MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Syntrophothermus lipocalidus DSM 12680 chromosome

Total Repeats: 943

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014220	ACAG	2	8	1432	1439	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014220	TAAG	2	8	1506	1513	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014220	AGCG	2	8	2698	2705	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_014220	TTGC	2	8	6086	6093	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014220	AGGA	2	8	6153	6160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014220	GATG	2	8	10421	10428	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014220	AAAG	2	8	13221	13228	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014220	ACGG	2	8	14604	14611	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_014220	AAAG	2	8	14743	14750	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014220	CCGC	2	8	15287	15294	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11	NC_014220	AATT	2	8	16924	16931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014220	TACT	2	8	17115	17122	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014220	TGGT	2	8	17200	17207	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014220	GAGG	2	8	17729	17736	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014220	AGCA	2	8	17743	17750	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014220	ACCA	2	8	17947	17954	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014220	GCCG	2	8	17965	17972	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_014220	AGTA	2	8	18152	18159	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014220	TATT	2	8	19701	19708	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014220	TTCC	2	8	22511	22518	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_014220	AGGA	2	8	27524	27531	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014220	GGGA	2	8	34545	34552	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014220	CTAG	2	8	35639	35646	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014220	TGGA	2	8	39260	39267	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014220	ATTA	2	8	39320	39327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014220	CTCA	2	8	41567	41574	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_014220	TGAG	2	8	47183	47190	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014220	GGAT	2	8	48752	48759	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014220	AGCG	2	8	49046	49053	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_014220	GCGA	2	8	49206	49213	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014220	ATGA	2	8	50722	50729	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014220	AGGC	2	8	51072	51079	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_014220	GTAT	2	8	51501	51508	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014220	GCGA	2	8	51640	51647	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_014220	GGGA	2	8	52100	52107	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014220	CTGA	2	8	52756	52763	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_014220	ATAA	2	8	52951	52958	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014220	GGGA	2	8	53709	53716	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014220	TCCC	2	8	60215	60222	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
40	NC_014220	ATTT	2	8	67698	67705	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014220	AAAG	2	8	67886	67893	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014220	CGGA	2	8	68586	68593	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014220	GAAA	2	8	70564	70571	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014220	AGGC	2	8	70922	70929	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_014220	CGCC	2	8	71438	71445	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
46	NC_014220	AGCG	2	8	71699	71706	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_014220	GCGA	2	8	73506	73513	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_014220	CTGG	2	8	78202	78209	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014220	ACAA	2	8	78427	78434	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_014220	CTTT	2	8	78568	78575	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_014220	GTTC	2	8	79624	79631	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_014220	AGGT	2	8	79885	79892	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014220	GTCT	2	8	80544	80551	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_014220	GAAA	2	8	86040	86047	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014220	TTTC	2	8	86881	86888	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_014220	ATAA	2	8	89252	89259	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014220	GAAG	2	8	90582	90589	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014220	GGAA	2	8	90706	90713	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014220	TCGT	2	8	91703	91710	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_014220	ATGA	2	8	91989	91996	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014220	ACCC	2	8	92111	92118	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
62	NC_014220	AAAG	2	8	92184	92191	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014220	TTTC	2	8	94800	94807	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_014220	ATTG	2	8	96073	96080	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014220	GACC	2	8	99773	99780	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_014220	TAAG	2	8	101766	101773	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014220	GCAT	2	8	104494	104501	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_014220	GTTT	2	8	104774	104781	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014220	AGGG	2	8	104993	105000	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014220	GGGA	2	8	111634	111641	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014220	TAAT	2	8	122128	122135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014220	TTAG	2	8	126671	126678	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014220	ATCA	2	8	126962	126969	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_014220	TTAC	2	8	127656	127663	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_014220	AGGA	2	8	129436	129443	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014220	AATA	2	8	131474	131481	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014220	GAGC	2	8	138414	138421	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_014220	AGGG	2	8	142144	