MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Syntrophothermus lipocalidus DSM 12680 chromosome

Total Repeats: 5565

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014220	AACA	2	8	774	781	75 %	0 %	0 %	25 %	297616215
2	NC_014220	CATA	2	8	961	968	50 %	25 %	0 %	25 %	297616215
3	NC_014220	CCAA	2	8	1042	1049	50 %	0 %	0 %	50 %	297616215
4	NC_014220	ACAG	2	8	1432	1439	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014220	TAAG	2	8	1506	1513	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014220	TTCT	2	8	1634	1641	0 %	75 %	0 %	25 %	297616216
7	NC_014220	TTTC	2	8	2537	2544	0 %	75 %	0 %	25 %	297616216
8	NC_014220	AGCG	2	8	2698	2705	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_014220	AAAC	2	8	2822	2829	75 %	0 %	0 %	25 %	297616217
10	NC_014220	TTAC	2	8	2933	2940	25 %	50 %	0 %	25 %	297616217
11	NC_014220	GTAT	2	8	3375	3382	25 %	50 %	25 %	0 %	297616217
12	NC_014220	AAGA	2	8	4154	4161	75 %	0 %	25 %	0 %	297616219
13	NC_014220	AGGA	2	8	4918	4925	50 %	0 %	50 %	0 %	297616219
14	NC_014220	AACT	2	8	5260	5267	50 %	25 %	0 %	25 %	297616219
15	NC_014220	AGAA	2	8	5271	5278	75 %	0 %	25 %	0 %	297616219
16	NC_014220	ATAA	2	8	5541	5548	75 %	25 %	0 %	0 %	297616219
17	NC_014220	TGAC	2	8	5575	5582	25 %	25 %	25 %	25 %	297616219
18	NC_014220	TTGC	2	8	6086	6093	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014220	AGGA	2	8	6153	6160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014220	AGAA	2	8	6265	6272	75 %	0 %	25 %	0 %	297616220
21	NC_014220	AAAG	2	8	6974	6981	75 %	0 %	25 %	0 %	297616220
22	NC_014220	GACG	2	8	7669	7676	25 %	0 %	50 %	25 %	297616220
23	NC_014220	AGTT	2	8	8161	8168	25 %	50 %	25 %	0 %	297616220
24	NC_014220	AAGG	2	8	8334	8341	50 %	0 %	50 %	0 %	297616220
25	NC_014220	TCGC	2	8	8626	8633	0 %	25 %	25 %	50 %	297616220
26	NC_014220	GTTG	2	8	9215	9222	0 %	50 %	50 %	0 %	297616221
27	NC_014220	CGTA	2	8	9482	9489	25 %	25 %	25 %	25 %	297616221
28	NC_014220	TGGA	2	8	10038	10045	25 %	25 %	50 %	0 %	297616222
29	NC_014220	GATG	2	8	10421	10428	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014220	GGTG	2	8	10938	10945	0 %	25 %	75 %	0 %	297616223
31	NC_014220	GGCT	2	8	11069	11076	0 %	25 %	50 %	25 %	297616223
32	NC_014220	AGAA	2	8	12839	12846	75 %	0 %	25 %	0 %	297616224
33	NC_014220	AAAG	2	8	13221	13228	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014220	GGAA	2	8	13447	13454	50 %	0 %	50 %	0 %	297616225
35	NC_014220	ACGA	2	8	13460	13467	50 %	0 %	25 %	25 %	297616225
36	NC_014220	AACC	2	8	13963	13970	50 %	0 %	0 %	50 %	297616225
37	NC_014220	ACGG	2	8	14604	14611	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
38	NC_014220	AAAG	2	8	14743	14750	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014220	CCGC	2	8	15287	15294	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
40	NC_014220	AGCC	2	8	16604	16611	25 %	0 %	25 %	50 %	297616228
41	NC_014220	AATT	2	8	16924	16931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014220	TACT	2	8	17115	17122	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014220	TGGT	2	8	17200	17207	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014220	GAGG	2	8	17729	17736	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014220	AGCA	2	8	17743	17750	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_014220	ACCA	2	8	17947	17954	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_014220	GCCG	2	8	17965	17972	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_014220	AGTA	2	8	18152	18159	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014220	GAAA	2	8	19502	19509	75 %	0 %	25 %	0 %	297616229
