MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Syntrophothermus lipocalidus DSM 12680 chromosome

Total Repeats: 1245

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014220	ACTCC	2	10	4385	4394	20 %	20 %	0 %	60 %	297616219
2	NC_014220	TCCTA	2	10	4888	4897	20 %	40 %	0 %	40 %	297616219
3	NC_014220	CCAAA	2	10	5093	5102	60 %	0 %	0 %	40 %	297616219
4	NC_014220	CGATG	2	10	6482	6491	20 %	20 %	40 %	20 %	297616220
5	NC_014220	TTTGA	2	10	7461	7470	20 %	60 %	20 %	0 %	297616220
6	NC_014220	AAGAA	2	10	9584	9593	80 %	0 %	20 %	0 %	297616221
7	NC_014220	GCCAA	2	10	10540	10549	40 %	0 %	20 %	40 %	297616223
8	NC_014220	GCTGG	2	10	12391	12400	0 %	20 %	60 %	20 %	297616224
9	NC_014220	AGCAA	2	10	20798	20807	60 %	0 %	20 %	20 %	297616231
10	NC_014220	CCAGG	2	10	22891	22900	20 %	0 %	40 %	40 %	297616233
11	NC_014220	TGACG	2	10	28160	28169	20 %	20 %	40 %	20 %	297616237
12	NC_014220	CAGTT	2	10	28377	28386	20 %	40 %	20 %	20 %	297616237
13	NC_014220	TAAAC	2	10	31376	31385	60 %	20 %	0 %	20 %	297616238
14	NC_014220	GTGAA	2	10	34396	34405	40 %	20 %	40 %	0 %	297616241
15	NC_014220	GGCAA	2	10	36669	36678	40 %	0 %	40 %	20 %	297616243
16	NC_014220	CTATC	2	10	39951	39960	20 %	40 %	0 %	40 %	297616247
17	NC_014220	GCTTC	2	10	40480	40489	0 %	40 %	20 %	40 %	297616247
18	NC_014220	AGTTC	2	10	40870	40879	20 %	40 %	20 %	20 %	297616247
19	NC_014220	CCTCA	2	10	41959	41968	20 %	20 %	0 %	60 %	297616249
20	NC_014220	GTGGG	2	10	43456	43465	0 %	20 %	80 %	0 %	297616252
21	NC_014220	AACGT	2	10	53805	53814	40 %	20 %	20 %	20 %	297616258
22	NC_014220	TGGGC	2	10	54603	54612	0 %	20 %	60 %	20 %	297616258
23	NC_014220	CGGAT	2	10	55821	55830	20 %	20 %	40 %	20 %	297616259
24	NC_014220	GAGAA	2	10	56254	56263	60 %	0 %	40 %	0 %	297616260
25	NC_014220	TTTTA	2	10	57773	57782	20 %	80 %	0 %	0 %	297616262
26	NC_014220	GTGCT	2	10	57917	57926	0 %	40 %	40 %	20 %	297616262
27	NC_014220	GTTTT	2	10	59488	59497	0 %	80 %	20 %	0 %	297616265
28	NC_014220	GTTTG	2	10	61225	61234	0 %	60 %	40 %	0 %	297616267
29	NC_014220	CCTTA	2	10	63137	63146	20 %	40 %	0 %	40 %	297616268
30	NC_014220	GGGCA	2	10	64866	64875	20 %	0 %	60 %	20 %	297616270
31	NC_014220	AAACA	2	10	65543	65552	80 %	0 %	0 %	20 %	297616271
32	NC_014220	ACATA	2	10	65934	65943	60 %	20 %	0 %	20 %	297616271
33	NC_014220	GGGAT	2	10	66672	66681	20 %	20 %	60 %	0 %	297616273
34	NC_014220	ATGGG	2	10	81145	81154	20 %	20 %	60 %	0 %	297616282
35	NC_014220	ATTTT	2	10	82455	82464	20 %	80 %	0 %	0 %	297616284
36	NC_014220	AGATA	2	10	82632	82641	60 %	20 %	20 %	0 %	297616285
37	NC_014220	TTCCG	2	10	86666	86675	0 %	40 %	20 %	40 %	297616290
38	NC_014220	TGGTT	2	10	93547	93556	0 %	60 %	40 %	0 %	297616294
39	NC_014220	TTTAT	2	10	95662	95671	20 %	80 %	0 %	0 %	297616296
40	NC_014220	TCCGT	2	10	96458	96467	0 %	40 %	20 %	40 %	297616297
41	NC_014220	TTCGA	2	10	98448	98457	20 %	40 %	20 %	20 %	297616299
42	NC_014220	TTTGG	2	10	98497	98506	0 %	60 %	40 %	0 %	297616299
43	NC_014220	ACCTG	2	10	99479	99488	20 %	20 %	20 %	40 %	297616299
44	NC_014220	ACGGG	2	10	100461	100470	20 %	0 %	60 %	20 %	297616300
45	NC_014220	GACCA	2	10	101498	101507	40 %	0 %	20 %	40 %	297616301