142151	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014220	TCAA	2	8	147153	147160	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_014220	GAGG	2	8	154505	154512	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014220	GAGC	2	8	161033	161040	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_014220	CCTG	2	8	167475	167482	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_014220	AGAA	2	8	167738	167745	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014220	TTTA	2	8	168828	168835	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014220	AGGA	2	8	172336	172343	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014220	GTTG	2	8	186917	186924	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014220	TTCA	2	8	189549	189556	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_014220	AAAC	2	8	198431	198438	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_014220	ACCT	2	8	200408	200415	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
90	NC_014220	CAAT	2	8	200708	200715	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_014220	AGAT	2	8	203005	203012	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014220	CAAG	2	8	203128	203135	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_014220	GTTC	2	8	203305	203312	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
94	NC_014220	GCAG	2	8	203346	203353	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_014220	ACCT	2	8	203864	203871	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_014220	GGAC	2	8	203877	203884	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_014220	GCCC	2	8	203928	203935	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
98	NC_014220	ATGT	2	8	203983	203990	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014220	TGCA	2	8	205113	205120	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_014220	AAAC	2	8	205131	205138	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_014220	GGTA	2	8	206735	206742	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014220	CCAA	2	8	214688	214695	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_014220	CAAT	2	8	215133	215140	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_014220	GGGC	2	8	222900	222907	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
105	NC_014220	CTCC	2	8	232057	232064	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
106	NC_014220	TCCC	2	8	234561	234568	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
107	NC_014220	CCAT	2	8	234793	234800	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_014220	CCGG	2	8	235327	235334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
109	NC_014220	ACTG	2	8	240240	240247	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_014220	GCTT	2	8	241705	241712	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_014220	GACG	2	8	244199	244206	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_014220	ACCA	2	8	248101	248108	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_014220	GAGC	2	8	259350	259357	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_014220	CCTG	2	8	259448	259455	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
115	NC_014220	TAAA	2	8	270086	270093	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014220	ATCT	2	8	270171	270178	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_014220	GGAG	2	8	275907	275914	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014220	GCTC	2	8	280219	280226	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_014220	AAGG	2	8	280311	280318	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014220	TCGC	2	8	280423	280430	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_014220	CCCT	2	8	286484	286491	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
122	NC_014220	GGAT	2	8	286593	286600	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014220	GTTG	2	8	292080	292087	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014220	GTTC	2	8	292214	292221	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
125	NC_014220	GGGA	2	8	292294	292301	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014220	GAGG	2	8	294594	294601	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014220	GCCT	2	8	298202	298209	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_014220	TCCA	2	8	303838	303845	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_014220	GCCT	2	8	303902	303909	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_014220	TAAC	2	8	309857	309864	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_014220	GCCT	2	8	310573	310580	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
132	NC_014220	GGGT	2	8	312322	312329	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014220	TATG	2	8	312551	312558	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014220	AGCA	2	8	313021	313028	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_014220	GGGA	2	8	313389	313396	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014220	TTTA	2	8	315786	315793	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014220	GAGG	2	8	316047	316054	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014220	CCTG	2	8	324658	324665	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_014220	GTGC	2	8	324792	324799	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_014220	CTTT	2	8	324936	324943	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_014220	TGCG	2	8	325034	325041	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_014220	AAGC	2	8	325199	325206	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
143	NC_014220	AATT	2	8	325488	325495	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014220	GTGC	2	8	334468	334475	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
145	NC_014220	GAGG	2	8	334731	334738	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014220	GGAG	2	8	343804	343811	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014220	TATT	2	8	344664	344671	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014220	AGCC	2	8	351590	351597	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
149	NC_014220	CCAT	2	8	355219	355226	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_014220	GAAT	2	8	359616	359623	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014220	GAGG	2	8	361465	361472	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014220	GGTT	2	8	366403	366410	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014220	AGAA	2	8	371209	371216	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
154	NC_014220	GCCG	2	8	373955	373962	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