50	NC_014220	TATT	2	8	19701	19708	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014220	TTTC	2	8	19964	19971	0 %	75 %	0 %	25 %	297616230
52	NC_014220	TTGT	2	8	20971	20978	0 %	75 %	25 %	0 %	297616231
53	NC_014220	GTCT	2	8	21493	21500	0 %	50 %	25 %	25 %	297616232
54	NC_014220	AGGT	2	8	22036	22043	25 %	25 %	50 %	0 %	297616232
55	NC_014220	TTCC	2	8	22511	22518	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_014220	GCTG	2	8	23197	23204	0 %	25 %	50 %	25 %	297616233
57	NC_014220	CGGT	2	8	23949	23956	0 %	25 %	50 %	25 %	297616234
58	NC_014220	CTGG	2	8	24152	24159	0 %	25 %	50 %	25 %	297616234
59	NC_014220	GCCC	2	8	24306	24313	0 %	0 %	25 %	75 %	297616234
60	NC_014220	CAGC	2	8	25177	25184	25 %	0 %	25 %	50 %	297616235
61	NC_014220	AGCA	2	8	25811	25818	50 %	0 %	25 %	25 %	297616235
62	NC_014220	GACC	2	8	25849	25856	25 %	0 %	25 %	50 %	297616235
63	NC_014220	GCGA	2	8	26829	26836	25 %	0 %	50 %	25 %	297616236
64	NC_014220	GGCC	2	8	27404	27411	0 %	0 %	50 %	50 %	297616236
65	NC_014220	AGGA	2	8	27524	27531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014220	CCTG	2	8	27836	27843	0 %	25 %	25 %	50 %	297616237
67	NC_014220	ACCC	2	8	28021	28028	25 %	0 %	0 %	75 %	297616237
68	NC_014220	CAGC	2	8	29112	29119	25 %	0 %	25 %	50 %	297616238
69	NC_014220	GTCA	2	8	29902	29909	25 %	25 %	25 %	25 %	297616238
70	NC_014220	CATA	2	8	30256	30263	50 %	25 %	0 %	25 %	297616238
71	NC_014220	CTTT	2	8	30447	30454	0 %	75 %	0 %	25 %	297616238
72	NC_014220	CGGC	2	8	30926	30933	0 %	0 %	50 %	50 %	297616238
73	NC_014220	GGTC	2	8	31170	31177	0 %	25 %	50 %	25 %	297616238
74	NC_014220	AGCG	2	8	32017	32024	25 %	0 %	50 %	25 %	297616238
75	NC_014220	TTTA	2	8	32445	32452	25 %	75 %	0 %	0 %	297616239
76	NC_014220	GAAC	2	8	32641	32648	50 %	0 %	25 %	25 %	297616240
77	NC_014220	AGAC	2	8	33964	33971	50 %	0 %	25 %	25 %	297616241
78	NC_014220	GGGA	2	8	34545	34552	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014220	GAAC	2	8	35003	35010	50 %	0 %	25 %	25 %	297616242
80	NC_014220	CTAG	2	8	35639	35646	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_014220	CAGG	2	8	36660	36667	25 %	0 %	50 %	25 %	297616243
82	NC_014220	GCTG	2	8	36735	36742	0 %	25 %	50 %	25 %	297616243
83	NC_014220	GCTG	2	8	37706	37713	0 %	25 %	50 %	25 %	297616246
84	NC_014220	TGGT	2	8	37878	37885	0 %	50 %	50 %	0 %	297616246
85	NC_014220	GGTT	2	8	37896	37903	0 %	50 %	50 %	0 %	297616246
86	NC_014220	AACG	2	8	38480	38487	50 %	0 %	25 %	25 %	297616246
87	NC_014220	TGGA	2	8	39260	39267	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014220	ATTA	2	8	39320	39327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014220	GGCG	2	8	40471	40478	0 %	0 %	75 %	25 %	297616247
90	NC_014220	AAGG	2	8	40918	40925	50 %	0 %	50 %	0 %	297616247
91	NC_014220	AAGC	2	8	41022	41029	50 %	0 %	25 %	25 %	297616248
92	NC_014220	CTCA	2	8	41567	41574	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_014220	GGCG	2	8	41892	41899	0 %	0 %	75 %	25 %	297616249
94	NC_014220	GAAC	2	8	41914	41921	50 %	0 %	25 %	25 %	297616249
95	NC_014220	TGGA	2	8	42068	42075	25 %	25 %	50 %	0 %	297616249
96	NC_014220	TCTT	2	8	42437	42444	0 %	75 %	0 %	25 %	297616250
97	NC_014220	GGTG	2	8	43523	43530	0 %	25 %	75 %	0 %	297616252
