	AATTAA	3	18	1121467	1121484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_014222	ATTAAT	2	12	1125547	1125558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_014222	AAATTT	2	12	1127814	1127825	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_014222	TAAAAC	2	12	1130274	1130285	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
275	NC_014222	TTTTAT	2	12	1130989	1131000	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_014222	TTAAAT	3	18	1133055	1133072	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_014222	GTAATA	2	12	1172338	1172349	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_014222	ATAAAA	2	12	1178682	1178693	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_014222	CTAATT	2	12	1194980	1194991	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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289	NC_014222	ATTTTT	2	12	1213862	1213873	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_014222	ATTATA	2	12	1219284	1219295	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_014222	GCTATT	2	12	1223641	1223652	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
292	NC_014222	TATAAA	2	12	1223842	1223853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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294	NC_014222	ATTTTT	2	12	1249742	1249753	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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297	NC_014222	TTATAA	2	12	1267070	1267081	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
298	NC_014222	TAAAAA	2	12	1267718	1267729	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
299	NC_014222	TTTATT	3	18	1288511	1288528	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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389	NC_014222	TATATT	2	12	1669611	1669622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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391	NC_014222	ATTTAA	2	12	1673230	1673241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
392	NC_014222	TTTTAA	2	12	1675090	1675101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
393	NC_014222	TTAACT	2	12	1678694	1678705	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
394	NC_014222	TAATAT	2	12	1682410	1682421	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
395	NC_014222	TATAAT	2	12	1685522	1685533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
396	NC_014222	ACCAAA	2	12	1686198	1686209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
397	NC_014222	ATTTAA	2	12	1686388	1686399	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
398	NC_014222	ATTTTT	2	12	1691843	1691854	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
399	NC_014222	TCAAAA	2	12	1695098	1695109	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
400	NC_014222	TATGTT	2	12	1700720	1700731	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
401	NC_014222	AATTTA	2	12	1715457	1715468	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
402	NC_014222	GTGAGC	2	12	1722511	1722522	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
403	NC_014222	AATAAA	2	12	1733826	1733837	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
404	NC_014222	AAATAT	2	12	1735273	1735284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
405	NC_014222	TAAAAA	2	12	1735319	1735330	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
406	NC_014222	ATATTT	2	12	1742205	1742216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
407	NC_014222	AAAAAT	3	18	1743228	1743245	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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409	NC_014222	TTTATT	2	12	1749861	1749872	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
410	NC_014222	ATTTTT	2	12	1761222	1761233	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
411	NC_014222	TAATAT	2	12	1761758	1761769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
412	NC_014222	ATTTTA	3	18	1761777	1761794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
413	NC_014222	TAATTT	2	12	1761826	1761837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
414	NC_014222	ATTTTT	2	12	1770557	1770568	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
415	NC_014222	TATTTT	2	12	1778645	1778656	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
416	NC_014222	AATATT	2	12	1785291	1785302	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
417	NC_014222	ATTGTA	2	12	1785357	1785368	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
418	NC_014222	TTAATT	2	12	1793096	1793107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
419	NC_014222	TTTAAA	2	12	1793647	1793658	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
420	NC_014222	TTAAAT	2	12	1808423	1808434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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422	NC_014222	TATTTT	2	12	1815441	1815452	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
423	NC_014222	AATTTA	2	12	1816642	1816653	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
424	NC_014222	TTTATA	2	12	1819372	1819383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
425	NC_014222	TTTAAT	2	12	1819540	1819551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
426	NC_014222	ACATAA	2	12	1822210	1822221	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
427	NC_014222	TATAAA	2	12	1824686	1824697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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432	NC_014222	TTTAAA	2	12	1863107	1863118	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
433	NC_014222	TGTATT	2	12	1868468	1868479	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.