155	NC_014220	CGGT	2	8	376648	376655	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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158	NC_014220	GGTG	2	8	387811	387818	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
159	NC_014220	GGGA	2	8	389253	389260	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
160	NC_014220	GGAG	2	8	396599	396606	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
161	NC_014220	GCTC	2	8	396619	396626	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
162	NC_014220	GAGG	2	8	398857	398864	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_014220	GGGT	2	8	420330	420337	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
168	NC_014220	GCTC	2	8	423433	423440	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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173	NC_014220	AGGG	2	8	443435	443442	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
174	NC_014220	GAAA	2	8	444375	444382	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_014220	AGGG	2	8	465074	465081	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_014220	AGAC	2	8	497960	497967	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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399	NC_014220	AGGA	2	8	1091255	1091262	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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425	NC_014220	GCTC	2	8	1150492	1150499	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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427	NC_014220	CTTT	2	8	1150865	1150872	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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431	NC_014220	CTTT	2	8	1160128	1160135	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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440	NC_014220	CCTT	2	8	1184492	1184499	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
441	NC_014220	CCTG	2	8	1186562	1186569	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
442	NC_014220	AAGC	2	8	1186590	1186597	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
443	NC_014220	GGTC	2	8	1188015	1188022	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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445	NC_014220	GGCG	2	8	1188450	1188457	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
446	NC_014220	TTTC	2	8	1188648	1188655	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
447	NC_014220	CGGT	2	8	1188898	1188905	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
448	NC_014220	TTTC	2	8	1189059	1189066	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
449	NC_014220	AGGG	2	8	1191169	1191176	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
450	NC_014220	TAAT	2	8	1193672	1193679	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
451	NC_014220	TTTA	2	8	1197469	1197476	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
452	NC_014220	AAGT	2	8	1201526	1201533	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
453	NC_014220	TTTA	2	8	1209221	1209228	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_014220	GCCG	2	8	1213517	1213524	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
455	NC_014220	CAGG	2	8	1213532	1213539	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
456	NC_014220	GAAA	2	8	1213928	1213935	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
457	NC_014220	AGGA	2	8	1216813	1216820	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_014220	CATT	2	8	1227627	1227634	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
462	NC_014220	ATAC	2	8	1230772	1230779	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
463	NC_014220	TTCC	2	8	1231814	1231821	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
464	NC_014220	ATTC	2	8	1231830	1231837	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
465	NC_014220	CCCG	2	8	1235815	1235822	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
466	NC_014220	TCAA	2	8	1237726	1237733	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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468	NC_014220	CTGA	2	8	1244193	1244200	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
469	NC_014220	CGCT	2	8	1244230	1244237	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
470	NC_014220	CTAT	2	8	1247696	1247703	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
471	NC_014220	ATTA	2	8	1247723	1247730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
472	NC_014220	CTTC	2	8	1250139	1250146	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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474	NC_014220	GCCC	2	8	1254324	1254331	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
475	NC_014220	CTTT	2	8	1259505	1259512	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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482	NC_014220	TTCC	2	8	1284309	1284316	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
483	NC_014220	CAAA	2	8	1285210	1285217	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
484	NC_014220	ACCT	2	8	1286614	1286621	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
485	NC_014220	CAAA	2	8	1288911	1288918	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
486	NC_014220	TCCC	2	8	1290005	1290012	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
487	NC_014220	AGCC	2	8	1294987	1294994	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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490	NC_014220	TCCT	2	8	1301414	1301421	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
491	NC_014220	GCTG	2	8	1301450	1301457	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
492	NC_014220	ATTT	2	8	1301642	1301649	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
493	NC_014220	GAAA	2	8	1302737	1302744	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
494	NC_014220	GAGC	2	8	1303400	1303407	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
495	NC_014220	TCAT	2	8	1303827	1303834	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
496	NC_014220	CCTT	2	8	1307296	1307303	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
497	NC_014220	CCTG	2	8	1316980	1316987	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
498	NC_014220	CCCT	2	8	1323519	1323526	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
499	NC_014220	CTGC	2	8	1333406	1333413	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
500	NC_014220	TTTG	2	8	1333421	1333428	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

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