98	NC_014220	GGAT	2	8	44512	44519	25 %	25 %	50 %	0 %	297616253
99	NC_014220	CGGT	2	8	44814	44821	0 %	25 %	50 %	25 %	297616253
100	NC_014220	CCTG	2	8	45510	45517	0 %	25 %	25 %	50 %	297616254
101	NC_014220	CGGG	2	8	45543	45550	0 %	0 %	75 %	25 %	297616254
102	NC_014220	AGAC	2	8	45760	45767	50 %	0 %	25 %	25 %	297616254
103	NC_014220	GCGG	3	12	46076	46087	0 %	0 %	75 %	25 %	297616255
104	NC_014220	ATAG	2	8	46667	46674	50 %	25 %	25 %	0 %	297616256
105	NC_014220	TGAG	2	8	47183	47190	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014220	GGAT	2	8	48752	48759	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014220	AGCG	2	8	49046	49053	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_014220	GCGA	2	8	49206	49213	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
109	NC_014220	ATGA	2	8	50722	50729	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014220	AGGC	2	8	51072	51079	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_014220	GTAT	2	8	51501	51508	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014220	GCGA	2	8	51640	51647	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
113	NC_014220	GGGA	2	8	52100	52107	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014220	CTGA	2	8	52756	52763	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_014220	ATAA	2	8	52951	52958	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014220	GGGA	2	8	53709	53716	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014220	TTTC	2	8	53989	53996	0 %	75 %	0 %	25 %	297616258
118	NC_014220	CGTT	2	8	54086	54093	0 %	50 %	25 %	25 %	297616258
119	NC_014220	GGCA	2	8	54969	54976	25 %	0 %	50 %	25 %	297616258
120	NC_014220	GATG	2	8	55372	55379	25 %	25 %	50 %	0 %	297616259
121	NC_014220	CGGG	2	8	55612	55619	0 %	0 %	75 %	25 %	297616259
122	NC_014220	CGAC	2	8	55926	55933	25 %	0 %	25 %	50 %	297616259
123	NC_014220	TGGC	2	8	56736	56743	0 %	25 %	50 %	25 %	297616261
124	NC_014220	ACGG	2	8	57082	57089	25 %	0 %	50 %	25 %	297616261
125	NC_014220	AGGC	2	8	57586	57593	25 %	0 %	50 %	25 %	297616262
126	NC_014220	AGGC	2	8	57644	57651	25 %	0 %	50 %	25 %	297616262
127	NC_014220	ATGA	2	8	58110	58117	50 %	25 %	25 %	0 %	297616262
128	NC_014220	ACGG	2	8	58300	58307	25 %	0 %	50 %	25 %	297616263
129	NC_014220	GAAA	2	8	58430	58437	75 %	0 %	25 %	0 %	297616264
130	NC_014220	GCAG	2	8	58519	58526	25 %	0 %	50 %	25 %	297616264
131	NC_014220	GCTT	2	8	59965	59972	0 %	50 %	25 %	25 %	297616266
132	NC_014220	TCCC	2	8	60215	60222	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
133	NC_014220	TTCT	2	8	60685	60692	0 %	75 %	0 %	25 %	297616267
134	NC_014220	CCTT	2	8	61383	61390	0 %	50 %	0 %	50 %	297616267
135	NC_014220	GATG	2	8	61542	61549	25 %	25 %	50 %	0 %	297616267
136	NC_014220	GGCT	2	8	62435	62442	0 %	25 %	50 %	25 %	297616267
137	NC_014220	AGCT	2	8	63207	63214	25 %	25 %	25 %	25 %	297616268
138	NC_014220	AAGC	2	8	63523	63530	50 %	0 %	25 %	25 %	297616269
139	NC_014220	AGCT	2	8	63531	63538	25 %	25 %	25 %	25 %	297616269
140	NC_014220	TGGC	2	8	63542	63549	0 %	25 %	50 %	25 %	297616269
141	NC_014220	CTGG	2	8	63589	63596	0 %	25 %	50 %	25 %	297616269
142	NC_014220	CAAA	2	8	63649	63656	75 %	0 %	0 %	25 %	297616269
143	NC_014220	TACT	2	8	63810	63817	25 %	50 %	0 %	25 %	297616269
144	NC_014220	GATG	2	8	65211	65218	25 %	25 %	50 %	0 %	297616271
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