46	NC_014220	GGCAG	2	10	105131	105140	20 %	0 %	60 %	20 %	297616304
47	NC_014220	GGCGG	2	10	106303	106312	0 %	0 %	80 %	20 %	297616305
48	NC_014220	TGGCT	2	10	112806	112815	0 %	40 %	40 %	20 %	297616312
49	NC_014220	AGGGC	2	10	113188	113197	20 %	0 %	60 %	20 %	297616312
50	NC_014220	GTTGG	2	10	118830	118839	0 %	40 %	60 %	0 %	297616316
51	NC_014220	GTGAG	2	10	120511	120520	20 %	20 %	60 %	0 %	297616317
52	NC_014220	GTTGG	2	10	124304	124313	0 %	40 %	60 %	0 %	297616326
53	NC_014220	TCCGG	2	10	124361	124370	0 %	20 %	40 %	40 %	297616326
54	NC_014220	TCTTT	2	10	125317	125326	0 %	80 %	0 %	20 %	297616326
55	NC_014220	CTGAC	2	10	130268	130277	20 %	20 %	20 %	40 %	297616331
56	NC_014220	CCGGG	2	10	133902	133911	0 %	0 %	60 %	40 %	297616332
57	NC_014220	TCGGG	2	10	135661	135670	0 %	20 %	60 %	20 %	297616333
58	NC_014220	CGCAT	2	10	139030	139039	20 %	20 %	20 %	40 %	297616336
59	NC_014220	CGGAG	2	10	140592	140601	20 %	0 %	60 %	20 %	297616337
60	NC_014220	GCAGA	2	10	146240	146249	40 %	0 %	40 %	20 %	297616345
61	NC_014220	TGTTT	2	10	146662	146671	0 %	80 %	20 %	0 %	297616345
62	NC_014220	TCGAT	2	10	147518	147527	20 %	40 %	20 %	20 %	297616346
63	NC_014220	CAGGA	2	10	151727	151736	40 %	0 %	40 %	20 %	297616350
64	NC_014220	GATCC	2	10	152681	152690	20 %	20 %	20 %	40 %	297616351
65	NC_014220	CAAGA	2	10	153910	153919	60 %	0 %	20 %	20 %	297616352
66	NC_014220	CGGTA	2	10	155859	155868	20 %	20 %	40 %	20 %	297616354
67	NC_014220	GGCAA	2	10	156114	156123	40 %	0 %	40 %	20 %	297616354
68	NC_014220	TGTCC	2	10	171591	171600	0 %	40 %	20 %	40 %	297616366
69	NC_014220	ATCGG	2	10	173429	173438	20 %	20 %	40 %	20 %	297616367
70	NC_014220	AAAAG	2	10	174932	174941	80 %	0 %	20 %	0 %	297616368
71	NC_014220	TGCGC	2	10	176831	176840	0 %	20 %	40 %	40 %	297616370
72	NC_014220	GCTGA	2	10	177314	177323	20 %	20 %	40 %	20 %	297616370
73	NC_014220	TTTCG	2	10	177607	177616	0 %	60 %	20 %	20 %	297616370
74	NC_014220	AAAAG	2	10	180434	180443	80 %	0 %	20 %	0 %	297616373
75	NC_014220	CAGGC	2	10	187480	187489	20 %	0 %	40 %	40 %	297616378
76	NC_014220	CTTGA	2	10	188467	188476	20 %	40 %	20 %	20 %	297616379
77	NC_014220	ATATC	2	10	188594	188603	40 %	40 %	0 %	20 %	297616379
78	NC_014220	AAACC	2	10	189303	189312	60 %	0 %	0 %	40 %	297616380
79	NC_014220	CACGT	2	10	191782	191791	20 %	20 %	20 %	40 %	297616383
80	NC_014220	ATACC	2	10	192107	192116	40 %	20 %	0 %	40 %	297616384
81	NC_014220	GCCGT	2	10	198745	198754	0 %	20 %	40 %	40 %	297616394
82	NC_014220	GAGTG	2	10	205794	205803	20 %	20 %	60 %	0 %	297616401
83	NC_014220	GTCCT	2	10	207266	207275	0 %	40 %	20 %	40 %	297616403
84	NC_014220	GTCCT	2	10	208357	208366	0 %	40 %	20 %	40 %	297616403
85	NC_014220	TCGAG	2	10	209080	209089	20 %	20 %	40 %	20 %	297616404
86	NC_014220	AGGAA	2	10	209442	209451	60 %	0 %	40 %	0 %	297616404
87	NC_014220	GCTGG	2	10	212535	212544	0 %	20 %	60 %	20 %	297616405
88	NC_014220	CTTCG	2	10	218199	218208	0 %	40 %	20 %	40 %	297616412
89	NC_014220	TATGA	2	10	219098	219107	40 %	40 %	20 %	0 %	297616413
90	NC_014220	TCATC	2	10	219241	219250	20 %	40 %	0 %	40 %	297616413
91	NC_014220	ACCAA	2	10	220508	220517	60 %	0 %	0 %	40 %	297616415
92	NC_014220	CGAAT	2	10	221848	221857	40 %	20 %	20 %	20 %	297616417
93	NC_014220	CGAAA	2	10	221924	221933	60 %	0 %	20 %	20 %	297616417
94	NC_014220	CCCTA	2	10	229388	229397	20 %	20 %	0 %	60 %	297616422
95	NC_014220	CAGAA	2	10	229562	229571	60 %	0 %	20 %	20 %	297616422
96	NC_014220	CCAGG	2	10	233657	233666	20 %	0 %	40 %	40 %	297616427
97	NC_014220	CACCG	2	10	234086	234095	20 %	0 %	20 %	60 %	297616427
98	NC_014220	CACAT	2	10	234278	234287	40 %	20 %	0 %	40 %	297616427
99	NC_014220	GGCCA	2	10	236384	236393	20 %	0 %	40 %	40 %	297616429
100	NC_014220	AGGCC	2	10	236470	236479	20 %	0 %	40 %	40 %	297616429
101	NC_014220	CCCCG	2	10	238086	238095	0 %	0 %	20 %	80 %	297616429
102	NC_014220	CAGGC	2	10	238730	238739	20 %	0 %	40 %	40 %	297616430
103	NC_014220	CGGGG	2	10	244781	244790	0 %	0 %	80 %	20 %	297616437
104	NC_014220	CGGTG	2	10	248010	248019	0 %	20 %	60 %	20 %	297616439
105	NC_014220	TTCTT	2	10	249976	249985	0 %	80 %	0 %	20 %	297616443
106	NC_014220	TTTCC	2	10	252086	252095	0 %	60 %	0 %	40 %	297616446
107	NC_014220	AGCAG	2	10	252380	252389	40 %	0 %	40 %	20 %	297616446
108	NC_014220	GGAAG	2	10	253111	253120	40 %	0 %	60 %	0 %	297616447
109	NC_014220	CTACT	2	10	255214	255223	20 %	40 %	0 %	40 %	297616450
110	NC_014220	CCTGG	2	10	255817	255826	0 %	20 %	40 %	40 %	297616450
111	NC_014220	ACGGG	2	10	255954	255963	20 %	0 %	60 %	20 %	297616450
112	NC_014220	ACCTG	2	10	256388	256397	20 %	20 %	20 %	40 %	297616451
113	NC_014220	TCGCT	2	10	257341	257350	0 %	40 %	20 %	40 %	297616451
114	NC_014220	CAGTA	2	10	258223	258232	40 %	20 %	20 %	20 %	297616452
115	NC_014220	GGTGC	2	10	258851	258860	0 %	20 %	60 %	20 %	297616452
116	NC_014220	GGGGT	2	10	261450	261459	0 %	20 %	80 %	0 %	297616454
117	NC_014220	GAAGA	2	10	261747	261756	60 %	0 %	40 %	0 %	297616454
118	NC_014220	TGCTG	2	10	261895	261904	0 %	40 %	40 %	20 %	297616454
119	NC_014220	TTTCT	2	10	263848	263857	0 %	80 %	0 %	20 %	297616456
120	NC_014220	GTTTG	2	10	264148	264157	0 %	60 %	40 %	0 %	297616456
121	NC_014220	GCAAA	2	10	264796	264805	60 %	0 %	20 %	20 %	297616457
122	NC_014220	CCTGG	2	10	267077	267086	0 %	20 %	40 %	40 %	297616460
123	NC_014220	TCAGG	2	10	267979	267988	20 %	20 %	40 %	20 %	297616461
124	NC_014220	TTTGG	2	10	271424	271433	0 %	60 %	40 %	0 %	297616463
125	NC_014220	GGTCA	2	10	272601	272610	20 %	20 %	40 %	20 %	297616463
126	NC_014220	TGAGG	2	10	272960	272969	20 %	20 %	60 %	0 %	297616463
127	NC_014220	TGCTT	2	10	273188	273197	0 %	60 %	20 %	20 %	297616463
128	NC_014220	GGAGC	2	10	274040	274049	20 %	0 %	60 %	20 %	297616464
129	NC_014220	TCTCT	2	10	274655	274664	0 %	60 %	0 %	40 %	297616464
130	NC_014220	AGGAC	2	10	275391	275400	40 %	0 %	40 %	20 %	297616465
131	NC_014220	GTTCC	2	10	276482	276491	0 %	40 %	20 %	40 %	297616466
132	NC_014220	AGGAC	2	10	277610	277619	40 %	0 %	40 %	20 %	297616468
133	NC_014220	AAGGG	2	10	281214	281223	40 %	0 %	60 %	0 %	297616472
134	NC_014220	CGGTG	2	10	283528	283537	0 %	20 %	60 %	20 %	297616474
135	NC_014220	GCGAT	2	10	287966	287975	20 %	20 %	40 %	20 %	297616476
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